More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_1589 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009707  JJD26997_1589  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 210 aa  429  1e-119  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0417  TetR family transcriptional regulator  96.19 
 
 		 210 aa  416  9.999999999999999e-116  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.582738  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0391  TetR family transcriptional regulator  95.71 
 
 		 210 aa  413  1e-114  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.914065  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1558  transcriptional regulator, TetR family  38.19 
 
 		 208 aa  139  3.9999999999999997e-32  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1551  transcription regulator protein  36.1 
 
 		 205 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000200418  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0566  transcription regulator protein  32.52 
 
 		 207 aa  103  3e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.000000411686  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0120  transcription regulator protein  32.51 
 
 		 209 aa  91.3  8e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1641  transcriptional regulator, TetR family protein  33.8 
 
 		 145 aa  72.8  0.000000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.216203  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2443  transcriptional regulator, TetR family  25.97 
 
 		 237 aa  69.7  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0506357 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0743  TetR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 216 aa  68.9  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  25.93 
 
 		 224 aa  67  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3994  TetR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 225 aa  63.9  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0123  transcriptional regulator, TetR family  27.16 
 
 		 224 aa  63.2  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4190  transcriptional regulator, TetR family  26.16 
 
 		 200 aa  62.8  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.378174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4150  transcriptional regulator, TetR family  26.16 
 
 		 200 aa  62.8  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0533  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 208 aa  63.2  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0518509 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3113  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.527228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1313  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 203 aa  62  0.000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003358  transcriptional regulator  26.04 
 
 		 251 aa  61.2  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.433364  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1167  regulatory protein TetR  25.49 
 
 		 220 aa  61.2  0.00000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000201787  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1544  TetR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1767  TetR family transcriptional regulator  24.5 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.271955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3347  regulatory protein, TetR  24.62 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235212  normal  0.0210246 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3129  transcriptional regulator, TetR family  28.26 
 
 		 191 aa  58.9  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4265  TetR/AcrR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 228 aa  58.9  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.752062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4201  hypothetical protein  23.98 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2634  TetR family transcriptional regulator  24.27 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.001775  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5954  transcriptional regulator TetR family  27.97 
 
 		 219 aa  57  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3576  TetR-like virulence regulator  24.26 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  25.24 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2640  TetR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0747  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2610  TetR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.965658  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2654  TetR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.569555  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01892  transcription regulator protein  22 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00576188  normal  0.449964 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1119  TetR family transcriptional regulator  23.79 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0496  TetR family transcriptional regulator  23.96 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2049  TetR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 198 aa  55.5  0.0000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  21.54 
 
 		 222 aa  55.1  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  24.29 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 207 aa  54.3  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2636  transcriptional regulator, TetR family  39.47 
 
 		 198 aa  54.3  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5073  transcriptional regulator TetR family  20.5 
 
 		 227 aa  54.3  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.479761  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  28.3 
 
 		 200 aa  53.9  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3014  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 195 aa  53.9  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 205 aa  53.1  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1400  putative transcriptional regulator  26.25 
 
 		 213 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1924  TetR family transcriptional regulator  23.29 
 
 		 210 aa  53.1  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.343626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1447  TetR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 214 aa  53.1  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.268108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3915  transcriptional regulator, TetR family  23.93 
 
 		 215 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16280  putative transcriptional regulator  28.57 
 
 		 213 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.450776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 244 aa  52.8  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2986  TetR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 216 aa  52.4  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.741715  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1391  transcriptional regulator, TetR family  23.39 
 
 		 208 aa  52.4  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3130  TetR family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 216 aa  52  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2972  TetR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 216 aa  52  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419953  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1515  TetR family transcriptional regulator  22.71 
 
 		 213 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4478  transcriptional regulator, TetR family  25.62 
 
 		 211 aa  51.6  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4208  TetR family transcriptional regulator  22.33 
 
 		 213 aa  51.6  0.000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.826614 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5392  transcriptional regulator, TetR family protein  35.92 
 
 		 190 aa  51.6  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1553  regulatory protein, TetR  26.42 
 
 		 234 aa  51.6  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0252  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 201 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00323074 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 206 aa  50.8  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4103  TetR family transcriptional regulator  22.6 
 
 		 209 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2432  transcriptional regulator, TetR family  27.36 
 
 		 220 aa  50.4  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0652024 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0199  TetR family regulatory protein  26.28 
 
 		 214 aa  50.8  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1709  transcriptional regulator, TetR family  26.24 
 
 		 203 aa  50.4  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.922562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7041  TetR family transcriptional regulator  21.95 
 
 		 224 aa  50.4  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.971453 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1247  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1297  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 206 aa  50.8  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00583227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4091  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 222 aa  50.4  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0267897 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0304  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 201 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.826155  hitchhiker  0.000375508 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2027  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 208 aa  49.7  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.835752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2156  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 211 aa  49.7  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000133556 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2782  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 201 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.522237  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4501  putative transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 198 aa  50.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.749355 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0243  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 201 aa  49.7  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0324  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 201 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  20 
 
 		 207 aa  50.1  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1276  transcriptional regulator, TetR family  24.53 
 
 		 214 aa  49.7  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8304  transcriptional regulator, TetR family  26.89 
 
 		 223 aa  49.3  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.505381  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0602  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 205 aa  49.3  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5525  normal  0.406937 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1636  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 226 aa  49.7  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1443  transcriptional regulator, TetR family  28.21 
 
 		 204 aa  49.3  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.79888  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  34.85 
 
 		 220 aa  49.7  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0949  transcriptional regulator, TetR family  36.99 
 
 		 286 aa  49.3  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2732  transcriptional regulator, TetR family  25.34 
 
 		 208 aa  49.3  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.498805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1138  TetR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 228 aa  48.9  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3341  transcriptional regulator, TetR family  22.44 
 
 		 226 aa  49.3  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  38.57 
 
 		 291 aa  49.3  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02619  transcriptional regulator  22.33 
 
 		 217 aa  48.9  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 212 aa  48.9  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2103  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 207 aa  48.5  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1327  TetR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 211 aa  48.5  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000128792 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1972  transcriptional regulator, TetR family  30.49 
 
 		 211 aa  48.5  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.134426  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4873  transcriptional regulator, TetR family  25.61 
 
 		 193 aa  48.9  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  23.23 
 
 		 207 aa  48.5  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>