81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3845 on replicon NC_010580
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



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Alignment on homolog gene
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E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010580  Bind_3845  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 193 aa  402  1e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2272  TetR family transcriptional regulator  51.81 
 
 		 194 aa  203  1e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1648  hypothetical protein  47.37 
 
 		 211 aa  191  6e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.273732 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1649  TetR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 192 aa  147  8e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.279043 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2270  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 189 aa  132  1.9999999999999998e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3052  TetR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 183 aa  95.9  3e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.186092 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48190  putative transcriptional regulator  24.12 
 
 		 186 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0114913  normal  0.0538885 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0676  TetR family transcriptional regulator  24.19 
 
 		 191 aa  61.6  0.000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.49013  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3212  transcriptional regulator, TetR family  26.09 
 
 		 188 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0955  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 194 aa  58.5  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0897  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 194 aa  58.5  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2134  transcriptional regulator, TetR family  24.44 
 
 		 186 aa  57.8  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0795  TetR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00985009  normal  0.205797 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2970  TetR family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 194 aa  57  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0856  TetR family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.257581  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2926  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.529467  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3236  transcriptional regulator, TetR family  26.09 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0469246  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2044  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.505226  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0770  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3228  TetR family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00722998  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3194  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 188 aa  55.1  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3291  TetR family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0803  TetR family transcriptional regulator  24.42 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2215  TetR family transcriptional regulator  23.7 
 
 		 215 aa  54.7  0.0000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 		 291 aa  53.1  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0436  TetR/AcrR family transcriptional regulator  23.6 
 
 		 193 aa  52.8  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00014648  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1949  hypothetical protein  23.49 
 
 		 186 aa  52.4  0.000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2105  putative transcriptional regulator  27.84 
 
 		 185 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3088  transcriptional regulator of TetR family protein  22.89 
 
 		 198 aa  52  0.000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.119848 
 
 
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NC_010814  Glov_0127  transcriptional regulator, TetR family  23.26 
 
 		 193 aa  52  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24840  putative transcriptional regulator  26.63 
 
 		 185 aa  51.2  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1938  hypothetical protein  23.49 
 
 		 186 aa  51.2  0.000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3375  TetR family transcriptional regulator  24.12 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011369  Rleg2_0913  transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 		 186 aa  50.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.457382 
 
 
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NC_013421  Pecwa_1371  transcriptional regulator, TetR family  27.37 
 
 		 189 aa  50.1  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.91689  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3097  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 189 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.127725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 201 aa  48.1  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4749  TetR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 207 aa  47.8  0.00009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.590058  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1255  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 200 aa  47.4  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C37  transcriptional regulator  22.67 
 
 		 191 aa  47.8  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1689  transcriptional regulator, TetR family  21.76 
 
 		 199 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.403978 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2003  transcriptional regulator, TetR family  26.86 
 
 		 189 aa  47  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34730  transcriptional regulator, TetR family  23.19 
 
 		 192 aa  46.6  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.169686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4533  transcriptional regulator, TetR family  25.31 
 
 		 198 aa  46.6  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0169871 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1940  TetR family transcriptional regulator  23.66 
 
 		 198 aa  45.8  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.688335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0051  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 192 aa  46.6  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0191549  normal  0.55733 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1146  TetR family transcriptional regulator  23.83 
 
 		 194 aa  45.8  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1527  TetR family transcriptional regulator  22.87 
 
 		 212 aa  45.8  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2237  TetR family transcriptional regulator  24.18 
 
 		 228 aa  45.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2384  TetR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 187 aa  45.1  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1060  transcriptional regulator, TetR family  24.84 
 
 		 186 aa  45.4  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0130577  normal  1 
 
 
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NC_007963  Csal_0041  TetR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 175 aa  45.1  0.0006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2750  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 205 aa  45.1  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.172363  normal  0.153941 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3548  TetR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 216 aa  44.7  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7842  TetR family transcriptional regulator  21.43 
 
 		 182 aa  43.9  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.341573  normal  0.515425 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4264  TetR family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 181 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1582  transcriptional regulator, TetR family  24.44 
 
 		 194 aa  44.3  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000313158  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3418  transcriptional regulator protein  25.45 
 
 		 193 aa  44.3  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_4341  putative transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 210 aa  43.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.13823  normal  0.831003 
 
 
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NC_007492  Pfl01_2877  TetR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 188 aa  43.5  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.477107  normal  0.116943 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2902  TetR family transcriptional regulator  20.37 
 
 		 187 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.465511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2110  transcriptional regulator, TetR family  25.42 
 
 		 200 aa  43.5  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0942807  normal  0.362877 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4537  transcriptional regulator, TetR family  25.55 
 
 		 197 aa  43.9  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.340013  normal  0.0119033 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5318  transcriptional regulator, TetR family  29.36 
 
 		 197 aa  42.7  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 216 aa  43.1  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0949  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 286 aa  43.1  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0627  transcriptional regulator, TetR family  27.03 
 
 		 191 aa  42.7  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2114  transcriptional regulator, TetR family  22.87 
 
 		 193 aa  42  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1967  TetR family transcriptional regulator  21.67 
 
 		 202 aa  42  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 238 aa  42.4  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0059  transcriptional regulator, TetR family  27.45 
 
 		 194 aa  42.4  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00007304  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1709  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 224 aa  42  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.400859  normal  0.0301663 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 217 aa  42  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1025  transcriptional regulator, TetR family  24.73 
 
 		 192 aa  42  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1944  transcriptional regulator, TetR family  35.96 
 
 		 205 aa  42  0.006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00538978  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  33.82 
 
 		 222 aa  42  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003358  transcriptional regulator  36.21 
 
 		 251 aa  41.2  0.008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.433364  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5637  TetR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 220 aa  41.6  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.766944 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4792  TetR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 184 aa  41.2  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.165855  normal  0.419651 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5615  transcriptional regulator, TetR family  34.85 
 
 		 206 aa  41.2  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.328639  normal  0.169387 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0929  TetR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 205 aa  41.2  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.99421  normal  1 
 
 
-
 
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