44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_0546 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_0546  regulatory protein TetR  100 
 
 		 188 aa  373  1e-103  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3254  putative transcriptional regulator  64.36 
 
 		 194 aa  204  7e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.902087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1477  TetR family transcriptional regulator  56.68 
 
 		 191 aa  183  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0242  regulatory protein, TetR  51.1 
 
 		 188 aa  177  1e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4942  TetR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 191 aa  169  3e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.261709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0069  putative transcriptional regulator  50.28 
 
 		 202 aa  167  1e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.494217  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1241  regulatory protein TetR  54.95 
 
 		 193 aa  163  2.0000000000000002e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0907421  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3261  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 208 aa  143  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0526  regulatory protein TetR  46.41 
 
 		 198 aa  139  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3165  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 243 aa  131  5e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33620  transcriptional regulator, tetR family  47.4 
 
 		 195 aa  123  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.807824 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1590  TetR family transcriptional regulator  23.76 
 
 		 192 aa  61.6  0.000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3794  putative TetR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1374  transcriptional regulator, TetR family  28.21 
 
 		 225 aa  50.4  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.181966  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 205 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 205 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 215 aa  48.1  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2556  transcriptional regulator, TetR family  27.82 
 
 		 208 aa  48.1  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000489141  normal  0.182844 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4711  TetR family transcriptional regulator  23.66 
 
 		 228 aa  47.8  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.133874 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1483  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 197 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2516  TetR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 204 aa  45.4  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  23.75 
 
 		 240 aa  44.7  0.0007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 207 aa  44.7  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2332  transcriptional regulator, TetR family  23.6 
 
 		 193 aa  44.7  0.0009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.950158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7816  transcriptional regulator, TetR family  29.23 
 
 		 216 aa  43.9  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0987  regulatory protein TetR  34.26 
 
 		 192 aa  44.3  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.383045  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3779  transcriptional regulator, TetR family  27.97 
 
 		 194 aa  43.9  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0737  transcriptional regulator, TetR family  31.08 
 
 		 209 aa  43.5  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 212 aa  43.5  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 226 aa  42.7  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3449  TetR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 209 aa  42.4  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3176  transcriptional regulator, TetR family  40.35 
 
 		 193 aa  42  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199059 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0665  transcriptional regulator, TetR family  28.25 
 
 		 195 aa  42  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11957  normal  0.196161 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1142  transcriptional regulator, TetR family  24.82 
 
 		 202 aa  41.6  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.180703  normal  0.158777 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0786  transcriptional regulator, TetR family  23.49 
 
 		 202 aa  41.6  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.536081  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1477  TetR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 238 aa  41.6  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0612  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 202 aa  41.6  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0141452  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0153  TetR family transcriptional regulator  24.47 
 
 		 210 aa  41.2  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2177  transcriptional regulator, TetR family  38.18 
 
 		 210 aa  41.2  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.480454  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01665  transcriptional regulator  29.69 
 
 		 202 aa  41.2  0.009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.152407  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  25.75 
 
 		 208 aa  41.2  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1502  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 235 aa  41.2  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1480  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 235 aa  41.2  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>