33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3254 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3254  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 194 aa  380  1e-105  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.902087  normal  1 
 
 
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NC_013739  Cwoe_0546  regulatory protein TetR  64.36 
 
 		 188 aa  220  9e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1477  TetR family transcriptional regulator  56.18 
 
 		 191 aa  175  4e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008699  Noca_0242  regulatory protein, TetR  47.89 
 
 		 188 aa  166  2e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009338  Mflv_4942  TetR family transcriptional regulator  56.04 
 
 		 191 aa  164  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.261709  normal  1 
 
 
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NC_007333  Tfu_0069  putative transcriptional regulator  51.4 
 
 		 202 aa  163  1.0000000000000001e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.494217  n/a   
 
 
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NC_013441  Gbro_1241  regulatory protein TetR  54.44 
 
 		 193 aa  152  2.9999999999999998e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0907421  n/a   
 
 
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NC_009921  Franean1_3261  TetR family transcriptional regulator  41.81 
 
 		 208 aa  144  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013093  Amir_0526  regulatory protein TetR  46.45 
 
 		 198 aa  128  6e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009921  Franean1_3165  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 243 aa  127  8.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15717  normal  1 
 
 
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NC_013159  Svir_33620  transcriptional regulator, tetR family  46.1 
 
 		 195 aa  118  4.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.807824 
 
 
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NC_007974  Rmet_3794  putative TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 200 aa  68.9  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009253  Dred_1590  TetR family transcriptional regulator  22.65 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013132  Cpin_1142  transcriptional regulator, TetR family  27.74 
 
 		 202 aa  53.5  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.180703  normal  0.158777 
 
 
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NC_007948  Bpro_1669  TetR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 235 aa  50.1  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010524  Lcho_2436  TetR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 243 aa  48.1  0.00009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.747053 
 
 
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NC_012848  Rleg_5086  transcriptional regulator, TetR family  25.64 
 
 		 210 aa  47.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423561  normal  0.0707297 
 
 
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NC_013730  Slin_5507  transcriptional regulator, TetR family  25.17 
 
 		 219 aa  45.8  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011368  Rleg2_5366  transcriptional regulator, TetR family  26.54 
 
 		 210 aa  45.8  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00158369  normal  0.823764 
 
 
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NC_011992  Dtpsy_1838  transcriptional regulator, TetR family  31.06 
 
 		 221 aa  45.1  0.0006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.834516  n/a   
 
 
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NC_008782  Ajs_2029  TetR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 220 aa  43.9  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107784  normal  1 
 
 
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NC_008390  Bamb_2431  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 204 aa  43.9  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.547738  n/a   
 
 
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NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 208 aa  43.5  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
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NC_003909  BCE_3313  TetR family transcriptional regulator  21.05 
 
 		 185 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.212765  n/a   
 
 
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NC_008752  Aave_2815  TetR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 242 aa  42.7  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.623336 
 
 
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NC_011658  BCAH187_A3324  transcriptional regulator, TetR family  21.64 
 
 		 185 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013159  Svir_24200  transcriptional regulator, tetR family  37.33 
 
 		 204 aa  42.4  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.130166  normal  0.0410828 
 
 
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NC_010551  BamMC406_2295  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 204 aa  42.7  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 226 aa  42.4  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
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NC_011830  Dhaf_3234  transcriptional regulator, TetR family  27.49 
 
 		 191 aa  42.4  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  24.06 
 
 		 228 aa  41.2  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  25.4 
 
 		 200 aa  41.2  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013517  Sterm_1710  transcriptional regulator, TetR family  21.71 
 
 		 200 aa  41.2  0.01  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
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