62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_33620 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_33620  transcriptional regulator, tetR family  100 
 
 		 195 aa  381  1e-105  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.807824 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0526  regulatory protein TetR  62.16 
 
 		 198 aa  197  1.0000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1241  regulatory protein TetR  48.63 
 
 		 193 aa  149  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0907421  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0546  regulatory protein TetR  48.07 
 
 		 188 aa  149  3e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3165  TetR family transcriptional regulator  46.2 
 
 		 243 aa  147  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3261  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 208 aa  141  5e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0069  putative transcriptional regulator  45.99 
 
 		 202 aa  138  4.999999999999999e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.494217  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0242  regulatory protein, TetR  43.39 
 
 		 188 aa  135  3.0000000000000003e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1477  TetR family transcriptional regulator  45.36 
 
 		 191 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3254  putative transcriptional regulator  47.31 
 
 		 194 aa  132  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.902087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4942  TetR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 191 aa  132  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.261709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5507  transcriptional regulator, TetR family  24.58 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3794  putative TetR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3195  transcriptional regulator, TetR family  27.92 
 
 		 200 aa  53.9  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2556  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 208 aa  52.4  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000489141  normal  0.182844 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 240 aa  50.8  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0170  transcriptional regulator, TetR family  29.66 
 
 		 201 aa  49.7  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.307357  hitchhiker  0.00190078 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 212 aa  49.3  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 212 aa  49.3  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1276  transcriptional regulator, TetR family  36.59 
 
 		 214 aa  47.4  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  26.12 
 
 		 222 aa  46.2  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2174  transcriptional regulator, TetR family  27.56 
 
 		 206 aa  45.8  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  31.33 
 
 		 221 aa  45.8  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 228 aa  44.7  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2775  TetR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 228 aa  44.7  0.0008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0212844  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  25.55 
 
 		 206 aa  43.9  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0987  regulatory protein TetR  37.93 
 
 		 192 aa  44.3  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.383045  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 		 216 aa  44.7  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5077  transcriptional regulator, TetR family  40.3 
 
 		 212 aa  44.7  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2475  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 222 aa  44.3  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.260568  hitchhiker  0.0024636 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 206 aa  44.3  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27670  transcriptional regulator  34.43 
 
 		 254 aa  43.9  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.208365 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10053  putative TetR transcriptional regulator  26.05 
 
 		 194 aa  43.5  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.205087  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1967  TetR family transcriptional regulator  21.2 
 
 		 202 aa  43.9  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 207 aa  43.9  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0760  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 192 aa  43.9  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0913287  normal  0.16222 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6295  transcriptional regulator, TetR family  26.03 
 
 		 212 aa  43.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1866  TetR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 201 aa  42.7  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.115406 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0882  transcriptional regulator, TetR family  27.37 
 
 		 233 aa  42.7  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 256 aa  43.1  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1142  transcriptional regulator, TetR family  24.81 
 
 		 202 aa  43.1  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.180703  normal  0.158777 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7816  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 216 aa  42.7  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1087  TetR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 222 aa  42.4  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00014413  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1242  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 212 aa  42.7  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000053734  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2798  TetR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 251 aa  42.4  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.358212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3113  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 214 aa  42.4  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.527228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1098  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 209 aa  42.4  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0976848 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1869  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 215 aa  42.4  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0737  transcriptional regulator, TetR family  33.68 
 
 		 209 aa  42.4  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 231 aa  42  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2815  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 242 aa  42  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  28.04 
 
 		 206 aa  42  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 208 aa  42  0.006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3137  transcriptional regulator, TetR family  29.13 
 
 		 197 aa  41.6  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 208 aa  41.6  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3604  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 207 aa  41.6  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.461648 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  28.48 
 
 		 211 aa  41.6  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2785  TetR family transcriptional regulator  23.89 
 
 		 196 aa  41.6  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.256269 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1776  transcriptional regulator, TetR family  30.67 
 
 		 218 aa  41.6  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0293549  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  23.87 
 
 		 212 aa  41.6  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0268  TetR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 202 aa  41.2  0.009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 203 aa  41.2  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>