44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0526 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0526  regulatory protein TetR  100 
 
 		 198 aa  389  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33620  transcriptional regulator, tetR family  61.27 
 
 		 195 aa  178  4.999999999999999e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.807824 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0546  regulatory protein TetR  46.41 
 
 		 188 aa  153  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3165  TetR family transcriptional regulator  44.63 
 
 		 243 aa  151  5e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3261  TetR family transcriptional regulator  44.13 
 
 		 208 aa  147  8e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1477  TetR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 191 aa  143  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0069  putative transcriptional regulator  43.92 
 
 		 202 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.494217  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0242  regulatory protein, TetR  43.17 
 
 		 188 aa  136  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4942  TetR family transcriptional regulator  43.72 
 
 		 191 aa  135  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.261709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3254  putative transcriptional regulator  46.24 
 
 		 194 aa  136  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.902087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1241  regulatory protein TetR  44.26 
 
 		 193 aa  129  3e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0907421  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1590  TetR family transcriptional regulator  24.12 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3794  putative TetR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3486  TetR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 186 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.500093  normal  0.130277 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3423  TetR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 186 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.620682  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 208 aa  50.8  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3434  TetR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 186 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.746162  normal  0.0922012 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3313  TetR family transcriptional regulator  22.81 
 
 		 185 aa  48.5  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.212765  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3326  transcriptional regulator, TetR family  22.29 
 
 		 185 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3108  TetR family transcriptional regulator  22.29 
 
 		 185 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3354  TetR family transcriptional regulator  22.29 
 
 		 185 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3324  transcriptional regulator, TetR family  22.29 
 
 		 185 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1776  transcriptional regulator, TetR family  35.56 
 
 		 218 aa  45.4  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0293549  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2556  transcriptional regulator, TetR family  27.08 
 
 		 208 aa  45.4  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000489141  normal  0.182844 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 228 aa  45.1  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1694  TetR family transcriptional regulator  24.43 
 
 		 219 aa  43.9  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0960426 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0891  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 227 aa  43.9  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.735718  normal  0.888939 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1142  transcriptional regulator, TetR family  25.56 
 
 		 202 aa  43.9  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.180703  normal  0.158777 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0707  transcriptional regulator, TetR family  23.53 
 
 		 226 aa  43.5  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.136091  normal  0.663609 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1531  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 227 aa  42.7  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.357864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1669  TetR family transcriptional regulator  22.95 
 
 		 235 aa  43.1  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1477  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 238 aa  42.4  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1550  transcriptional regulator, TetR family  26.95 
 
 		 201 aa  42.4  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 203 aa  42.4  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4711  TetR family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 228 aa  42.4  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.133874 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3894  regulatory protein TetR  27.27 
 
 		 206 aa  42  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3094  TetR family transcriptional regulator  21.14 
 
 		 185 aa  42  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.432559  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6229  transcriptional regulator TetR family  27.33 
 
 		 240 aa  42  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.93873  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1913  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 226 aa  42  0.006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000580043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4925  TetR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 228 aa  42  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.791426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  25.65 
 
 		 194 aa  41.6  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2606  transcriptional regulator, TetR family  28.87 
 
 		 218 aa  42  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193859  normal  0.0512709 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 240 aa  41.6  0.008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5507  transcriptional regulator, TetR family  24.11 
 
 		 219 aa  41.2  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>