50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0707 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0707  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 226 aa  466  9.999999999999999e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.136091  normal  0.663609 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3994  transcriptional regulator, TetR family  45.96 
 
 		 238 aa  213  1.9999999999999998e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.759963  hitchhiker  0.00000452981 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06485  hypothetical protein  41.12 
 
 		 228 aa  178  7e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1858  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 234 aa  49.7  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.543066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0807  TetR family transcriptional regulator  27 
 
 		 211 aa  48.5  0.00009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.271007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 257 aa  47.8  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3885  TetR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 242 aa  46.2  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5366  transcriptional regulator, TetR family  25.69 
 
 		 210 aa  46.2  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00158369  normal  0.823764 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0501  nucleoid occlusion protein  25.27 
 
 		 220 aa  44.3  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.957497  normal  0.22516 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  26.47 
 
 		 195 aa  44.7  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0258  TetR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 202 aa  45.1  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.569121  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01665  transcriptional regulator  27.71 
 
 		 202 aa  44.7  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.152407  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4589  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 248 aa  44.3  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.954889 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0754  TetR family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 273 aa  44.3  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3465  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 248 aa  43.5  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.980317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17960  transcriptional regulator, TetR family  31.65 
 
 		 208 aa  43.9  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.134645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1394  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 185 aa  43.1  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.546688  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0526  regulatory protein TetR  23.53 
 
 		 198 aa  43.5  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1334  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 241 aa  43.5  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6530  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 219 aa  42.7  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.051486 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1166  transcriptional regulator, TetR family  36.54 
 
 		 215 aa  42.7  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.522591  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0961  TetR family transcriptional regulator  22.41 
 
 		 218 aa  42.7  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1513  transcriptional regulator BetI  25.61 
 
 		 198 aa  42.7  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0564912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05370  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 205 aa  42.7  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000643211  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5122  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 240 aa  42.4  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.243003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3965  transcriptional regulator, TetR family  25.52 
 
 		 208 aa  42.4  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0946  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 258 aa  42.4  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.806854  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0242  regulatory protein, TetR  26.67 
 
 		 188 aa  42.4  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0472  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 254 aa  42  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  25.32 
 
 		 194 aa  42  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1609  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 254 aa  42  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1961  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 254 aa  42  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.140222  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2057  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 254 aa  42  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.649855  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0655  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 254 aa  42  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.64003  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0543  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 254 aa  42  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.387034  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0801  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 254 aa  42  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5734  transcriptional regulator, TetR family  25.71 
 
 		 199 aa  42  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.801726 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001979  transcriptional regulator TetR family  35.71 
 
 		 193 aa  42  0.008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.507988  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1382  transcriptional regulator, TetR family  35.42 
 
 		 217 aa  42  0.008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3682  TetR family transcriptional regulator  24.43 
 
 		 540 aa  42  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0191871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0543  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 203 aa  42  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.889127 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5031  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 248 aa  42  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5241  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 248 aa  42  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.927318 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3126  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 248 aa  42  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.068587  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3455  regulatory protein TetR  44.9 
 
 		 196 aa  42  0.009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.336833  normal  0.0784455 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0764  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 203 aa  41.6  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0005262  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1281  TetR family transcriptional regulator  24.07 
 
 		 210 aa  41.6  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.781108  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2646  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 236 aa  42  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00299352  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0665  transcriptional regulator, TetR family  31.34 
 
 		 195 aa  41.6  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11957  normal  0.196161 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0422  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 248 aa  41.6  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>