33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0242 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0242  regulatory protein, TetR  100 
 
 		 188 aa  360  5.0000000000000005e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0069  putative transcriptional regulator  63.64 
 
 		 202 aa  209  2e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.494217  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0546  regulatory protein TetR  51.1 
 
 		 188 aa  177  1e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1477  TetR family transcriptional regulator  52.51 
 
 		 191 aa  160  7e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1241  regulatory protein TetR  50.84 
 
 		 193 aa  160  1e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0907421  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4942  TetR family transcriptional regulator  51.41 
 
 		 191 aa  151  5e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.261709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3254  putative transcriptional regulator  47.65 
 
 		 194 aa  147  6e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.902087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3261  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 208 aa  139  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0526  regulatory protein TetR  43.17 
 
 		 198 aa  125  5e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3165  TetR family transcriptional regulator  35.52 
 
 		 243 aa  121  6e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33620  transcriptional regulator, tetR family  40.52 
 
 		 195 aa  106  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.807824 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1590  TetR family transcriptional regulator  22.4 
 
 		 192 aa  67  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3794  putative TetR family transcriptional regulator  24.29 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 217 aa  50.4  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4711  TetR family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 228 aa  49.7  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.133874 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2556  transcriptional regulator, TetR family  27.21 
 
 		 208 aa  48.1  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000489141  normal  0.182844 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01975  hypothetical protein  26.06 
 
 		 204 aa  45.1  0.0006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.10817  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3326  transcriptional regulator, TetR family  18.92 
 
 		 185 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2789  transcriptional regulator, TetR family  30.26 
 
 		 192 aa  43.5  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05540  transcriptional regulator  32.21 
 
 		 197 aa  43.5  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1929  TetR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 206 aa  43.1  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3313  TetR family transcriptional regulator  18.48 
 
 		 185 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.212765  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4182  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 201 aa  42.4  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.368627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0707  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 226 aa  42.4  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.136091  normal  0.663609 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3656  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 207 aa  42  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.311417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3324  transcriptional regulator, TetR family  18.92 
 
 		 185 aa  42  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3354  TetR family transcriptional regulator  18.92 
 
 		 185 aa  42  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3108  TetR family transcriptional regulator  18.92 
 
 		 185 aa  42  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 205 aa  41.6  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 205 aa  41.6  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2816  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 192 aa  41.2  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 215 aa  41.2  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0420  TetR family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 215 aa  41.2  0.01  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>