35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2383 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2383  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 193 aa  370  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1759  TetR family transcriptional regulator  56.54 
 
 		 199 aa  195  4.0000000000000005e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2870  transcriptional regulator, TetR family  54.74 
 
 		 197 aa  182  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0570859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5337  putative transcriptional regulator, TetR family  55.38 
 
 		 215 aa  182  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4140  TetR family transcriptional regulator  54.97 
 
 		 200 aa  177  8e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5295  transcriptional regulator, TetR family  53.65 
 
 		 189 aa  171  7.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2164  transcriptional regulator, TetR family  56.15 
 
 		 199 aa  166  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.652576  normal  0.0672199 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4093  transcriptional regulator, TetR family  44.5 
 
 		 200 aa  105  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.370117  normal  0.493128 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5342  putative transcriptional regulator, TetR family  37.56 
 
 		 198 aa  93.6  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.744613 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2536  putative transcriptional regulator, TetR family  36.59 
 
 		 215 aa  63.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1972  transcriptional regulator, TetR family  35.47 
 
 		 203 aa  51.6  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000120212  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5896  transcriptional regulator  41.86 
 
 		 199 aa  51.2  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.371414  normal  0.0197091 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3407  transcriptional regulator, TetR family  46.27 
 
 		 178 aa  50.1  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38620  hypothetical protein  33.85 
 
 		 186 aa  47  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001979  transcriptional regulator TetR family  36.07 
 
 		 193 aa  46.2  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.507988  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00482  NADH dehydrogenase  34.29 
 
 		 194 aa  46.2  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0439  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 180 aa  44.3  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0161  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 206 aa  43.9  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1856  transcriptional regulator, TetR family  48.98 
 
 		 222 aa  43.1  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.906441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3267  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 188 aa  43.5  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1926  TetR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 224 aa  43.5  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2604  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 195 aa  43.1  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  42.11 
 
 		 196 aa  42.4  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4820  transcriptional regulator, TetR family  36.96 
 
 		 203 aa  42  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1035  TetR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 214 aa  42  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4211  transcriptional regulator, TetR family  39.62 
 
 		 178 aa  42  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.954356 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 230 aa  42  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0679  TetR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 207 aa  41.6  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0890735  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1897  transcriptional regulator, TetR family  42.37 
 
 		 200 aa  42  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0417503  decreased coverage  0.000000883258 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4148  TetR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 213 aa  41.6  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.677229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3229  putative transcriptional regulator, TetR family  29.82 
 
 		 206 aa  41.6  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.446849 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2205  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 202 aa  41.2  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.270822 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5494  transcriptional regulator, TetR family  43.14 
 
 		 141 aa  41.2  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.769028  normal  0.39499 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1025  TetR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 214 aa  41.2  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.589531  normal  0.553747 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1008  TetR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 214 aa  41.2  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.535946  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>