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for query gene Smon_0469 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_0469  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 224 aa  440  1e-123  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_013517  Sterm_1582  transcriptional regulator, TetR family  40.67 
 
 		 194 aa  157  1e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000313158  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0208  TetR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 191 aa  80.1  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3038  transcriptional regulator, TetR family  25.69 
 
 		 209 aa  75.5  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1025  transcriptional regulator, TetR family  24.06 
 
 		 192 aa  73.2  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3088  transcriptional regulator of TetR family protein  24.77 
 
 		 198 aa  71.2  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.119848 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0803  TetR family transcriptional regulator  24.02 
 
 		 196 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1967  TetR family transcriptional regulator  25.11 
 
 		 202 aa  70.9  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02185  transcriptional regulator  26.89 
 
 		 196 aa  67.4  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.69519  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0770  TetR family transcriptional regulator  23.56 
 
 		 196 aa  66.2  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2644  putative transcriptional regulator, TetR family  42.19 
 
 		 205 aa  65.9  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0480  transcriptional regulator, TetR family  24.19 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.318214 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0971  TetR family transcriptional regulator  23 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.325702 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2215  TetR family transcriptional regulator  23.3 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C37  transcriptional regulator  28.22 
 
 		 191 aa  63.5  0.000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0127  transcriptional regulator, TetR family  22.22 
 
 		 193 aa  62  0.000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0316  TetR family transcriptional regulator  22.73 
 
 		 176 aa  62  0.000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3438  transcriptional regulator, TetR family  41.33 
 
 		 190 aa  61.6  0.000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.547681  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3952  TetR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 291 aa  62  0.000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3566  transcriptional regulator, TetR family  20.66 
 
 		 225 aa  61.6  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 		 307 aa  60.8  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 193 aa  61.2  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1940  TetR family transcriptional regulator  20.81 
 
 		 198 aa  60.8  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.688335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5228  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 290 aa  60.5  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4870  TetR family transcriptional regulator  23.56 
 
 		 186 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.318456  normal  1 
 
 
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NC_008543  Bcen2424_5400  TetR family transcriptional regulator  23.56 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00236367 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1674  transcriptional regulator, TetR family  22.17 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4102  TetR family transcriptional regulator  23.04 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.680562  normal  1 
 
 
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NC_008061  Bcen_5462  TetR family transcriptional regulator  23.56 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1305  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 181 aa  59.7  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0436  TetR/AcrR family transcriptional regulator  22.47 
 
 		 193 aa  60.1  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00014648  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1924  TetR family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.147097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2558  TetR family transcriptional regulator  23.22 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  28.48 
 
 		 291 aa  58.5  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5615  transcriptional regulator, TetR family  43.55 
 
 		 291 aa  58.5  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5567  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 290 aa  58.5  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5288  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 290 aa  58.5  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5529  transcriptional regulator, TetR family  43.55 
 
 		 290 aa  58.5  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5130  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 290 aa  58.5  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5685  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 290 aa  58.5  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5113  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 290 aa  58.2  0.00000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 310 aa  58.2  0.00000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012856  Rpic12D_0117  transcriptional regulator, TetR family  47.17 
 
 		 225 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.678219 
 
 
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NC_010682  Rpic_0110  transcriptional regulator, TetR family  47.17 
 
 		 225 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009634  Mevan_1668  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008554  Sfum_3689  TetR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010552  BamMC406_4292  TetR family transcriptional regulator  23.58 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_4476  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000182515 
 
 
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NC_008048  Sala_0268  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.329049 
 
 
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NC_010086  Bmul_4221  TetR family transcriptional regulator  23.72 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.360052  normal  1 
 
 
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NC_007005  Psyr_2933  regulatory protein, TetR  44.23 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.316351  normal  1 
 
 
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NC_009953  Sare_1416  TetR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.305494  hitchhiker  0.0000141576 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0083  TetR family transcriptional regulator  22.66 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.201393  normal  1 
 
 
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NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5089  transcriptional regulator, TetR family  21.36 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0809  transcriptional regulator, TetR family  21.08 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007493  RSP_1435  TetR family regulatory protein  22.66 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5390  transcriptional regulator, TetR family  43.55 
 
 		 291 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.787919  normal  1 
 
 
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NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  39.71 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4743  TetR family transcriptional regulator  24.48 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0848  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000568716  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3409  TetR family transcriptional regulator  20.09 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5288  TetR family transcriptional regulator  24.48 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5559  transcriptional regulator, TetR family  43.55 
 
 		 289 aa  55.5  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  42.59 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1527  TetR family transcriptional regulator  21.35 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0251  TetR family transcriptional regulator  21.21 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1100  TetR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0335  transcriptional regulator, TetR family  20.89 
 
 		 197 aa  54.7  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  0.0355079 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1689  transcriptional regulator, TetR family  21.65 
 
 		 199 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.403978 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1145  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 224 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0293  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 226 aa  54.7  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2924  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 224 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.288766  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2768  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 224 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.379756  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4778  transcriptional regulator, TetR family  20 
 
 		 227 aa  53.5  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0545614  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1114  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 223 aa  53.5  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0503  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 193 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 209 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 184 aa  53.9  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1467  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 192 aa  54.3  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.861342  normal  0.113855 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4813  TetR family transcriptional regulator  20.95 
 
 		 223 aa  53.9  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2047  transcriptional regulator, TetR family  27.59 
 
 		 188 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.199455 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2200  transcriptional regulator, TetR family  27.55 
 
 		 203 aa  53.9  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2734  transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 		 225 aa  54.3  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010086  Bmul_3357  TetR family transcriptional regulator  20.09 
 
 		 211 aa  54.3  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0594456 
 
 
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NC_007974  Rmet_4482  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 197 aa  53.9  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.14402  normal  0.0182705 
 
 
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NC_011658  BCAH187_A0503  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 193 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011725  BCB4264_A0455  transcriptional regulator, TetR family  35.82 
 
 		 193 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0937341  n/a   
 
 
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NC_012791  Vapar_1240  transcriptional regulator, TetR family  21.05 
 
 		 211 aa  54.3  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.567777  n/a   
 
 
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NC_009380  Strop_4358  regulatory protein, TetR  21.43 
 
 		 220 aa  53.5  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009441  Fjoh_2965  TetR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 175 aa  53.5  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_005945  BAS0897  TetR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 194 aa  53.1  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 211 aa  53.5  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
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NC_007404  Tbd_1255  TetR family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 200 aa  53.5  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007511  Bcep18194_B1606  TetR family transcriptional regulator  23.11 
 
 		 206 aa  53.5  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0686792  normal  0.0717181 
 
 
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NC_007530  GBAA_0955  TetR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 194 aa  53.1  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 211 aa  53.5  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
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