197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0589 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_0589  nucleoid occlusion protein  100 
 
 
214 aa  430  1e-120  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.45381  normal  0.299357 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0569  nucleoid occlusion protein  99.07 
 
 
214 aa  426  1e-118  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0777  nucleoid occlusion protein  76.8 
 
 
217 aa  301  5.000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4136  nucleoid occlusion protein  78.97 
 
 
224 aa  301  7.000000000000001e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.925695  hitchhiker  0.00000191569 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1324  nucleoid occlusion protein  72 
 
 
231 aa  289  2e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.892359 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3521  nucleoid occlusion protein  61.02 
 
 
240 aa  277  9e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3979  nucleoid occlusion protein  66.67 
 
 
216 aa  274  7e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.56213  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0501  nucleoid occlusion protein  64.49 
 
 
220 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.957497  normal  0.22516 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0542  nucleoid occlusion protein  67.93 
 
 
214 aa  250  9.000000000000001e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0182  nucleoid occlusion protein  56.8 
 
 
220 aa  224  7e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.847466  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0142  nucleoid occlusion protein  55.24 
 
 
216 aa  223  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.219358 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2012  nucleoid occlusion protein  53.24 
 
 
216 aa  216  2.9999999999999998e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1729  nucleoid occlusion protein  52.78 
 
 
216 aa  215  4e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3396  nucleoid occlusion protein  55.4 
 
 
216 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3719  nucleoid occlusion protein  55.4 
 
 
216 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0031  nucleoid occlusion protein  58.76 
 
 
218 aa  210  1e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3247  nucleoid occlusion protein  51.8 
 
 
229 aa  206  2e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2908  nucleoid occlusion protein  51.8 
 
 
229 aa  206  2e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.946505  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2181  nucleoid occlusion protein  51.8 
 
 
229 aa  206  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3440  nucleoid occlusion protein  51.8 
 
 
229 aa  206  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0336  nucleoid occlusion protein  54.42 
 
 
227 aa  206  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0183  nucleoid occlusion protein  51.8 
 
 
229 aa  206  3e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.24476  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0193  nucleoid occlusion protein  51.8 
 
 
229 aa  206  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4387  nucleoid occlusion protein  52.68 
 
 
233 aa  205  4e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.449333  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6449  nucleoid occlusion protein  51.39 
 
 
221 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.695285  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2484  nucleoid occlusion protein  52.34 
 
 
220 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.11022  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3098  nucleoid occlusion protein  52.34 
 
 
220 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.170288  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3114  nucleoid occlusion protein  52.31 
 
 
221 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0378  nucleoid occlusion protein  49.33 
 
 
230 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.99909  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0158  nucleoid occlusion protein  50 
 
 
230 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3007  nucleoid occlusion protein  51.16 
 
 
221 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.8305 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0062  nucleoid occlusion protein  51.12 
 
 
232 aa  195  6e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.249336  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0627  nucleoid occlusion protein  55.62 
 
 
202 aa  190  2e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.375777  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3094  nucleoid occlusion protein  52.36 
 
 
221 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.483047 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3145  nucleoid occlusion protein  52.36 
 
 
191 aa  182  3e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.909533  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1117  nucleoid occlusion protein  50 
 
 
200 aa  181  7e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.862438  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2257  nucleoid occlusion protein  49.47 
 
 
192 aa  181  7e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.178912  hitchhiker  0.0000216309 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2389  nucleoid occlusion protein  53.93 
 
 
204 aa  171  5e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.102395  normal  0.522775 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001824  transcriptional regulator  45.79 
 
 
196 aa  166  2e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000410739  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2593  nucleoid occlusion protein  47.57 
 
 
210 aa  165  5.9999999999999996e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000323733  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00651  nucleoid occlusion protein  45.79 
 
 
196 aa  164  1.0000000000000001e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0194  nucleoid occlusion protein  47.03 
 
 
196 aa  158  5e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000213488  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2985  nucleoid occlusion protein  50 
 
 
205 aa  158  6e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.111899  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0382  nucleoid occlusion protein  48.04 
 
 
197 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000135011  unclonable  0.0000000000636307 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0181  nucleoid occlusion protein  43.78 
 
 
198 aa  155  6e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0059  nucleoid occlusion protein  44.44 
 
 
200 aa  152  4e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0445493  normal  0.11202 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3831  nucleoid occlusion protein  45.36 
 
 
197 aa  151  5.9999999999999996e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4251  nucleoid occlusion protein  45.81 
 
 
197 aa  151  7e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3600  nucleoid occlusion protein  45.81 
 
 
197 aa  150  1e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.741133  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0356  nucleoid occlusion protein  45.81 
 
 
197 aa  150  1e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3773  nucleoid occlusion protein  45.81 
 
 
197 aa  150  1e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.461125 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0324  nucleoid occlusion protein  46.99 
 
 
197 aa  150  1e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0620  nucleoid occlusion protein  46.67 
 
 
197 aa  150  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000000140669 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0399  nucleoid occlusion protein  45.81 
 
 
197 aa  149  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0627309  hitchhiker  0.000000000130483 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0385  nucleoid occlusion protein  45.81 
 
 
197 aa  149  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000224895  hitchhiker  0.00861349 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0374  nucleoid occlusion protein  45.81 
 
 
197 aa  149  2e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000212742  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3484  nucleoid occlusion protein  47.75 
 
 
197 aa  150  2e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000984177  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0373  nucleoid occlusion protein  45.81 
 
 
197 aa  149  2e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0485263  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4564  nucleoid occlusion protein  44.69 
 
 
197 aa  148  5e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000269162  unclonable  0.0000000294752 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0459  nucleoid occlusion protein  45.81 
 
 
197 aa  148  5e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0126678  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3840  nucleoid occlusion protein  46.37 
 
 
197 aa  148  7e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00664895  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3674  nucleoid occlusion protein  44.79 
 
 
199 aa  147  1.0000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00408157  normal  0.151909 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03498  nucleoid occlusion protein  46.96 
 
 
198 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0113918  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0064  transcriptional regulator, TetR family  46.96 
 
 
198 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000175826  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3850  nucleoid occlusion protein  46.96 
 
 
198 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000201623  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3931  nucleoid occlusion protein  46.96 
 
 
198 aa  146  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0886736  hitchhiker  0.000487739 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4012  nucleoid occlusion protein  46.96 
 
 
198 aa  146  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.554445  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4119  nucleoid occlusion protein  46.96 
 
 
198 aa  146  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.441328  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4142  nucleoid occlusion protein  46.96 
 
 
198 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000526151  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4066  nucleoid occlusion protein  46.96 
 
 
198 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00270158  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03450  hypothetical protein  46.96 
 
 
198 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00837733  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4058  nucleoid occlusion protein  46.96 
 
 
198 aa  146  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00047  nucleoid occlusion protein  42.78 
 
 
195 aa  146  2.0000000000000003e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3976  nucleoid occlusion protein  46.96 
 
 
198 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.027184  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3949  nucleoid occlusion protein  46.96 
 
 
198 aa  146  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0098  nucleoid occlusion protein  47.22 
 
 
198 aa  146  2.0000000000000003e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0100985  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0070  nucleoid occlusion protein  46.96 
 
 
198 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000194925  unclonable  0.00000000943905 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5011  nucleoid occlusion protein  46.96 
 
 
198 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0450587  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0323  nucleoid occlusion protein  45.81 
 
 
197 aa  146  3e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000549659  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0044  nucleoid occlusion protein  43.33 
 
 
197 aa  145  5e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00442405  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4103  nucleoid occlusion protein  47.78 
 
 
198 aa  145  6e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0313607  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4845  nucleoid occlusion protein  48.07 
 
 
198 aa  145  6e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0111456  decreased coverage  0.000000677674 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4393  nucleoid occlusion protein  47.78 
 
 
198 aa  144  1e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000163426  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0052  nucleoid occlusion protein  46.96 
 
 
198 aa  141  9e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.881528  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0058  nucleoid occlusion protein  46.96 
 
 
198 aa  141  9e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00579463  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4158  nucleoid occlusion protein  46.96 
 
 
198 aa  141  9e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000407134  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0155  nucleoid occlusion protein  44.44 
 
 
198 aa  140  9.999999999999999e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.894699  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3963  nucleoid occlusion protein  45.56 
 
 
198 aa  138  6e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000172432  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3502  nucleoid occlusion protein  40.74 
 
 
195 aa  132  5e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.284468  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0141  nucleoid occlusion protein  38.2 
 
 
219 aa  124  1e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.102052  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0301  transcriptional regulator, TetR family  22.81 
 
 
199 aa  60.8  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0864199  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1909  transcriptional regulator, TetR family  23.43 
 
 
197 aa  60.1  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0520  transcriptional regulator, TetR family  23.97 
 
 
197 aa  58.2  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.711752  normal  0.521102 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2314  transcriptional regulator, TetR family  23.98 
 
 
213 aa  58.2  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.251224 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1059  TetR family transcriptional regulator  25.97 
 
 
212 aa  54.7  0.0000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.659814 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1334  TetR family transcriptional regulator  24.75 
 
 
241 aa  54.7  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2448  TetR family transcriptional regulator  29.36 
 
 
204 aa  52  0.000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1062  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
215 aa  51.6  0.000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.453034  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0196  transcriptional regulator, TetR family  26.57 
 
 
200 aa  50.8  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0951  TetR family transcriptional regulator  24.71 
 
 
196 aa  50.1  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>