91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_7011 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_7011  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 190 aa  368  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0394296  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23720  transcriptional regulator, tetR family  43.58 
 
 		 192 aa  116  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.232738 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2413  TetR family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 195 aa  85.9  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.311533 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2288  regulatory protein, TetR  33.16 
 
 		 205 aa  80.9  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5749  transcriptional regulator, TetR family  37.08 
 
 		 193 aa  79.7  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.808729 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3382  putative transcriptional regulator, TetR family  35.05 
 
 		 202 aa  76.3  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.60132 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2686  transcriptional regulator, TetR family  33.5 
 
 		 196 aa  62.8  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2860  regulatory protein, TetR  30.32 
 
 		 217 aa  58.2  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.409771 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1516  transcriptional regulator BetI  31.82 
 
 		 197 aa  51.6  0.000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.026336  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3962  putative transcriptional regulator, TetR family  47.46 
 
 		 194 aa  51.2  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.545183  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1434  transcriptional regulator, TetR family  44.07 
 
 		 225 aa  49.7  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.185065  normal  0.789444 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0687  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 261 aa  48.5  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.794796  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0914  transcriptional regulatory protein  39 
 
 		 210 aa  47.4  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.626019  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2739  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 225 aa  47.4  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000589766  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2639  TetR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 213 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2530  TetR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 213 aa  46.6  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.704068 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2609  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 194 aa  47  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000163063  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2610  TetR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 234 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341012  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2657  TetR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 213 aa  46.6  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5941  TetR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 213 aa  47  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2000  TetR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 234 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.920156  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0280  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 196 aa  46.2  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4336  TetR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 210 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.426629 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3089  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 194 aa  46.2  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0658  TetR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 195 aa  45.8  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.609022  normal  0.929409 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1885  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 196 aa  45.8  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2120  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 195 aa  45.4  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4614  transcriptional regulator, TetR family  31.33 
 
 		 222 aa  45.8  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3714  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 212 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 196 aa  45.1  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1231  transcriptional regulator, TetR family  39.08 
 
 		 212 aa  44.7  0.0008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.814793  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2969  TetR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 222 aa  44.7  0.0009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4856  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 219 aa  44.7  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.633474  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1387  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 210 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.649854  normal  0.844436 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4220  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 239 aa  43.9  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1898  transcriptional regulator BetI  33.33 
 
 		 189 aa  43.9  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.516786 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  31.06 
 
 		 201 aa  43.5  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2192  transcriptional regulator, TetR family  28.74 
 
 		 191 aa  43.5  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3788  transcriptional regulator, TetR family  47.54 
 
 		 194 aa  43.5  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.263954  normal  0.238282 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3755  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 239 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0088  TetR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 221 aa  43.1  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.383567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4426  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 210 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.062473  normal  0.279059 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1139  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 193 aa  43.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.564798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3828  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 239 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0414  TetR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 215 aa  43.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.462572  normal  0.0664832 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3767  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 239 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2868  TetR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 184 aa  43.5  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0239599 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4302  transcriptional regulator, TetR family  27.53 
 
 		 223 aa  42.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1840  transcriptional regulator, TetR family  41.27 
 
 		 415 aa  42.7  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5150  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 204 aa  42.7  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.491017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14570  transcriptional regulator, tetR family  29.17 
 
 		 184 aa  42.7  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4006  regulatory protein, TetR  27.68 
 
 		 219 aa  42.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.722695  normal  0.0616898 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3867  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 225 aa  42.7  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.53155  normal  0.151589 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1277  transcriptional regulator, TetR family  32.72 
 
 		 211 aa  42.4  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0101868  normal  0.0726815 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2013  TetR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 173 aa  42.4  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2059  TetR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 173 aa  42.4  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.045167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2714  transcriptional regulator, TetR family  33.73 
 
 		 183 aa  42.4  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000526113  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2095  transcriptional regulator, TetR family  29.49 
 
 		 194 aa  42.4  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.546455  normal  0.514839 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3313  transcriptional regulator, TetR family  30.26 
 
 		 209 aa  42.4  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137945 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0327  TetR family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 211 aa  42.4  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.159849 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1994  TetR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 173 aa  42.4  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.187018  normal  0.996586 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1027  TetR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 210 aa  42.4  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1281  TetR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 210 aa  42  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.781108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1921  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 197 aa  42  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0409606  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0035  TetR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 206 aa  42  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00656395  normal  0.0912126 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3172  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 216 aa  42.4  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.547125 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0235  TetR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 225 aa  42.4  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3270  transcriptional regulator BetI  31.93 
 
 		 194 aa  42  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2010  TetR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 184 aa  42  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2143  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 249 aa  42  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.101921  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5098  transcriptional regulator BetI  31.93 
 
 		 194 aa  42  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2056  TetR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 184 aa  42  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1991  TetR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 184 aa  42  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.645683  normal  0.738548 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1272  transcriptional regulator, TetR family  35.82 
 
 		 176 aa  42  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.388296  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1451  transcriptional regulator, TetR family  41.27 
 
 		 428 aa  42  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5184  transcriptional regulator BetI  31.93 
 
 		 194 aa  42  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.14696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0896  transcriptional regulator, TetR family  28.98 
 
 		 186 aa  42  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.678038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1725  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 194 aa  41.6  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1601  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 194 aa  41.6  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.105676  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1775  transcriptional regulator, TetR family  32.39 
 
 		 194 aa  41.6  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0713  transcriptional regulator BetI  30.48 
 
 		 201 aa  41.6  0.008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0124161  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05540  transcriptional regulator  30.67 
 
 		 197 aa  41.6  0.008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4626  transcriptional regulator, TetR family  39.34 
 
 		 211 aa  41.6  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110176  hitchhiker  0.00755279 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1834  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 196 aa  41.6  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.353647 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0424  transcriptional regulator, TetR family  34.07 
 
 		 201 aa  41.2  0.008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.315635  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3308  transcriptional regulator BetI  31.68 
 
 		 196 aa  41.2  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1683  TetR family transcriptional regulator  50.85 
 
 		 197 aa  41.2  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.947535  normal  0.202583 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1788  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 194 aa  41.2  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1521  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 233 aa  41.2  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1512  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 233 aa  41.2  0.01  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1548  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 233 aa  41.2  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>