64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_23720 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_23720  transcriptional regulator, tetR family  100 
 
 		 192 aa  370  1e-102  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.232738 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7011  transcriptional regulator, TetR family  46.11 
 
 		 190 aa  135  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0394296  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2413  TetR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 195 aa  96.3  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.311533 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2288  regulatory protein, TetR  37.64 
 
 		 205 aa  96.3  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5749  transcriptional regulator, TetR family  37.58 
 
 		 193 aa  77  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.808729 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0658  TetR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.609022  normal  0.929409 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3382  putative transcriptional regulator, TetR family  32.32 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.60132 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22250  transcriptional regulator  27.45 
 
 		 196 aa  52.8  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0446991  normal  0.543201 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  29.55 
 
 		 226 aa  52  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  29.13 
 
 		 226 aa  51.2  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576002 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2686  transcriptional regulator, TetR family  30.34 
 
 		 196 aa  50.4  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0280  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 196 aa  48.5  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1958  TetR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 251 aa  48.5  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.455038  normal  0.501183 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 		 199 aa  48.1  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3293  regulatory protein TetR  45.61 
 
 		 208 aa  47.8  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.147599  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1007  transcriptional regulator, TetR family  23.49 
 
 		 194 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.587433  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000366  HTH-type transcriptional regulator BetI  26.7 
 
 		 194 aa  46.6  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20280  transcriptional regulator, TetR family  44.07 
 
 		 213 aa  45.8  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.612683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5230  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 228 aa  45.8  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0626  TetR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 244 aa  45.4  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.852372 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3666  TetR family transcriptional regulator  22.62 
 
 		 194 aa  45.4  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1434  transcriptional regulator, TetR family  25.15 
 
 		 225 aa  45.4  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.185065  normal  0.789444 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5284  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 208 aa  45.1  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0597036  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0811  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 194 aa  45.1  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.646976  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2695  TetR family transcriptional regulator  23.57 
 
 		 204 aa  44.7  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.945572  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3397  TetR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 222 aa  44.7  0.0009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.15089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  32.39 
 
 		 203 aa  43.9  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0736  TetR family transcriptional regulator  23.49 
 
 		 194 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0116381  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4626  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 211 aa  44.3  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110176  hitchhiker  0.00755279 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3270  transcriptional regulator BetI  33.86 
 
 		 194 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5098  transcriptional regulator BetI  33.86 
 
 		 194 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5184  transcriptional regulator BetI  33.86 
 
 		 194 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.14696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0382  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 242 aa  43.5  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.894324  normal  0.190078 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7752  putative transcriptional regulator, TetR family  29.44 
 
 		 202 aa  43.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0555  transcriptional regulator BetI  33.33 
 
 		 194 aa  43.5  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2860  regulatory protein, TetR  25.88 
 
 		 217 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.409771 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06181  transcriptional regulator BetI  27.81 
 
 		 199 aa  43.1  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  35.16 
 
 		 207 aa  42.7  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0375  transcriptional regulator BetI  34.05 
 
 		 202 aa  42.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00292447  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15980  transcriptional regulator  42.59 
 
 		 179 aa  42.7  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.47032  normal  0.185748 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1116  TetR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 209 aa  43.1  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.863597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1426  transcriptional regulator BetI  34.05 
 
 		 195 aa  42.7  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.80296  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3714  TetR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 212 aa  42.7  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1835  transcriptional regulator BetI  34.05 
 
 		 195 aa  42.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4336  TetR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 210 aa  42.7  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.426629 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0106  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 242 aa  42.7  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.180704  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1923  transcriptional regulator BetI  34.05 
 
 		 195 aa  42.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00275068  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0466  transcriptional regulator BetI  34.05 
 
 		 202 aa  42.7  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4856  TetR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 219 aa  42.7  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.633474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0181  transcriptional regulator BetI  34.05 
 
 		 195 aa  42.7  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1387  TetR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 210 aa  42.4  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.649854  normal  0.844436 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4302  transcriptional regulator, TetR family  25.37 
 
 		 223 aa  42.4  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0946  TetR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 223 aa  42.4  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.123031  normal  0.934208 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9073  putative transcriptional regulator, TetR family  24.22 
 
 		 193 aa  42.4  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  31 
 
 		 212 aa  42  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 211 aa  42  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  25.53 
 
 		 213 aa  42.4  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0127  transcriptional regulator, TetR family  27.33 
 
 		 193 aa  42  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0916  transcriptional regulator BetI  33.33 
 
 		 202 aa  41.6  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0327012  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4006  regulatory protein, TetR  25.15 
 
 		 219 aa  41.2  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.722695  normal  0.0616898 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3538  transcriptional regulator BetI  33.51 
 
 		 194 aa  41.2  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6487  transcriptional regulator, TetR family  34.04 
 
 		 195 aa  41.2  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 205 aa  41.2  0.009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  53.06 
 
 		 219 aa  41.2  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>