265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4881 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_4881  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 195 aa  389  1e-107  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0263857 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1548  TetR family transcriptional regulator  75.38 
 
 		 187 aa  244  6.999999999999999e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.664164  normal  0.297776 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0447  putative transcriptional regulator, TetR family  45.36 
 
 		 226 aa  135  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1475  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 238 aa  81.3  0.000000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.612168  normal  0.616204 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3475  TetR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 229 aa  66.6  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.265474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5831  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 227 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.626315 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0702  TetR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 187 aa  61.6  0.000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0130009  normal  0.810563 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3009  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 187 aa  61.6  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3260  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 187 aa  60.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0974  regulatory protein, TetR  27.03 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4065  TetR family transcriptional regulator  22.86 
 
 		 193 aa  57.4  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2310  TetR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 198 aa  57  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.145827  normal  0.0377448 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2228  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5494  transcriptional regulator, TetR family  37.33 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.769028  normal  0.39499 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3717  TetR family transcriptional regulator  22.86 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  22.37 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  24.27 
 
 		 201 aa  54.7  0.0000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  24.27 
 
 		 201 aa  54.3  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4466  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 193 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3963  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 193 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2983  TetR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 190 aa  53.1  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4037  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 193 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3977  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 193 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.698976  normal  0.0354344 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0457  TetR family transcriptional regulator  22.73 
 
 		 206 aa  52.4  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0604  TetR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 205 aa  52.4  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229279 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  29.14 
 
 		 200 aa  52.4  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5376  putative transcriptional regulator, TetR family  33 
 
 		 207 aa  52  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0545475 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1006  TetR family transcriptional regulator  22.3 
 
 		 189 aa  51.6  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  21.8 
 
 		 193 aa  51.6  0.000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3151  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 202 aa  51.6  0.000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2825  TetR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 204 aa  51.6  0.000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0304388 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1164  TetR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 184 aa  50.8  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000872016  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1114  transcriptional regulator, TetR family  38.36 
 
 		 186 aa  50.8  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.213128 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0871  TetR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 202 aa  50.8  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0936  transcriptional regulator, TetR family protein  19.35 
 
 		 206 aa  50.8  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3845  transcriptional regulator, TetR family  26.17 
 
 		 209 aa  51.2  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00359694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3358  TetR family transcriptional regulator  22.34 
 
 		 190 aa  50.8  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3252  TetR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 200 aa  50.4  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5272  TetR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 195 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4395  transcriptional regulator, TetR family  38.16 
 
 		 196 aa  49.7  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.724029  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1637  transcriptional regulator, TetR family  38.36 
 
 		 227 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0178246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7116  putative transcriptional regulator, TetR family  35.05 
 
 		 183 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3134  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 220 aa  49.7  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.471149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3104  TetR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 194 aa  49.3  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.428011 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0331  transcriptional regulator, TetR family  27.84 
 
 		 209 aa  49.3  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0179  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 193 aa  48.9  0.00004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0807108  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 205 aa  49.3  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3522  TetR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 204 aa  48.9  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0969  TetR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 195 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.610377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0543  TetR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 203 aa  48.9  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.889127 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3989  regulatory protein TetR  35.85 
 
 		 204 aa  48.9  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2856  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 194 aa  48.9  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.661308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5303  TetR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 187 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.398356  normal  0.30324 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4331  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 220 aa  48.9  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9297  putative transcriptional regulator, TetR family  27.08 
 
 		 198 aa  48.5  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.775461 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5693  transcriptional regulator, TetR family  30.91 
 
 		 211 aa  48.5  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0563608  normal  0.866587 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05790  transcriptional regulator  32.65 
 
 		 215 aa  48.5  0.00006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.415819 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0106  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 227 aa  48.5  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8486  putative transcriptional regulator, TetR family  30.32 
 
 		 201 aa  48.1  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.251281  normal  0.72211 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2551  regulatory protein TetR  27.36 
 
 		 190 aa  48.1  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.140375  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5284  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 208 aa  48.1  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0597036  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0987  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 195 aa  47.4  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.995143  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3684  TetR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 202 aa  47.4  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3481  transcriptional regulator, TetR family  34.88 
 
 		 189 aa  47.4  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.148181  normal  0.311825 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0186  TetR family transcriptional regulator  23.87 
 
 		 203 aa  47.4  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.625871  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1590  transcriptional regulator, TetR family  32.53 
 
 		 231 aa  47.4  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.299217  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4287  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 205 aa  47.4  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5157  putative transcriptional regulator, TetR family  31.01 
 
 		 233 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23435  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1944  TetR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 429 aa  47.8  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  34.88 
 
 		 210 aa  47.4  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1819  TetR family transcriptional regulator  23.87 
 
 		 203 aa  47.4  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.191224 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7871  transcriptional regulator, TetR family  46.03 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.519364  normal  0.175428 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1991  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 188 aa  46.6  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3185  transcriptional regulator, TetR family  29.67 
 
 		 192 aa  46.6  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0651  TetR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 218 aa  46.6  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0025795  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2581  regulatory protein, TetR  30.77 
 
 		 197 aa  46.6  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4307  TetR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 214 aa  47  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.188393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0872  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 190 aa  47  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.956466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3293  regulatory protein TetR  37.97 
 
 		 208 aa  47  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.147599  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0561  transcriptional regulator, TetR family  34.74 
 
 		 197 aa  46.6  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  38.57 
 
 		 287 aa  46.6  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  38.67 
 
 		 230 aa  46.6  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2776  TetR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 197 aa  46.2  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.832438  hitchhiker  0.000578318 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0655  TetR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 254 aa  46.2  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5248  transcriptional regulator, TetR family  39.44 
 
 		 178 aa  46.2  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0914  transcriptional regulatory protein  40 
 
 		 210 aa  46.6  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.626019  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1236  TetR family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 196 aa  46.2  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0369519 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2610  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 207 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.965658  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2654  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 207 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.569555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1035  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 214 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2640  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 207 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5814  transcriptional regulator, TetR family  31.45 
 
 		 195 aa  46.2  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3024  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 197 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5303  TetR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 210 aa  45.8  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.444335 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1012  transcriptional regulator, TetR family  32.79 
 
 		 212 aa  45.8  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156612  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 207 aa  45.8  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1049  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 230 aa  45.8  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599696  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4758  TetR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 210 aa  45.8  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.939945 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1086  transcriptional regulator, TetR family  28.14 
 
 		 239 aa  45.8  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.566372  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1844  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 242 aa  45.4  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000808903 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>