30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5831 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_5831  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 227 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.626315 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3475  TetR family transcriptional regulator  44.81 
 
 		 229 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.265474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1475  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 238 aa  68.9  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.612168  normal  0.616204 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0447  putative transcriptional regulator, TetR family  28.92 
 
 		 226 aa  59.7  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1884  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.652086  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1548  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 187 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.664164  normal  0.297776 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4881  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 195 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0263857 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  28.17 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2836  transcriptional regulator, TetR family  35.44 
 
 		 207 aa  47.8  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00562159  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2192  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 191 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3373  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 211 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2972  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 207 aa  46.6  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3101  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 212 aa  46.6  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4006  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 237 aa  46.2  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0457  TetR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 206 aa  45.8  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  30.12 
 
 		 201 aa  45.4  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2028  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 222 aa  44.7  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.578288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4107  transcriptional regulator  30.88 
 
 		 187 aa  43.9  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.198218  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47610  putative transcriptional regulator  30.88 
 
 		 186 aa  43.9  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0702  TetR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 187 aa  43.9  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0130009  normal  0.810563 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0223  regulatory protein TetR  39.47 
 
 		 234 aa  43.5  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.029073 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6428  transcriptional regulator, TetR family  35.37 
 
 		 217 aa  43.5  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2589  transcriptional regulator BetI  25.74 
 
 		 196 aa  43.1  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0583  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 205 aa  43.5  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1710  TetR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 217 aa  42.7  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.160964  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19560  transcriptional regulator, tetR family  33.03 
 
 		 205 aa  42.7  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.186862  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14520  Transcriptional regulator PsrA  28.72 
 
 		 239 aa  42  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2789  transcriptional regulator  31.25 
 
 		 206 aa  42  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0675  transcriptional regulator, TetR family  32.61 
 
 		 271 aa  42  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.886772  normal  0.300779 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5376  putative transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 207 aa  42  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0545475 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>