139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0447 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0447  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 226 aa  445  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1548  TetR family transcriptional regulator  44.56 
 
 		 187 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.664164  normal  0.297776 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4881  TetR family transcriptional regulator  45.36 
 
 		 195 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0263857 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1475  transcriptional regulator, TetR family  36.87 
 
 		 238 aa  75.5  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.612168  normal  0.616204 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0702  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 187 aa  66.6  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0130009  normal  0.810563 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1637  transcriptional regulator, TetR family  34.58 
 
 		 227 aa  62.4  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0178246  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3475  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 229 aa  61.2  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.265474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5831  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 227 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.626315 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5492  transcriptional regulator, TetR family  35.51 
 
 		 177 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56711 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3721  transcriptional regulator, TetR family  32.45 
 
 		 200 aa  52  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2548  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 236 aa  50.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000944763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1884  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 189 aa  50.4  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.652086  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0457  TetR family transcriptional regulator  22.92 
 
 		 206 aa  50.8  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0286  TetR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 177 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.945519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5494  transcriptional regulator, TetR family  39.44 
 
 		 141 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.769028  normal  0.39499 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2551  regulatory protein TetR  31.13 
 
 		 190 aa  49.3  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.140375  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1901  transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 		 245 aa  49.3  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0306246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1348  transcriptional regulator, TetR family  36.76 
 
 		 218 aa  48.5  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.593778  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0239  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 229 aa  48.5  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0604  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 205 aa  48.5  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229279 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3237  TetR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 193 aa  48.5  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0582489  normal  0.651915 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7950  putative transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 218 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0331  transcriptional regulator, TetR family  29.59 
 
 		 209 aa  47.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4406  TetR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 223 aa  47  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.732992  normal  0.0232179 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1597  transcriptional regulator, TetR family  29.13 
 
 		 187 aa  47  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0577868  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1798  TetR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 194 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2686  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 181 aa  47  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.39833  hitchhiker  0.00361312 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3009  transcriptional regulator, TetR family  36.76 
 
 		 187 aa  46.6  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1601  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 194 aa  46.2  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.105676  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0436  TetR/AcrR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 193 aa  46.2  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00014648  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4307  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 214 aa  46.2  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.188393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5150  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 204 aa  46.6  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.491017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00523  transcriptional regulator, TetR family protein  22.62 
 
 		 200 aa  46.2  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3260  transcriptional regulator, TetR family  36.76 
 
 		 187 aa  46.6  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1553  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 194 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  36.05 
 
 		 222 aa  46.2  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1725  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 194 aa  45.8  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0888  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 203 aa  45.8  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2856  TetR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 194 aa  45.8  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.661308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2094  transcriptional regulator, TetR family  24.44 
 
 		 186 aa  45.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000324065 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1775  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 194 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4141  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 243 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4758  TetR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 210 aa  45.4  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.939945 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5284  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 208 aa  45.4  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0597036  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1231  transcriptional regulator, TetR family  37.8 
 
 		 212 aa  45.4  0.0007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.814793  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5303  TetR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 210 aa  45.1  0.0009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.444335 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05790  transcriptional regulator  32.67 
 
 		 215 aa  45.1  0.0009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.415819 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1201  transcription regulator protein  29.9 
 
 		 209 aa  44.7  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.871194 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2762  TetR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 223 aa  44.7  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1166  TetR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 278 aa  45.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0604682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3989  regulatory protein TetR  33.33 
 
 		 204 aa  44.7  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2028  TetR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 222 aa  45.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.578288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5814  transcriptional regulator, TetR family  33.05 
 
 		 195 aa  44.7  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0857  transcriptional regulator, TetR family  37.21 
 
 		 218 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.999415 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0829  transcriptional regulator, TetR family  37.21 
 
 		 218 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2192  transcriptional regulator, TetR family  33.82 
 
 		 191 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1984  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 196 aa  43.9  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1093  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 217 aa  43.5  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4837  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 237 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3185  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 192 aa  43.5  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3164  transcriptional regulator, TetR family  36.19 
 
 		 208 aa  44.3  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.859639  normal  0.0513104 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4925  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 237 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.733021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2157  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 187 aa  44.3  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.105803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1035  TetR family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 214 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5345  transcriptional regulator, TetR family  30.7 
 
 		 196 aa  44.3  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.745934  normal  0.0675507 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4025  regulatory protein, TetR  36.36 
 
 		 197 aa  44.3  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.865842 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5699  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 206 aa  43.9  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.393579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 201 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3540  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 250 aa  43.9  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5222  transcriptional regulator  30.26 
 
 		 179 aa  44.3  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0024  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 212 aa  43.1  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00530  transcriptional regulator  36.21 
 
 		 212 aa  43.5  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5376  putative transcriptional regulator, TetR family  34.72 
 
 		 207 aa  43.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0545475 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 201 aa  43.1  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6428  transcriptional regulator, TetR family  26.57 
 
 		 217 aa  43.5  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0675  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 271 aa  43.1  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.886772  normal  0.300779 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2329  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 186 aa  43.5  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.148714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2348  transcriptional regulator, TetR family  44.9 
 
 		 222 aa  43.5  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0187157  normal  0.0306872 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1242  TetR family transcriptional regulator  21.48 
 
 		 212 aa  43.1  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000053734  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20280  transcriptional regulator, TetR family  37.1 
 
 		 213 aa  43.5  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.612683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2181  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 189 aa  43.1  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000940073  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6157  TetR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 190 aa  43.5  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0827  transcriptional regulator, TetR family  27.06 
 
 		 179 aa  43.5  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.843783  normal  0.883408 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  25.56 
 
 		 201 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1550  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 201 aa  43.5  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4830  transcriptional regulator, TetR family  29.36 
 
 		 226 aa  43.1  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.456248  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0143  transcriptional regulator  25.87 
 
 		 264 aa  42.7  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5087  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 259 aa  43.1  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  31.96 
 
 		 230 aa  42.7  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5773  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 259 aa  43.1  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.669739 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0323  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 227 aa  42.7  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.939407  normal  0.953553 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4579  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 230 aa  42.7  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.28011 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6443  transcriptional regulator, TetR family  25.23 
 
 		 202 aa  43.1  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3293  regulatory protein TetR  36.07 
 
 		 208 aa  42.7  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.147599  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3845  TetR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 197 aa  42.7  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4405  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 259 aa  43.1  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.630882  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2922  transcriptional regulator, TetR family  32.65 
 
 		 204 aa  42.7  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3431  transcriptional regulator, TetR family  24.39 
 
 		 189 aa  43.1  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2560  putative transcription regulator protein  35.59 
 
 		 209 aa  42.7  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0102643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5409  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 208 aa  42.7  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.394363  hitchhiker  0.00700115 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>