221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1548 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_1548  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 187 aa  373  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.664164  normal  0.297776 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4881  TetR family transcriptional regulator  75.38 
 
 		 195 aa  243  9.999999999999999e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0263857 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0447  putative transcriptional regulator, TetR family  44.56 
 
 		 226 aa  136  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1475  transcriptional regulator, TetR family  38.32 
 
 		 238 aa  72  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.612168  normal  0.616204 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0702  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 187 aa  67.4  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0130009  normal  0.810563 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5831  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 227 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.626315 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3717  TetR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 191 aa  62  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3475  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 229 aa  59.7  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.265474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4065  TetR family transcriptional regulator  21.9 
 
 		 193 aa  58.2  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  25.24 
 
 		 201 aa  57  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3009  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 187 aa  57.4  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3431  transcriptional regulator, TetR family  25.17 
 
 		 189 aa  53.9  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5303  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 187 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.398356  normal  0.30324 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5494  transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 		 141 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.769028  normal  0.39499 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3260  transcriptional regulator, TetR family  35.23 
 
 		 187 aa  53.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0936  transcriptional regulator, TetR family protein  21.1 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0457  TetR family transcriptional regulator  22.84 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5376  putative transcriptional regulator, TetR family  34 
 
 		 207 aa  52.8  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0545475 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1164  TetR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 184 aa  52.4  0.000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000872016  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0974  regulatory protein, TetR  22.52 
 
 		 205 aa  52  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3358  TetR family transcriptional regulator  22.34 
 
 		 190 aa  51.2  0.000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1006  TetR family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 189 aa  51.2  0.000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3684  TetR family transcriptional regulator  21.21 
 
 		 202 aa  50.1  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0543  TetR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 203 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.889127 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2856  TetR family transcriptional regulator  23.4 
 
 		 194 aa  50.1  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.661308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2983  TetR family transcriptional regulator  23.33 
 
 		 190 aa  50.1  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5248  transcriptional regulator, TetR family  36.59 
 
 		 178 aa  49.3  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3252  TetR family transcriptional regulator  23.33 
 
 		 200 aa  49.3  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  27.82 
 
 		 200 aa  49.3  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3104  TetR family transcriptional regulator  22.92 
 
 		 194 aa  49.7  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.428011 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1991  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 188 aa  48.9  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05790  transcriptional regulator  33.67 
 
 		 215 aa  48.9  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.415819 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4404  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 199 aa  48.9  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0114676  normal  0.191291 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 193 aa  48.9  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5284  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 208 aa  48.9  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0597036  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0871  TetR family transcriptional regulator  23.33 
 
 		 202 aa  48.9  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3151  TetR family transcriptional regulator  23.33 
 
 		 202 aa  48.5  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5814  transcriptional regulator, TetR family  37.66 
 
 		 195 aa  48.5  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2551  regulatory protein TetR  27.1 
 
 		 190 aa  48.5  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.140375  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1637  transcriptional regulator, TetR family  38.36 
 
 		 227 aa  48.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0178246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4331  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 220 aa  47.8  0.00008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1823  TetR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 222 aa  47.8  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2757  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 179 aa  47.8  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3892  TetR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 198 aa  47.8  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3966  TetR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 198 aa  47.8  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.176455  normal  0.497396 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3878  TetR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 198 aa  47.8  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.348506 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0987  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 195 aa  47.4  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.995143  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4395  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 196 aa  47.4  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.724029  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10440  transcriptional regulator  25.45 
 
 		 211 aa  47.4  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0189255  normal  0.0235057 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1114  transcriptional regulator, TetR family  40.3 
 
 		 186 aa  47.8  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.213128 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0872  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 190 aa  47  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.956466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0604  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 205 aa  47.4  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229279 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2202  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 186 aa  46.6  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0914  transcriptional regulatory protein  29.44 
 
 		 210 aa  46.6  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.626019  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2310  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 198 aa  46.6  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.145827  normal  0.0377448 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2461  transcriptional regulator, TetR family  28.4 
 
 		 196 aa  46.6  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000138739  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1156  transcriptional regulator, TetR family  26.97 
 
 		 227 aa  46.6  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2610  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 207 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.965658  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2654  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 207 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.569555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0969  TetR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 195 aa  47  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.610377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2640  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 207 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3522  TetR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 204 aa  47  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1012  transcriptional regulator, TetR family  32.79 
 
 		 212 aa  46.6  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156612  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5272  TetR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 195 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3500  TetR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 191 aa  47  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00541119  n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4458  transcriptional regulator, TetR family  20.66 
 
 		 195 aa  46.2  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3845  transcriptional regulator, TetR family  24.3 
 
 		 209 aa  46.2  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00359694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00530  transcriptional regulator  29.73 
 
 		 212 aa  45.8  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7871  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 212 aa  46.2  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.519364  normal  0.175428 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3665  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 228 aa  45.8  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2329  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 186 aa  45.4  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.148714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0561  transcriptional regulator, TetR family  33.68 
 
 		 197 aa  45.4  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4758  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 210 aa  45.4  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.939945 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2482  transcriptional regulator, TetR family  35.45 
 
 		 230 aa  45.4  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1944  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 429 aa  45.4  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1553  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 194 aa  45.1  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4307  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 214 aa  45.1  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.188393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5303  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 210 aa  45.1  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.444335 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7097  TetR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 206 aa  45.1  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3436  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 194 aa  45.1  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.262135  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7116  putative transcriptional regulator, TetR family  38.33 
 
 		 183 aa  45.1  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0186  TetR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 203 aa  45.1  0.0007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.625871  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  40.68 
 
 		 230 aa  44.7  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1819  TetR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 203 aa  45.1  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.191224 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0437  TetR family transcriptional regulator  52.27 
 
 		 176 aa  44.7  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.383719 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1844  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 242 aa  45.1  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000808903 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  21.11 
 
 		 192 aa  44.7  0.0007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4869  regulatory protein, TetR  32.43 
 
 		 224 aa  44.7  0.0008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0235  TetR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 225 aa  44.7  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1601  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 194 aa  44.7  0.0009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.105676  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1775  transcriptional regulator, TetR family  30.93 
 
 		 194 aa  44.7  0.0009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46290  TetR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 210 aa  44.7  0.0009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0128988  normal  0.0344421 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3046  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  31.48 
 
 		 216 aa  43.9  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.303422  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40790  putative transcriptional regulator  26.2 
 
 		 193 aa  43.9  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5417  TetR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 225 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.618934  decreased coverage  0.00324744 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3185  transcriptional regulator, TetR family  39.47 
 
 		 192 aa  43.9  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2344  TetR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 195 aa  44.3  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.914652  normal  0.958906 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2986  regulatory protein, TetR  30.48 
 
 		 241 aa  43.9  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>