237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1513 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_1513  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 196 aa  390  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.642699  normal  0.703699 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4907  TetR family transcriptional regulator  88.27 
 
 		 196 aa  347  4e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.724417 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4423  TetR family transcriptional regulator  67.18 
 
 		 207 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.290335  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4510  TetR family transcriptional regulator  67.18 
 
 		 207 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.434425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4804  TetR family transcriptional regulator  67.18 
 
 		 207 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.499136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4973  TetR family transcriptional regulator  54.97 
 
 		 201 aa  207  1e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0231413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1774  TetR family transcriptional regulator  54.45 
 
 		 200 aa  205  3e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1253  TetR family transcriptional regulator  56.52 
 
 		 200 aa  202  3e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000989157 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4572  TetR family transcriptional regulator  49.75 
 
 		 208 aa  182  3e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.270475 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4416  TetR family transcriptional regulator  54.74 
 
 		 202 aa  171  6.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4503  TetR family transcriptional regulator  54.74 
 
 		 202 aa  171  6.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.437982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4797  TetR family transcriptional regulator  54.74 
 
 		 220 aa  170  9e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.718458 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5280  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 175 aa  54.3  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0102  transcriptional regulator, TetR family  48.21 
 
 		 192 aa  53.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3095  transcriptional regulator, TetR family  32.73 
 
 		 192 aa  52.8  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000942813  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000716  transcriptional regulator  50 
 
 		 175 aa  52  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.421465  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1053  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 200 aa  52  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.853566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2496  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 198 aa  51.6  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2004  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 196 aa  51.2  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00390576  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2229  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 196 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00028806  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2014  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0449612  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1986  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000218655  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1968  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0105465  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2169  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000817381  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2312  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000153851  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0724  transcriptional regulator, TetR family  32.48 
 
 		 224 aa  50.8  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6254  putative transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 208 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.0153866 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2291  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.857741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1969  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0320964 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0132  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 204 aa  49.7  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.410533  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1745  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 195 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0399082  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1879  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 179 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3545  transcriptional regulator, TetR family  39.06 
 
 		 192 aa  49.7  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5150  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 204 aa  49.7  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.491017  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3836  transcriptional regulator, TetR family  39.06 
 
 		 192 aa  49.7  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410307  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1963  transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 		 201 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000168283 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3959  transcriptional regulator, TetR family  35.21 
 
 		 204 aa  49.7  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00461459  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1648  transcriptional regulator, TetR family  31.73 
 
 		 199 aa  48.9  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.298566  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1751  TetR family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 206 aa  48.5  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6341  TetR family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 206 aa  48.5  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0497044  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1738  TetR family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 206 aa  48.5  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4583  putative transcriptional regulator, TetR family  48.21 
 
 		 200 aa  48.5  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal  0.302497 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1508  transcriptional regulator, TetR family  29.79 
 
 		 215 aa  48.5  0.00007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0994502  normal  0.123569 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2845  TetR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 197 aa  48.5  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.735257  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1788  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 195 aa  48.1  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000202922  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1927  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 195 aa  48.1  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00399738  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  30.87 
 
 		 242 aa  48.1  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2880  TetR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 187 aa  47.8  0.00009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.924779 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  32.43 
 
 		 236 aa  48.1  0.00009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0257  transcriptional regulator, TetR family  48.15 
 
 		 183 aa  48.1  0.00009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.115958 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0987  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 195 aa  47.8  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.995143  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6064  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 192 aa  47.8  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23590  putative transcriptional regulator  42.59 
 
 		 180 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0142024 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1999  putative transcriptional regulator  42.59 
 
 		 180 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2810  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 187 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.226856  normal  0.933916 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3524  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 187 aa  47  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4369  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 204 aa  46.6  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3938  transcriptional regulator, TetR family  44.26 
 
 		 231 aa  47  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00284915  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0368  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 184 aa  46.6  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00011837  normal  0.0425 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  44.07 
 
 		 202 aa  46.6  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0397  TetR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 192 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.188282 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 195 aa  46.6  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  41.51 
 
 		 184 aa  46.6  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6080  transcriptional regulator, TetR family  37.29 
 
 		 199 aa  47  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4404  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 213 aa  46.6  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0267  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 217 aa  46.2  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.173198  hitchhiker  0.00351225 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0794  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 192 aa  46.2  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0156861  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0743  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 192 aa  46.2  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.019038  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0730  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 192 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.110462  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0834  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 191 aa  46.2  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00423826  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0746  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 190 aa  46.2  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0172  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 208 aa  46.2  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5130  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 203 aa  46.2  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.943479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0409  TetR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 192 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1745  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 216 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 196 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0998  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 191 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000315127  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0418  TetR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 192 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.602911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1792  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 216 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.651799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4445  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 191 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.142911  normal  0.471705 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1726  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 216 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.379747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0889  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 192 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.760524  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2732  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 179 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.748169 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0929  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 192 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1215099999999997e-45 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0927  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 191 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.165233  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2384  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 187 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3217  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 207 aa  45.8  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2910  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 215 aa  45.8  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3089  TetR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 194 aa  45.8  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1764  TetR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 211 aa  45.8  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.162555 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0989  TetR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 199 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3386  TetR family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 221 aa  45.4  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2574  transcriptional regulator, TetR family  30.38 
 
 		 204 aa  45.4  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2902  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 187 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.465511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3667  transcriptional regulator, TetR family  47.17 
 
 		 188 aa  45.4  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.50901  normal  0.427463 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 210 aa  45.4  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7136  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 237 aa  45.4  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00720754  normal  0.217815 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4029  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 196 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2214  transcriptional regulator, TetR family  36.23 
 
 		 201 aa  45.4  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000301704  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1293  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 199 aa  45.1  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>