More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_4510 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_4804  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 207 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.499136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4423  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 207 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.290335  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4510  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 207 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.434425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4907  TetR family transcriptional regulator  69.23 
 
 		 196 aa  265  2e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.724417 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1513  TetR family transcriptional regulator  67.18 
 
 		 196 aa  239  2e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.642699  normal  0.703699 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1774  TetR family transcriptional regulator  58.85 
 
 		 200 aa  215  5e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4973  TetR family transcriptional regulator  56.35 
 
 		 201 aa  211  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0231413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1253  TetR family transcriptional regulator  56.78 
 
 		 200 aa  208  5e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000989157 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4416  TetR family transcriptional regulator  57.87 
 
 		 202 aa  186  2e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4503  TetR family transcriptional regulator  57.87 
 
 		 202 aa  186  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.437982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4797  TetR family transcriptional regulator  59.47 
 
 		 220 aa  185  3e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.718458 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4572  TetR family transcriptional regulator  52.04 
 
 		 208 aa  181  6e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.270475 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0989  TetR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 199 aa  58.2  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5280  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 175 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2229  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00028806  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0102  transcriptional regulator, TetR family  49.15 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1745  TetR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0399082  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2004  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00390576  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1963  transcriptional regulator, TetR family  47.46 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000168283 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3938  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 231 aa  55.8  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00284915  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2014  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0449612  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1986  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000218655  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1968  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0105465  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2169  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000817381  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2312  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000153851  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2880  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 187 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.924779 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1788  TetR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 195 aa  54.7  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000202922  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2291  transcriptional regulator, TetR family  46.88 
 
 		 205 aa  53.9  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.857741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1927  TetR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 195 aa  54.7  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00399738  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2496  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 198 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3959  transcriptional regulator, TetR family  32.95 
 
 		 204 aa  54.3  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00461459  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4364  TetR family transcriptional regulator  45.57 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1969  TetR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 205 aa  53.9  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0320964 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2810  TetR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 187 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.226856  normal  0.933916 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0432  TetR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 237 aa  53.5  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2384  TetR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 187 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5045  TetR family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 206 aa  52.4  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.906168  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5815  TetR family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 206 aa  52.4  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1751  TetR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 206 aa  52  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6828  TetR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 225 aa  52  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.196798  normal  0.216852 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6341  TetR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 206 aa  52  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0497044  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1738  TetR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 206 aa  52  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5150  TetR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 204 aa  51.6  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.491017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1150  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 222 aa  51.6  0.000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0987  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 195 aa  51.6  0.000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.995143  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4583  putative transcriptional regulator, TetR family  45.9 
 
 		 200 aa  51.6  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal  0.302497 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000716  transcriptional regulator  40.7 
 
 		 175 aa  51.6  0.000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.421465  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2902  TetR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 187 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.465511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0132  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 204 aa  50.8  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.410533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0397  TetR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 192 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.188282 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3095  transcriptional regulator, TetR family  41.27 
 
 		 192 aa  50.8  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000942813  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3524  TetR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 187 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0115  transcriptional regulator, TetR family  30.53 
 
 		 199 aa  50.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2892  TetR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 207 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.39024 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1648  transcriptional regulator, TetR family  29.44 
 
 		 199 aa  50.1  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.298566  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3746  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 216 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.29443  normal  0.952036 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0409  TetR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 192 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3734  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 216 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0418  TetR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 192 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.602911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3807  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 216 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.225103  normal  0.0640685 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0384  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 191 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4199  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 290 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2165  putative transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 215 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367605  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4043  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 228 aa  49.7  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2373  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 205 aa  50.1  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3545  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 192 aa  49.7  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3836  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 192 aa  49.3  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 210 aa  49.3  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5130  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 203 aa  49.3  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.943479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4604  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 214 aa  48.9  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1264  TetR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 206 aa  48.9  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.599329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3089  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 194 aa  48.9  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6254  putative transcriptional regulator, TetR family  44.07 
 
 		 208 aa  48.9  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.0153866 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 184 aa  48.5  0.00006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1456  transcriptional regulator, TetR family  36.92 
 
 		 203 aa  48.5  0.00007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0955  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 212 aa  48.5  0.00007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2294  TetR family regulatory protein  42.19 
 
 		 206 aa  48.5  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1879  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 179 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0257  transcriptional regulator, TetR family  49.09 
 
 		 183 aa  48.5  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.115958 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2102  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 206 aa  48.5  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.526616  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2161  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 206 aa  48.5  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.720901  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7226  putative transcriptional regulator, TetR family  44.78 
 
 		 209 aa  48.1  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.373834 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2214  transcriptional regulator, TetR family  37.68 
 
 		 201 aa  48.1  0.00009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000301704  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4242  transcriptional regulator, TetR family  32.29 
 
 		 200 aa  47.8  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4369  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 204 aa  47.4  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4404  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 213 aa  47.4  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2452  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 228 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 209 aa  47.8  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6268  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 182 aa  48.1  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.700387  normal  0.409486 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2922  transcriptional regulator, TetR family  36.05 
 
 		 204 aa  47.8  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0442  transcriptional regulator, TetR family  32.67 
 
 		 220 aa  47  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.671353  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1365  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 192 aa  47  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2732  TetR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 179 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.748169 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3439  TetR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 239 aa  46.6  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3647  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  32.67 
 
 		 220 aa  47  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0126984  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1699  transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.502572  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0361  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 212 aa  46.6  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.23201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4215  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 269 aa  47  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.261755 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03073  hypothetical protein  32.67 
 
 		 220 aa  47  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.807649  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 242 aa  47.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>