290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0547 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_0547  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 198 aa  402  1e-111  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2214  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 201 aa  106  3e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000301704  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1910  TetR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 207 aa  89.4  3e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0010144  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0936  transcriptional regulator, TetR family protein  32.99 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  39.06 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  39.06 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0464  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 215 aa  54.3  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 211 aa  52  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2504  putative transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 188 aa  52  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0746  TetR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 190 aa  52  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0927  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 191 aa  51.2  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.165233  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0998  transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 		 191 aa  51.2  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000315127  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0794  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 192 aa  50.8  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0156861  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0743  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 192 aa  50.8  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.019038  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0929  transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 		 192 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1215099999999997e-45 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001979  transcriptional regulator TetR family  34.62 
 
 		 193 aa  50.8  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.507988  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0889  transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 		 192 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.760524  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 222 aa  50.8  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0730  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 192 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.110462  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0834  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 191 aa  50.4  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00423826  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 192 aa  50.4  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3092  transcriptional regulator, TetR family  32.95 
 
 		 185 aa  50.1  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0725563 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0066  transcriptional regulator  30 
 
 		 193 aa  50.4  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4445  transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 		 191 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.142911  normal  0.471705 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2319  putative transcriptional regulator, TetR family  26.53 
 
 		 236 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1794  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 218 aa  50.1  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3314  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 214 aa  50.1  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1681  TetR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 216 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.977422 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0091  HTH-type transcriptional regulator, TetR family  30.38 
 
 		 199 aa  49.7  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0787  TetR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 192 aa  49.7  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0101484 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2200  transcriptional regulator, TetR family  24.2 
 
 		 203 aa  49.3  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0026  TetR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 201 aa  49.7  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000327076  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0946  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 223 aa  49.3  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.123031  normal  0.934208 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0999  transcriptional regulator, TetR family  30.16 
 
 		 204 aa  49.3  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372995  normal  0.0457994 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 197 aa  49.3  0.00004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3151  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 202 aa  48.9  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2324  TetR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 217 aa  48.5  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000190708  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1015  transcriptional regulator, TetR family  35.78 
 
 		 201 aa  48.5  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3252  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 200 aa  48.5  0.00006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0871  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 202 aa  48.5  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1897  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 202 aa  48.5  0.00007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0064  transcriptional regulator, TetR family  42.22 
 
 		 242 aa  48.1  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.261244 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0557  TetR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 297 aa  47.8  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2366  TetR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 217 aa  47.8  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.711286  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0612  TetR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 202 aa  47.4  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136679  normal  0.487596 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2543  TetR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 217 aa  47.8  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  35.06 
 
 		 184 aa  47.4  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 231 aa  47.8  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2982  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 232 aa  47.4  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.435152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3104  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 194 aa  47.4  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.428011 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7116  putative transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 183 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101346  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4789  transcriptional regulator  31.88 
 
 		 212 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3684  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 202 aa  46.6  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5559  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 289 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4787  transcriptional regulator, TetR family  31.88 
 
 		 212 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0422575  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5390  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 291 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.787919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1600  TetR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 288 aa  47  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3096  TetR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 202 aa  47  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0203472  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1848  transcriptional regulator, TetR family  26.73 
 
 		 190 aa  46.6  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246548 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24090  transcriptional regulator  28.57 
 
 		 209 aa  47  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 223 aa  47  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0332  TetR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 192 aa  47.4  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00337125  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0355  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 195 aa  46.6  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4255  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 223 aa  47  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.228182 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3358  TetR family transcriptional regulator  23.76 
 
 		 190 aa  46.2  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 201 aa  46.2  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1006  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 189 aa  46.2  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5567  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 290 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 201 aa  46.6  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2371  transcriptional regulator, TetR family  26.73 
 
 		 190 aa  46.6  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0185343  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5288  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 290 aa  46.6  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6397  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 218 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.467706 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5113  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 290 aa  46.6  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5529  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 290 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5130  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 290 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5685  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 290 aa  46.6  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0740  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 205 aa  46.2  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.891023  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1656  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 196 aa  46.2  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0515046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5356  transcriptional regulator, TetR family  38 
 
 		 201 aa  46.6  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4146  transcriptional regulator, TetR family  26.53 
 
 		 246 aa  46.2  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1538  TetR family transcriptional regulator  23.96 
 
 		 222 aa  46.6  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2557  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 217 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15322e-23 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5615  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 291 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 201 aa  46.2  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2545  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 217 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0577985  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0117  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 225 aa  45.8  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.678219 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2282  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 217 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2508  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 217 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5228  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 290 aa  45.8  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0110  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 225 aa  45.8  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2353  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 217 aa  45.8  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.384863  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2815  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 217 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000266483 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3952  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 291 aa  45.8  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0197  hypothetical protein  39.06 
 
 		 197 aa  45.8  0.0004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000319067  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>