282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0657 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0657  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 205 aa  417  1e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.184165  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0332  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 208 aa  57  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  37.84 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  51.11 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  36.49 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 257 aa  55.1  0.0000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4076  putative transcriptional regulator  23.53 
 
 		 204 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.462339  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 209 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3991  regulatory protein TetR  21.57 
 
 		 197 aa  53.1  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0674  transcriptional regulator, TetR family  45.1 
 
 		 200 aa  52.4  0.000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2312  transcriptional regulator, TetR family  25.74 
 
 		 196 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000153851  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47240  putative transcriptional regulator  22.79 
 
 		 204 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3965  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 208 aa  50.1  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1986  TetR family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 196 aa  50.4  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000218655  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  28.4 
 
 		 241 aa  50.1  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1155  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 223 aa  50.1  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.931412 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  32.79 
 
 		 216 aa  49.7  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1968  TetR family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 196 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0105465  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0520  transcriptional regulator, TetR family  26.38 
 
 		 197 aa  49.3  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.711752  normal  0.521102 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  24.83 
 
 		 192 aa  49.3  0.00004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2179  transcriptional regulator, TetR family  26.87 
 
 		 192 aa  48.9  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 219 aa  48.9  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3827  transcriptional regulator, TetR family  23.74 
 
 		 190 aa  48.9  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2014  TetR family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 196 aa  48.5  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0449612  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2169  TetR family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 196 aa  48.5  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000817381  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3766  transcriptional regulator, TetR family  32.93 
 
 		 237 aa  48.5  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2441  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 217 aa  48.5  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.429129  normal  0.59735 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3923  TetR family transcriptional regulator  42 
 
 		 214 aa  48.1  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1290  AcrR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 199 aa  48.1  0.00008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3721  transcriptional regulator, TetR family  31.11 
 
 		 260 aa  48.1  0.00009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249433  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2004  TetR family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 196 aa  48.1  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00390576  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1188  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 193 aa  47.8  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1167  regulatory protein TetR  34.38 
 
 		 220 aa  47.4  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000201787  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4079  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 244 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.780842  normal  0.246764 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1456  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 211 aa  47.4  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1623  transcriptional regulator, TetR family  25.15 
 
 		 205 aa  47.8  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 291 aa  47.8  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0684  transcriptional regulator, TetR family  39.34 
 
 		 197 aa  47  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.84339  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3493  transcriptional regulator, TetR family  39.22 
 
 		 193 aa  47  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.74894  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3297  TetR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 98 aa  46.6  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.368335  normal  0.535572 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0949  transcriptional regulator, TetR family  34.72 
 
 		 286 aa  46.6  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003358  transcriptional regulator  24.84 
 
 		 251 aa  47  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.433364  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  33.96 
 
 		 223 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0096  transcriptional regulator, TetR family  24.09 
 
 		 196 aa  47  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2411  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.147912 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3750  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 230 aa  47  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3170  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 216 aa  46.6  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6854  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 224 aa  47  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.101929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1000  transcriptional regulator, TetR family  23.7 
 
 		 202 aa  47  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  25.22 
 
 		 221 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0117  transcriptional regulator, TetR family  28.7 
 
 		 225 aa  47  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.678219 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3183  transcriptional regulator, TetR family  22.98 
 
 		 220 aa  45.8  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  37.21 
 
 		 194 aa  45.8  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1656  TetR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 196 aa  46.2  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0515046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0091  HTH-type transcriptional regulator, TetR family  26.98 
 
 		 199 aa  45.8  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  36.59 
 
 		 226 aa  46.2  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576002 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7073  transcriptional regulator, TetR family  37.25 
 
 		 248 aa  45.8  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.672487  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0340  transcriptional regulator, TetR family  36.17 
 
 		 388 aa  45.8  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 190 aa  45.8  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 234 aa  45.8  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  22.61 
 
 		 210 aa  45.8  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  36.59 
 
 		 226 aa  45.8  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1640  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 393 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.234723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2914  transcriptional regulator, TetR family  26.73 
 
 		 202 aa  45.4  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0084  TetR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 205 aa  45.4  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2468  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 198 aa  45.4  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 190 aa  45.4  0.0005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4104  TetR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 438 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0719  TetR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 209 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2563  TetR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 192 aa  45.4  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.227827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0429  TetR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 213 aa  45.4  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5318  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 197 aa  45.4  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2156  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 207 aa  45.4  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.362049 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0126  TetR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 224 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4729  TetR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 240 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  22.53 
 
 		 212 aa  45.4  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10159  TetR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 214 aa  45.1  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0787  TetR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 192 aa  45.1  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0101484 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0440  TetR/AcrR family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 203 aa  45.1  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  37.78 
 
 		 194 aa  45.1  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0935  TetR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 199 aa  45.1  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0282  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 201 aa  45.1  0.0007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.356366  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4272  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 191 aa  45.1  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 193 aa  45.1  0.0007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1646  TetR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 233 aa  45.1  0.0008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  40.48 
 
 		 194 aa  45.1  0.0008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2229  TetR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 196 aa  44.7  0.0009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00028806  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  37.21 
 
 		 230 aa  44.7  0.0009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1550  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 201 aa  44.7  0.0009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2330  TetR family transcriptional regulator  21.99 
 
 		 225 aa  44.7  0.0009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.389066  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  38.78 
 
 		 207 aa  44.7  0.0009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3198  TetR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 215 aa  44.7  0.0009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00193732  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3451  TetR family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 216 aa  44.3  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.6413 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1538  TetR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 394 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.112139  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0110  transcriptional regulator, TetR family  28.75 
 
 		 225 aa  44.3  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>