More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCB4264_A2188 on replicon NC_011725
Organism: Bacillus cereus B4264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011725  BCB4264_A2188  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 
194 aa  400  1e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.106219  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2016  TetR family transcriptional regulator  85.49 
 
 
194 aa  341  5e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0982631  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0974  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
194 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0982  TetR family transcriptional regulator  42.33 
 
 
193 aa  170  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0971  TetR family transcriptional regulator  42.33 
 
 
193 aa  170  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0971  TetR family transcriptional regulator  42.33 
 
 
193 aa  170  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1052  TetR family transcriptional regulator  42.33 
 
 
193 aa  170  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1088  transcriptional regulator, TetR family  42.33 
 
 
193 aa  170  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1156  TetR family transcriptional regulator  42.33 
 
 
193 aa  170  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.813518  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1217  transcriptional regulator, TetR family  42.33 
 
 
193 aa  169  3e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1137  transcriptional regulator, TetR family  41.8 
 
 
193 aa  168  5e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4217  transcriptional regulator, TetR family  41.27 
 
 
193 aa  167  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.152492 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3493  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
222 aa  57.4  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.50615  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2540  transcriptional regulator, TetR family  37.29 
 
 
220 aa  56.2  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.34282 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  30.09 
 
 
199 aa  55.5  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3170  transcriptional regulator, TetR family  43.86 
 
 
216 aa  53.1  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  37.68 
 
 
238 aa  53.9  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10920  transcriptional regulator  35.19 
 
 
201 aa  53.1  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0917166  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3721  transcriptional regulator, TetR family  26.8 
 
 
200 aa  52  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  24.73 
 
 
245 aa  51.6  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6216  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 
208 aa  51.6  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
190 aa  51.6  0.000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3705  regulatory protein TetR  29.46 
 
 
201 aa  51.6  0.000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 
190 aa  51.6  0.000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 
209 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24360  transcriptional regulator  26.45 
 
 
211 aa  50.8  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 
211 aa  50.4  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 
211 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  44.07 
 
 
211 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 
211 aa  51.2  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  44.07 
 
 
211 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 
211 aa  50.4  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 
211 aa  50.4  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  34.33 
 
 
224 aa  50.4  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0940  transcriptional regulator  44 
 
 
210 aa  49.7  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00130273  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0411  transcriptional regulator, TetR family  22.04 
 
 
196 aa  50.4  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.3269  hitchhiker  0.00212654 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  24.46 
 
 
219 aa  50.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1613  TetR family transcriptional regulator  25.23 
 
 
189 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.066311 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8152  putative transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 
174 aa  48.5  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.687421 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5638  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 
238 aa  48.5  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.491763  normal  0.336395 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3637  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 
228 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  42.37 
 
 
211 aa  48.1  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0724  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 
224 aa  48.5  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3860  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 
203 aa  48.1  0.00008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.526451  normal  0.667209 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3888  transcriptional regulator, TetR family  34.25 
 
 
206 aa  48.1  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.693202 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1893  transcriptional regulator, TetR family  34 
 
 
196 aa  48.1  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0175452  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6209  transcriptional regulator, TetR family  26.13 
 
 
208 aa  47.8  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5760  putative transcriptional regulator, TetR family  32.73 
 
 
209 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.238463  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0097  transcriptional regulator, TetR family  33.93 
 
 
215 aa  47.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.56928  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3827  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 
216 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14200  transcriptional regulator, TetR family  35.59 
 
 
227 aa  47.4  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000918467  decreased coverage  0.00704922 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5885  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 
203 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0351  TetR family transcriptional regulator  23.91 
 
 
230 aa  47.8  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0168  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 
224 aa  47.8  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.192124 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4896  transcriptional regulator, TetR family  39.68 
 
 
222 aa  47.8  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4115  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
194 aa  47.8  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.1417 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44980  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
216 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3620  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 
203 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1387  TetR family transcriptional regulator  32.2 
 
 
210 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.649854  normal  0.844436 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4295  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 
203 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524256  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2086  putative transcription regulator protein  36.67 
 
 
231 aa  46.6  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  35.85 
 
 
213 aa  47  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5555  putative transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 
260 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.620464  normal  0.438645 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1914  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 
239 aa  46.6  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4336  TetR family transcriptional regulator  32.2 
 
 
210 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.426629 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2237  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 
236 aa  46.6  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0069  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 
219 aa  46.6  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1574  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 
203 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00597987  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5593  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
233 aa  47  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.531399  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0140  TetR family transcriptional regulator  38 
 
 
176 aa  47  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 
222 aa  47  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3548  TetR family transcriptional regulator  31.15 
 
 
216 aa  46.6  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2644  putative transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 
205 aa  47.4  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2308  transcriptional regulator, TetR family  40.38 
 
 
200 aa  46.2  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.594902 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3482  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 
248 aa  46.2  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0660414  normal  0.032442 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2914  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 
202 aa  46.2  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4891  transcriptional regulator, TetR family  33.9 
 
 
261 aa  46.2  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.164408  normal  0.287477 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1592  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 
198 aa  46.2  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3642  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 
227 aa  46.2  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.494269 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2205  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 
202 aa  46.2  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.270822 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0301  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
199 aa  46.2  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0864199  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3892  regulatory protein TetR  28.38 
 
 
214 aa  46.6  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1823  TetR family transcriptional regulator  42.22 
 
 
222 aa  46.2  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5732  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
228 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5353  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
228 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5442  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
228 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2881  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  37.5 
 
 
218 aa  45.8  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.531949 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3066  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  37.5 
 
 
218 aa  45.8  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.283852  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0483  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
225 aa  45.8  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3206  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  37.5 
 
 
218 aa  45.8  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0595  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 
218 aa  45.8  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30540  transcriptional regulator, TetR family  35.85 
 
 
195 aa  45.8  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0659  transcriptional regulator TetR family  31.58 
 
 
196 aa  45.4  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1372  transcriptional regulator, TetR family  32.76 
 
 
210 aa  45.4  0.0005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.487007  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3453  transcriptional regulator, TetR family  33 
 
 
196 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0161587  hitchhiker  4.69207e-17 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6487  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 
195 aa  45.4  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1778  TetR family transcriptional regulator  32.2 
 
 
250 aa  45.4  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.677686  unclonable  0.000000000627047 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3944  putative transcriptional regulator, TetR family  29.23 
 
 
183 aa  45.4  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000137534  hitchhiker  0.00939559 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2041  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 
211 aa  45.4  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4290  transcriptional regulator, TetR family  42.22 
 
 
226 aa  45.4  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000567463  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>