More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2452 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_2452  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 228 aa  473  1e-133  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4199  TetR family transcriptional regulator  85.64 
 
 		 290 aa  362  3e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3734  TetR family transcriptional regulator  66.2 
 
 		 216 aa  291  4e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3807  TetR family transcriptional regulator  66.2 
 
 		 216 aa  291  4e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.225103  normal  0.0640685 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3746  TetR family transcriptional regulator  66.2 
 
 		 216 aa  291  4e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.29443  normal  0.952036 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4604  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 214 aa  97.1  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3386  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 221 aa  77  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0628  TetR family transcriptional regulator  57.89 
 
 		 63 aa  71.6  0.000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.823265 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 184 aa  59.7  0.00000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1253  TetR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000989157 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 217 aa  58.5  0.00000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5615  transcriptional regulator, TetR family  49.02 
 
 		 291 aa  58.5  0.00000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5567  TetR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 290 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5288  TetR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 290 aa  58.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5113  TetR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 290 aa  58.2  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5130  TetR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 290 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5529  transcriptional regulator, TetR family  49.02 
 
 		 290 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5685  TetR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 290 aa  58.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5559  transcriptional regulator, TetR family  47.06 
 
 		 289 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5390  transcriptional regulator, TetR family  47.06 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.787919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5228  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 290 aa  56.6  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6254  putative transcriptional regulator, TetR family  39.58 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.0153866 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3910  TetR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 242 aa  55.8  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.104674 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2426  TetR family transcriptional regulator  53.19 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3952  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 291 aa  54.7  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1709  transcriptional regulator, TetR family  28.7 
 
 		 198 aa  54.3  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2229  TetR family transcriptional regulator  26 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00028806  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 211 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0059  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 194 aa  53.5  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00007304  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0103  transcriptional regulator, TetR family  43.04 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 193 aa  53.9  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2004  TetR family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 196 aa  53.9  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00390576  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2014  TetR family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 196 aa  53.5  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0449612  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1986  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 196 aa  53.1  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000218655  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1968  TetR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 196 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0105465  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2312  transcriptional regulator, TetR family  26.71 
 
 		 196 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000153851  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2169  TetR family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 196 aa  53.5  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000817381  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5175  putative transcriptional regulator, TetR family  42.67 
 
 		 205 aa  53.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0125916  hitchhiker  0.00846982 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3095  transcriptional regulator, TetR family  28.4 
 
 		 192 aa  53.5  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000942813  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2815  TetR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 242 aa  53.1  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4242  transcriptional regulator, TetR family  29.93 
 
 		 200 aa  53.1  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0172  TetR family transcriptional regulator  51.02 
 
 		 208 aa  53.1  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143032  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2666  TetR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 213 aa  52.8  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  25.57 
 
 		 211 aa  52.4  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 219 aa  52.8  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4029  TetR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 196 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  25.57 
 
 		 211 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2175  TetR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 218 aa  52.4  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5607  transcriptional regulator, TetR family  43.08 
 
 		 209 aa  52.4  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.897418  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  25.57 
 
 		 211 aa  51.6  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  25.57 
 
 		 211 aa  51.6  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 332 aa  52  0.000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  38.81 
 
 		 213 aa  51.6  0.000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 211 aa  51.6  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0314  transcriptional regulator, TetR family  41.51 
 
 		 195 aa  51.2  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0848  transcriptional regulator, TetR family  32.05 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000568716  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0750  transcriptional regulator, TetR family  41.07 
 
 		 236 aa  51.2  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0322855 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4734  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 242 aa  50.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47240  putative transcriptional regulator  45.76 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0760  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 192 aa  51.2  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0913287  normal  0.16222 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4215  TetR family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 269 aa  51.2  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.261755 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0557  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 297 aa  51.2  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5636  transcriptional regulator, TetR family  47.06 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.500793 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5045  TetR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.906168  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2044  transcriptional regulator, TetR family  41.33 
 
 		 217 aa  50.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1745  TetR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  26.16 
 
 		 211 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5815  TetR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1792  TetR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.651799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1623  transcriptional regulator, TetR family  46.81 
 
 		 205 aa  50.8  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0987  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 203 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1726  TetR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.379747  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0955  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 212 aa  50.1  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2294  TetR family regulatory protein  35 
 
 		 206 aa  50.1  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4364  TetR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 206 aa  50.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  24.86 
 
 		 211 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7136  transcriptional regulator, TetR family  48.21 
 
 		 237 aa  49.7  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00720754  normal  0.217815 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3604  TetR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 207 aa  50.1  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.461648 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 204 aa  49.7  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1833  regulatory protein, TetR  36.26 
 
 		 236 aa  49.7  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2922  transcriptional regulator, TetR family  40.91 
 
 		 204 aa  50.1  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0384  TetR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 191 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05640  transcriptional regulator  38.6 
 
 		 223 aa  50.1  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.950785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 212 aa  50.1  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0191  transcriptional regulator, TetR family  23.33 
 
 		 243 aa  50.1  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00113557  decreased coverage  0.000257741 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2102  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 206 aa  50.1  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.526616  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2161  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 206 aa  50.1  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.720901  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  36.59 
 
 		 236 aa  50.1  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0635  transcription regulator protein  34.15 
 
 		 216 aa  49.7  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 209 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4467  TetR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 206 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0963408 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4076  putative transcriptional regulator  45.76 
 
 		 204 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.462339  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1145  TetR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 224 aa  49.7  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2768  TetR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 224 aa  49.7  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.379756  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0764  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 204 aa  49.7  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000222329 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0817  TetR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 212 aa  49.3  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1164  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 184 aa  49.7  0.00004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000872016  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8864  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 202 aa  49.7  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2924  TetR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 224 aa  49.7  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.288766  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>