More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7041 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7041  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 224 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.971453 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3273  TetR family transcriptional regulator  45.37 
 
 		 210 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.346529  normal  0.756983 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3896  transcriptional regulator, TetR family  44.17 
 
 		 211 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5327  TetR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 219 aa  79  0.00000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1609  TetR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 224 aa  78.2  0.00000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000193721 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2537  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 231 aa  77  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2444  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 217 aa  75.9  0.0000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3682  TetR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 540 aa  70.9  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0191871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6912  TetR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 236 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.830717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1945  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 225 aa  67.8  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2027  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 208 aa  65.9  0.0000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.835752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1636  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 226 aa  65.5  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3427  transcriptional regulator, TetR family  30.09 
 
 		 216 aa  64.3  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5237  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 233 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.139236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3455  transcriptional regulator, TetR family  29.78 
 
 		 245 aa  63.2  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3915  transcriptional regulator, TetR family  36.13 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4417  transcriptional regulator, TetR family  35.4 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4046  TetR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 222 aa  61.2  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.933953  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3598  TetR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 222 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.822043 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2654  TetR family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 196 aa  60.8  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.136013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4680  transcriptional regulator, TetR family  30.6 
 
 		 236 aa  60.1  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6592  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.186395 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2506  transcriptional regulator, TetR family  26.74 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.733789  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4265  TetR/AcrR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 228 aa  58.5  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.752062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5954  transcriptional regulator TetR family  30.89 
 
 		 219 aa  57  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2959  transcriptional regulator, TetR family  25.73 
 
 		 207 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177797 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24840  putative transcriptional regulator  37.93 
 
 		 185 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2441  TetR family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.21008  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6030  transcriptional regulator TetR family  28.77 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6393  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 229 aa  55.8  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0255151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  30.4 
 
 		 251 aa  55.5  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  32.59 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2105  putative transcriptional regulator  35.63 
 
 		 185 aa  55.1  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3262  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 192 aa  54.7  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00457442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5709  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.92684  normal  0.162375 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1589  TetR family transcriptional regulator  22.02 
 
 		 210 aa  54.7  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5949  transcriptional regulator TetR family  33.33 
 
 		 250 aa  54.3  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2373  transcriptional regulator, TetR family  25.15 
 
 		 207 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5953  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0308427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0120  transcription regulator protein  32.94 
 
 		 209 aa  54.3  0.000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2162  TetR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 207 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.116975  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5073  transcriptional regulator TetR family  28.95 
 
 		 227 aa  53.5  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.479761  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003358  transcriptional regulator  30.69 
 
 		 251 aa  53.9  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.433364  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1548  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 206 aa  54.3  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2242  TetR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 209 aa  53.5  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.640782  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0184  TetR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 335 aa  53.5  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000505732  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2406  TetR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 209 aa  53.5  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1467  hypothetical protein  31.4 
 
 		 213 aa  52.8  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.165444  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2237  TetR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 228 aa  52.8  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2423  transcriptional regulator, TetR family  25.58 
 
 		 207 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0225  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 240 aa  53.1  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.512739 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1544  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 219 aa  53.1  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2176  TetR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 209 aa  52.4  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000096918  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1096  transcriptional regulator, TetR family  30.85 
 
 		 192 aa  52.8  0.000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1605  transcriptional regulator, TetR family  37.68 
 
 		 187 aa  52.4  0.000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  31.73 
 
 		 218 aa  52  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1297  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 206 aa  52  0.000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00583227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3293  regulatory protein TetR  40 
 
 		 208 aa  52  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.147599  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4512  transcriptional regulator, TetR family  34.04 
 
 		 188 aa  52  0.000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.551086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3212  TetR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 211 aa  52  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1240  transcriptional regulator, TetR family  42.42 
 
 		 211 aa  52  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.567777  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4644  transcriptional regulator, TetR family  34.04 
 
 		 188 aa  52  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0446716 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1025  transcriptional regulator, TetR family  32.46 
 
 		 192 aa  51.6  0.000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0566  transcription regulator protein  27.62 
 
 		 207 aa  51.6  0.000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.000000411686  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2219  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 207 aa  51.6  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2695  transcriptional regulator, TetR family  39.74 
 
 		 185 aa  51.2  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000333836  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4201  hypothetical protein  39.34 
 
 		 201 aa  51.2  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0092  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 		 207 aa  51.2  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00302716  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5286  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 196 aa  51.6  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0166031 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6222  transcriptional regulator, TetR family  38.98 
 
 		 186 aa  51.6  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.366462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 227 aa  50.8  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4887  putative TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 191 aa  51.2  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0109337  normal  0.0985913 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1247  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 206 aa  51.2  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 206 aa  51.2  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4695  TetR family transcriptional regulator  24.52 
 
 		 215 aa  51.6  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0756  transcriptional regulator, TetR family  33.91 
 
 		 206 aa  50.8  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0490671  hitchhiker  0.00390743 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2048  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 249 aa  51.2  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 207 aa  51.2  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10080  Transcriptional regulator, TetR family  35.82 
 
 		 217 aa  51.2  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.530554  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1007  transcription regulator protein  30.43 
 
 		 239 aa  50.4  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.605979  normal  0.178446 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4614  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 		 222 aa  50.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2816  TetR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 192 aa  50.8  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3958  transcriptional regulator, TetR family  29.11 
 
 		 242 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5293  TetR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 210 aa  50.4  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  27.73 
 
 		 224 aa  50.4  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1709  TetR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 224 aa  50.4  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.400859  normal  0.0301663 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3457  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 238 aa  50.4  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1333  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 196 aa  50.4  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 291 aa  50.1  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1012  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156612  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1313  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 203 aa  50.4  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4003  transcriptional regulator, TetR family  29.11 
 
 		 242 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30260  transcriptional regulator  33.93 
 
 		 400 aa  49.7  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.473296 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5353  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 228 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5732  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 228 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3823  TetR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 198 aa  49.7  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0524018  normal  0.237924 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>