84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4256 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4256  regulatory protein TetR  100 
 
 		 215 aa  436  1e-121  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.671328  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4575  transcriptional regulator, TetR family  29.7 
 
 		 208 aa  67.4  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.838748 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0176  transcriptional regulator, TetR family  37.78 
 
 		 263 aa  60.1  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0851  TetR family transcriptional regulator  35.46 
 
 		 241 aa  58.5  0.00000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0170  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 233 aa  57  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000323068 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2158  transcriptional regulator, TetR family  47.83 
 
 		 244 aa  57.4  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4071  TetR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 235 aa  53.9  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.365856  normal  0.0686473 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0813  AcrR/TetR family transcription regulator  34.78 
 
 		 227 aa  53.1  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1598  TetR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 239 aa  52  0.000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.235097  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2165  transcriptional regulator, TetR family  30.91 
 
 		 263 aa  50.1  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5705  transcriptional regulator, TetR family  43.08 
 
 		 220 aa  50.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2904  TetR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 213 aa  50.1  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0392  transcriptional regulator, TetR family  47.37 
 
 		 213 aa  50.1  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1807  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 218 aa  49.7  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.237257  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2510  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 245 aa  47.8  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24490  transcriptional regulator  44.07 
 
 		 213 aa  45.8  0.0005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0416  transcriptional regulator, TetR family  44.07 
 
 		 228 aa  45.8  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2226  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 223 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.145555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5749  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 225 aa  45.8  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.147109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5516  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 270 aa  45.4  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.165925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2899  putative DNA-binding transcriptional regulator  45.31 
 
 		 236 aa  45.4  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0077  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 211 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.397741 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2811  putative DNA-binding transcriptional regulator  45.31 
 
 		 236 aa  45.4  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2500  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 234 aa  45.4  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0096  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 211 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0589326 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0087  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 211 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2134  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 212 aa  45.1  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.175968 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4322  transcriptional regulator, TetR family  49.02 
 
 		 242 aa  45.1  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0653  TetR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 239 aa  45.1  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3085  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 215 aa  44.7  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1232  TetR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 218 aa  44.7  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13360  transcriptional regulator, TetR family  40.58 
 
 		 215 aa  44.3  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0417905  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0252  transcriptional regulator, TetR family  43.28 
 
 		 194 aa  44.3  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3949  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 212 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.549729 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0328  putative transcriptional regulator  38.1 
 
 		 222 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1888  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 212 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3284  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 222 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.961661 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3584  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 212 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0928  transcriptional regulator, TetR family  31.54 
 
 		 184 aa  43.5  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312785  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01892  transcription regulator protein  42.11 
 
 		 207 aa  43.9  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00576188  normal  0.449964 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  45 
 
 		 218 aa  43.9  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0744  regulatory protein TetR  47.37 
 
 		 191 aa  43.9  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2681  transcriptional regulator, TetR family  39.73 
 
 		 209 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.387724  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2058  transcriptional regulator, TetR family  36.76 
 
 		 213 aa  43.1  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00904468  normal  0.0313266 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3179  regulatory protein, TetR  46.67 
 
 		 215 aa  43.1  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38090  TetR-family transcriptional regulatory protein  37.68 
 
 		 221 aa  43.1  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0395776  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2249  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 227 aa  42.7  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.111246  normal  0.0445772 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2776  transcriptional regulator, TetR family  40.58 
 
 		 209 aa  42.7  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.376535  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0412  TetR family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 212 aa  42.4  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.417244  normal  0.216002 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4904  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 225 aa  42.4  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0744  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 217 aa  42.4  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3581  TetR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 200 aa  42.4  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.919672  normal  0.194712 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12230  transcriptional regulator  45.31 
 
 		 199 aa  42.4  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1739  tetracycline transcriptional regulator YcdC domain-containing protein  36.76 
 
 		 213 aa  42.4  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 216 aa  42.4  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03010  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 222 aa  42.4  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000381229 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1074  transcriptional regulator, TetR family  36.76 
 
 		 213 aa  42.4  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.739181  hitchhiker  0.00943768 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1190  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 209 aa  42.4  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.106163  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2892  TetR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 227 aa  42  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0741527  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  34.07 
 
 		 201 aa  42  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1713  TetR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 210 aa  42  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.312899  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0468  Transcriptional regulator TetR  44.23 
 
 		 219 aa  41.6  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1929  TetR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 210 aa  41.6  0.008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.434465  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1338  TetR family regulatory protein  43.94 
 
 		 210 aa  41.6  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5106  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 223 aa  42  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0307  TetR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 210 aa  41.6  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.45423  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1185  TetR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 210 aa  41.6  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.193625  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1177  TetR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 210 aa  41.6  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0841  TetR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 210 aa  41.6  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1024  TetR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 210 aa  41.6  0.008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.420909  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2325  TetR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 210 aa  42  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4525  transcriptional regulator, TetR family  38.24 
 
 		 216 aa  41.6  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.397871 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0403  TetR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 204 aa  41.6  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.101074  normal  0.152412 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1086  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 219 aa  41.6  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.535417  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2347  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 223 aa  41.6  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.123383  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0092  transcriptional regulator, TetR family  38.37 
 
 		 207 aa  41.6  0.009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00302716  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5667  TetR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 210 aa  41.6  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0952  TetR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 210 aa  41.6  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0602788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1330  putative DNA-binding transcriptional regulator  43.33 
 
 		 232 aa  41.6  0.009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.745262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3994  TetR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 225 aa  41.6  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2364  TetR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 210 aa  41.6  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2776  TetR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 213 aa  41.6  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.556184  normal  0.492186 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2588  transcriptional regulator, TetR family  51.06 
 
 		 185 aa  41.6  0.01  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3249  transcriptional regulator, TetR family  39.34 
 
 		 233 aa  41.6  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>