89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1650 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1650  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 218 aa  438  9.999999999999999e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3022  TetR family transcriptional regulator  41.87 
 
 		 233 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3748  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 275 aa  162  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7278  Transcriptional regulator  29.73 
 
 		 216 aa  81.3  0.000000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2297  TetR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 305 aa  79.3  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0935054  hitchhiker  0.00257224 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5804  TetR family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 254 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000100556  hitchhiker  0.000892453 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5281  TetR family transcriptional regulator  24.78 
 
 		 257 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3516  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 235 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3533  TetR family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 237 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0909277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4405  TetR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 259 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.630882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5087  TetR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 259 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5773  TetR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 259 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.669739 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5273  TetR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 241 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0264263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3329  transcriptional regulator, TetR family  28.86 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.181798  normal  0.116616 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0132  TetR family transcriptional regulator  22.11 
 
 		 204 aa  57.8  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.410533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3540  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 250 aa  53.5  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5271  transcriptional regulator, TetR family  27.44 
 
 		 223 aa  53.5  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3164  transcriptional regulator, TetR family  34.34 
 
 		 208 aa  52  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.859639  normal  0.0513104 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4909  TetR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 237 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.69589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1538  TetR family transcriptional regulator  23.94 
 
 		 222 aa  50.8  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0727  transcriptional regulator, TetR family  31.86 
 
 		 216 aa  50.8  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3845  transcriptional regulator, TetR family  26.96 
 
 		 209 aa  50.1  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00359694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4604  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 214 aa  48.5  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4936  TetR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 211 aa  48.1  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0908  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 200 aa  47.8  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.376971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4404  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 213 aa  47  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 204 aa  47  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1179  TetR family transcriptional regulator  22.93 
 
 		 290 aa  46.6  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.669252  normal  0.155031 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3378  regulatory protein TetR  31.31 
 
 		 196 aa  46.6  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4043  TetR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 228 aa  46.2  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1291  transcriptional regulator, TetR family  33.05 
 
 		 190 aa  45.4  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.170651  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5109  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 201 aa  45.4  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.313188  normal  0.176776 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3581  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 209 aa  45.1  0.0008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6467  transcriptional regulator, TetR family  23.56 
 
 		 217 aa  45.1  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13066  AsnC family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 246 aa  45.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.117427 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1013  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 209 aa  44.7  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.421012  normal  0.993866 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3775  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 224 aa  44.3  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1382  transcriptional regulator, TetR family  36.49 
 
 		 204 aa  44.7  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.117773  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4242  transcriptional regulator, TetR family  34.72 
 
 		 200 aa  44.7  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2056  TetR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 253 aa  43.5  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.391496 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4112  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 183 aa  43.9  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0592835  normal  0.670519 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1550  transcriptional regulator, TetR family  31.52 
 
 		 209 aa  44.3  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4182  TetR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 201 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.368627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4037  TetR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 446 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.755951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2059  TetR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 173 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.045167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2972  TetR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 216 aa  43.1  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419953  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1149  transcriptional regulator, TetR family protein  24.14 
 
 		 226 aa  43.5  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2703  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 228 aa  43.1  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2653  transcriptional regulator, TetR family  44.68 
 
 		 199 aa  43.5  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0164897  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2013  TetR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 173 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4364  TetR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 206 aa  43.1  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0561  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 197 aa  42.7  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3856  transcriptional regulator, TetR family  31.65 
 
 		 199 aa  43.1  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0438  transcriptional regulator, TetR family  29.32 
 
 		 219 aa  42.7  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275927  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3200  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 224 aa  42.7  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.415485  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3262  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 224 aa  42.7  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.376016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1994  TetR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 173 aa  43.1  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.187018  normal  0.996586 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3209  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 224 aa  42.7  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6808  TetR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 200 aa  42.4  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15710  transcriptional regulator  32.05 
 
 		 221 aa  42.4  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.274511  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4245  regulatory protein, TetR  30.1 
 
 		 221 aa  42.4  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933468  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1550  transcriptional regulator, TetR family  23.91 
 
 		 201 aa  42.4  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1312  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 206 aa  42.4  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.278349  normal  0.387509 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0267  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 217 aa  42.4  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.173198  hitchhiker  0.00351225 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2233  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 187 aa  42  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.749736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5257  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 215 aa  42  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4203  TetR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 216 aa  42  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0570722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5549  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 215 aa  42  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3545  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 192 aa  42  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4290  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 246 aa  42  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.362272  normal  0.446856 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 206 aa  42  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5168  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 215 aa  42  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4244  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 212 aa  42  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7432  transcriptional regulator, TetR family  37.88 
 
 		 216 aa  42  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2558  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 190 aa  42  0.008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6912  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 236 aa  41.6  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.830717  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3836  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 192 aa  41.6  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2048  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 249 aa  41.6  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2986  TetR family transcriptional regulator  23.28 
 
 		 216 aa  41.6  0.009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.741715  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4813  TetR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 223 aa  41.6  0.009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2609  TetR family transcriptional regulator  26 
 
 		 194 aa  41.6  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000163063  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3354  transcriptional regulator, TetR family  38 
 
 		 210 aa  41.6  0.009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.216649  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3995  transcriptional regulator, TetR family  32.05 
 
 		 197 aa  41.6  0.009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200757  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0978  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 199 aa  41.6  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0975  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 199 aa  41.6  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0353361 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0957  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 199 aa  41.6  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.962367  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2817  transcriptional regulator, TetR family  25.17 
 
 		 210 aa  41.6  0.01  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.318929  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0635  transcription regulator protein  34.41 
 
 		 216 aa  41.6  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1978  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 179 aa  41.6  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0203016  normal  0.0208763 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>