146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1574 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_1574  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 435 aa  843    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1944  TetR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 429 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7555  TetR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 414 aa  229  6e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.838529  normal  0.947596 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1763  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 221 aa  70.1  0.00000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1768  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 181 aa  63.2  0.000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0908345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31710  hypothetical protein  35.56 
 
 		 189 aa  60.5  0.00000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.547253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1824  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 203 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0882089  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1871  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 203 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.516108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1805  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 203 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.386636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38620  hypothetical protein  35.43 
 
 		 186 aa  59.3  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6891  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7862  transcriptional regulator, TetR family  37.3 
 
 		 240 aa  56.2  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0504045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2779  transcriptional regulator, TetR family  35.2 
 
 		 185 aa  55.8  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.441306  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3359  transcriptional regulator, TetR family  32.7 
 
 		 192 aa  55.1  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478711  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1610  TetR family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 202 aa  53.9  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3529  TetR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 224 aa  53.9  0.000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10790  hypothetical protein  41.94 
 
 		 207 aa  53.5  0.000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3227  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 204 aa  52.8  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7448  transcriptional regulator, TetR family  34.86 
 
 		 212 aa  52.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.58477 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2264  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 230 aa  50.4  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0218044  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1672  transcriptional regulator, TetR family  33.06 
 
 		 184 aa  50.8  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5148  TetR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 199 aa  50.8  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 205 aa  50.4  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1138  TetR family transcriptional regulator  48 
 
 		 248 aa  50.1  0.00008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4264  transcriptional regulator, TetR family  32.84 
 
 		 189 aa  50.1  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5101  transcriptional regulator, TetR family  34.85 
 
 		 188 aa  50.1  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.375326  normal  0.313411 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2511  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 172 aa  49.3  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2560  transcriptional regulator, TetR family  33.65 
 
 		 225 aa  49.7  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000391327  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4350  TetR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 225 aa  49.7  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4569  TetR family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 203 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.591722  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4657  TetR family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 203 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.287751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4952  TetR family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 203 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.150878 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4477  TetR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 208 aa  48.9  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.47529  normal  0.773196 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1709  transcriptional regulator, TetR family  39.74 
 
 		 195 aa  48.5  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0893  transcriptional regulator, TetR family  35.38 
 
 		 201 aa  48.1  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.17617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0532  transcriptional regulator, TetR family  44.62 
 
 		 207 aa  48.1  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0875801  normal  0.0277044 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5031  TetR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 258 aa  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0201359  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5829  TetR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 258 aa  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1451  transcriptional regulator, TetR family  38.6 
 
 		 428 aa  48.1  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1586  TetR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 215 aa  47.8  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.377059  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1502  transcriptional regulator, TetR family  41.54 
 
 		 241 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1312  regulatory protein, TetR  32.08 
 
 		 241 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406176 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3825  regulatory protein TetR  33.01 
 
 		 203 aa  47.8  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.141016  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1335  transcriptional regulator, TetR family  43.55 
 
 		 194 aa  47.8  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.293374 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19020  transcriptional regulator, TetR family  33.86 
 
 		 197 aa  47.4  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0810  transcriptional regulator, TetR family  39.66 
 
 		 268 aa  47.4  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1497  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 238 aa  47  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.11015  normal  0.986291 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25180  transcriptional regulator PsrA  34.04 
 
 		 233 aa  47.4  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4168  TetR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 244 aa  47.4  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0511823  normal  0.17991 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4362  TetR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 228 aa  47  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0699129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2892  TetR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 207 aa  47  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.39024 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4225  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 234 aa  47  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1102  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 234 aa  47  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2410  transcriptional regulator, TetR family  37.14 
 
 		 214 aa  47.4  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18410  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 181 aa  47  0.0007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.238417 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1277  transcriptional regulator, TetR family  27.85 
 
 		 211 aa  46.6  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0101868  normal  0.0726815 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2904  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 213 aa  46.6  0.0008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4436  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 202 aa  46.6  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0578844 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2153  transcriptional regulator PsrA  34.04 
 
 		 233 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0836  regulatory protein TetR  45.76 
 
 		 197 aa  46.2  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1543  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 238 aa  45.8  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3469  TetR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 258 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07900  hypothetical protein  30.23 
 
 		 186 aa  45.8  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.591065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0161  TetR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 221 aa  46.2  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4557  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 199 aa  46.2  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1337  TetR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 182 aa  45.8  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.143088 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4304  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 187 aa  46.6  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.498529  normal  0.0930958 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4120  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 234 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0096  transcriptional regulator, TetR family  31.9 
 
 		 186 aa  46.2  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1492  putative transcriptional regulator, TetR family  39.24 
 
 		 216 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7752  putative transcriptional regulator, TetR family  54 
 
 		 202 aa  46.6  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3711  transcriptional regulator, TetR family  40.68 
 
 		 207 aa  46.2  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.644349  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4635  regulatory protein, TetR  33.68 
 
 		 226 aa  45.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1061  TetR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 234 aa  45.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.464557  normal  0.383043 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6843  TetR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 236 aa  45.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.163651  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3418  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 234 aa  45.4  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.111441  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0992  TetR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 226 aa  45.1  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000245295 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3465  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 217 aa  45.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4404  TetR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 199 aa  45.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0114676  normal  0.191291 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3681  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 234 aa  45.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3508  regulatory protein, TetR  49.09 
 
 		 200 aa  45.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0988004  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1684  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 235 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.46279  normal  0.0995016 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5279  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 211 aa  45.1  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00504673 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1550  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 209 aa  45.8  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2104  TetR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 191 aa  45.4  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.230608 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2126  transcriptional regulator, TetR family  42.42 
 
 		 204 aa  45.4  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2144  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 235 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0903799 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3871  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 235 aa  45.1  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2617  TetR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 207 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.923721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3598  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 235 aa  45.1  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.153473  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2820  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 211 aa  45.1  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1660  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 235 aa  45.1  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.903697  normal  0.835101 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0377  transcriptional regulator, TetR family  40.68 
 
 		 224 aa  44.7  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.294343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2152  transcriptional regulator, TetR family  34.52 
 
 		 185 aa  44.7  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3685  transcriptional regulator, TetR family  41.51 
 
 		 199 aa  45.1  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1092  transcriptional regulator, TetR family  31.97 
 
 		 205 aa  45.1  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0623718  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1012  transcriptional regulator, TetR family  26.9 
 
 		 212 aa  44.7  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156612  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1339  transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 		 308 aa  44.7  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.752137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3979  transcriptional regulator, TetR family  48.94 
 
 		 203 aa  45.1  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1254  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 223 aa  44.3  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.297921  normal  0.284076 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>