54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0287 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_0287  hypothetical protein  100 
 
 		 150 aa  299  1e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.889476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2143  hypothetical protein  73.83 
 
 		 162 aa  213  5.9999999999999996e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.690061  normal  0.360531 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3109  TetR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 205 aa  75.1  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0137482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 229 aa  54.3  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0775  TetR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 185 aa  53.1  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00421215  hitchhiker  0.000834873 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3954  transcriptional regulator, TetR family  40.54 
 
 		 183 aa  53.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00776564  normal  0.0886939 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3462  regulatory protein TetR  39.47 
 
 		 221 aa  51.2  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0249959  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0040  TetR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 211 aa  49.7  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.970085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0104  TetR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 207 aa  49.7  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000192911 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3985  hypothetical protein  38.24 
 
 		 228 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.997476 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4056  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 209 aa  48.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.910923  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4098  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 315 aa  47.8  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  40.58 
 
 		 218 aa  47  0.00009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0897  transcriptional regulator, TetR family  27.67 
 
 		 265 aa  46.2  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4050  transcriptional regulator, TetR family  40.91 
 
 		 221 aa  45.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0170602 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1040  regulatory protein TetR  56.41 
 
 		 219 aa  45.8  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.591621  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4181  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 240 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.367396  normal  0.615524 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1690  transcriptional regulator, TetR family  44.93 
 
 		 222 aa  45.1  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.072365  hitchhiker  0.0000000604778 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1898  transcriptional regulator, TetR family  30.85 
 
 		 225 aa  44.7  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182667  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0638  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 250 aa  43.9  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2997  transcriptional regulator, TetR family  38.03 
 
 		 239 aa  43.9  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00034517  decreased coverage  0.000048455 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0036  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 234 aa  43.5  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4294  transcriptional regulator, GntR family  42.37 
 
 		 343 aa  43.5  0.0009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3718  transcriptional regulator, TetR family  39.73 
 
 		 223 aa  43.5  0.0009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868131  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2314  transcriptional regulator, TetR family  29.37 
 
 		 213 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.251224 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6384  putative transcriptional regulator, TetR family  39.74 
 
 		 224 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.317451  normal  0.404992 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0460  regulatory protein TetR  28.16 
 
 		 227 aa  43.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.266812  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0664  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 235 aa  42.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.773977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0837  transcriptional regulator, TetR family  35.53 
 
 		 238 aa  42.7  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.895795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3395  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 173 aa  42.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.542573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8156  putative transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 		 272 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4066  putative transcriptional regulator, TetR family  26.58 
 
 		 253 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.546263  normal  0.272387 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3892  transcriptional regulator, TetR family  29.36 
 
 		 211 aa  42.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3376  TetR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 197 aa  42  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423093  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0632  transcriptional regulator, TetR family  36.47 
 
 		 226 aa  42  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.639401  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3353  TetR family transcriptional regulator  24.22 
 
 		 190 aa  42  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.5987 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4137  putative transcriptional regulator, TetR family  38.24 
 
 		 263 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0181128  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2585  transcriptional regulator, TetR family  31 
 
 		 218 aa  42  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106012  normal  0.0213025 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0744  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 224 aa  41.6  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0222814 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1683  TetR family transcriptional regulator  31 
 
 		 197 aa  41.6  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.947535  normal  0.202583 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3085  regulatory protein, TetR  31.82 
 
 		 223 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.355286  normal  0.26404 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2572  transcriptional regulator, TetR family  38.81 
 
 		 239 aa  41.6  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314261  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5556  transcriptional regulator, GntR family  33.82 
 
 		 311 aa  41.2  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3268  putative transcriptional regulator, GntR family  36.76 
 
 		 293 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1167  regulatory protein, TetR  35.29 
 
 		 227 aa  40.8  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10310  transcriptional regulator, tetR family  30.77 
 
 		 230 aa  40.8  0.007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1574  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 258 aa  40.8  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1653  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 248 aa  40.8  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal  0.0709901 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2792  TetR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 190 aa  40.4  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.782155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  41.51 
 
 		 228 aa  40.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2273  transcriptional regulator, TetR family  48.65 
 
 		 224 aa  40.4  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0437  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 239 aa  40.4  0.009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10210  transcriptional regulator  30.14 
 
 		 272 aa  40  0.01  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.472309  normal  0.0650558 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2916  TetR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 216 aa  40  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>