More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2117 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2117  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 362 aa  679    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.583843  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3550  putative transcriptional regulator, TetR family  45.75 
 
 		 374 aa  243  3.9999999999999997e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0101342  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2939  transcriptional regulator, TetR family  45.55 
 
 		 360 aa  240  2.9999999999999997e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0355871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28480  transcriptional regulator  48.68 
 
 		 326 aa  64.7  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.552525 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30610  transcriptional regulator  51.67 
 
 		 201 aa  63.5  0.000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2996  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 237 aa  60.8  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0111  transcriptional regulator, TetR family  46.97 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.482364  normal  0.0755622 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0199  TetR family regulatory protein  38.89 
 
 		 214 aa  58.5  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4364  TetR family transcriptional regulator  42.16 
 
 		 206 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3995  transcriptional regulator, TetR family  53.33 
 
 		 197 aa  57.8  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200757  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0299  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 202 aa  57  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5812  TetR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 188 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0159111 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4215  TetR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 269 aa  57  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.261755 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0046  transcriptional regulator, TetR family  49.25 
 
 		 209 aa  57  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1358  TetR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1116  TetR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.863597  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02063  putative transcription regulator transcription regulator protein  46.27 
 
 		 224 aa  55.8  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0495626  normal  0.936254 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1421  TetR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 190 aa  55.8  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.216023 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2482  transcriptional regulator, TetR family  44.78 
 
 		 196 aa  55.8  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 209 aa  55.8  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1264  TetR family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 206 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.599329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3330  TetR family transcriptional regulator  53.57 
 
 		 225 aa  55.8  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648103  normal  0.907597 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3413  transcriptional regulator, TetR family  45.16 
 
 		 246 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1751  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 206 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1428  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 204 aa  54.7  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.530378  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6341  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 206 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0497044  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5717  transcriptional regulator, TetR family  45 
 
 		 197 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1738  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 206 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0292  TetR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 203 aa  55.5  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000945067 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0116  transcriptional regulator, TetR family  32.91 
 
 		 218 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38090  TetR-family transcriptional regulatory protein  46.15 
 
 		 221 aa  55.1  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0395776  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0882  transcriptional regulator, TetR family  48.21 
 
 		 233 aa  54.3  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2249  transcriptional regulator, TetR family  40.24 
 
 		 228 aa  54.3  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115177  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2291  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 205 aa  53.9  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.857741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1969  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 205 aa  53.9  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0320964 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5045  TetR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 206 aa  53.9  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.906168  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0292  TetR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 203 aa  53.9  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000414466 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5815  TetR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 206 aa  53.9  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  42.22 
 
 		 218 aa  53.5  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4014  transcriptional regulator, TetR family  37.12 
 
 		 225 aa  53.5  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1225  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 208 aa  53.5  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.657492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5693  transcriptional regulator, TetR family  41.3 
 
 		 211 aa  53.5  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0563608  normal  0.866587 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5823  TetR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 217 aa  53.9  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3727  TetR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 203 aa  53.9  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000227076 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6188  TetR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 217 aa  53.9  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.301672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  49.02 
 
 		 206 aa  53.5  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2327  transcriptional regulator, TetR family  42.05 
 
 		 192 aa  53.5  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.48242 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2788  transcriptional regulator, TetR family  43.28 
 
 		 201 aa  53.5  0.000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7734  TetR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 217 aa  53.1  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5275  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 203 aa  53.1  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.398681  normal  0.15306 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5280  TetR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 175 aa  53.1  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0541  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 220 aa  53.1  0.000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3520  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 198 aa  53.1  0.000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.140443 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2556  putative transcriptional regulator, TetR family  32.88 
 
 		 205 aa  53.1  0.000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.596771  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3549  transcriptional regulator AefR  36.59 
 
 		 200 aa  53.1  0.000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.695719  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10440  transcriptional regulator  43.66 
 
 		 211 aa  53.1  0.000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0189255  normal  0.0235057 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4343  transcriptional regulator, TetR family  37.12 
 
 		 225 aa  52.8  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0349599  decreased coverage  0.000000750918 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9154  putative transcriptional regulator, TetR family  46.77 
 
 		 226 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231214  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0781  transcriptional regulator, TetR family  42.37 
 
 		 197 aa  52  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0297  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 203 aa  52  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16280  putative transcriptional regulator  35.96 
 
 		 213 aa  52  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.450776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3578  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 198 aa  52.4  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00935563  normal  0.0256006 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2970  putative transcriptional regulator  40.96 
 
 		 196 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0889426  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3960  TetR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 201 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110455  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0425  transcriptional regulator, TetR family  44.78 
 
 		 195 aa  51.6  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.752712  normal  0.122961 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1537  TetR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 234 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 206 aa  51.6  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2290  TetR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 206 aa  51.6  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.721121  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1866  TetR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 201 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.115406 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6667  TetR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 217 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.33995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0710  transcriptional regulator, TetR family  39.34 
 
 		 248 aa  51.2  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1400  putative transcriptional regulator  34.83 
 
 		 213 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0955  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 212 aa  51.2  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2294  TetR family regulatory protein  45.45 
 
 		 206 aa  51.2  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4577  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 247 aa  51.2  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4577  transcriptional regulator, TetR family  36.47 
 
 		 196 aa  51.2  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.957651 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1864  transcriptional regulator, TetR family  43.94 
 
 		 218 aa  51.2  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3406  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 201 aa  51.2  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.507531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4111  regulatory protein, TetR  34.86 
 
 		 211 aa  51.2  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.856223  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1640  TetR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 216 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.305588 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2102  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 206 aa  51.2  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.526616  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2161  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 206 aa  51.2  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.720901  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 195 aa  50.8  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1492  TetR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 239 aa  50.8  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1936  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 193 aa  50.8  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1810  TetR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 239 aa  50.8  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1736  transcriptional regulator TetR family  43.33 
 
 		 197 aa  50.8  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0796  TetR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 239 aa  50.8  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9073  putative transcriptional regulator, TetR family  42.19 
 
 		 193 aa  50.8  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05790  transcriptional regulator  40.91 
 
 		 215 aa  50.8  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.415819 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0931  transcriptional regulator, TetR family  32.54 
 
 		 215 aa  50.4  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4165  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 198 aa  50.8  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.774051  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0381  TetR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 239 aa  50.8  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2113  TetR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 239 aa  50.8  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.473372  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0479  TetR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 239 aa  50.4  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.676411  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13324  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 221 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.119785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3722  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 202 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  30.9 
 
 		 216 aa  50.4  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3163  putative transcriptional regulator, TetR family  47.06 
 
 		 223 aa  50.4  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3795  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 202 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796114  normal  0.124585 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>