58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_4473 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_4473  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 200 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.228425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1566  regulatory protein TetR  43.67 
 
 		 194 aa  107  9.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0864933  normal  0.704911 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0318  TetR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 198 aa  58.2  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.701446 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4589  TetR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 198 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.447268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4600  TetR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 221 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0411306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4222  TetR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 221 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.42669  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4288  TetR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 221 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.458199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4584  TetR family transcriptional regulator  25.99 
 
 		 198 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.307577 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3234  transcriptional regulator, TetR family  29.49 
 
 		 191 aa  50.8  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05370  transcriptional regulator, TetR family  20.47 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000643211  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2164  regulatory protein, TetR  32.07 
 
 		 209 aa  49.3  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3721  transcriptional regulator, TetR family  32.08 
 
 		 200 aa  49.3  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0106  transcriptional regulator, TetR family  32.94 
 
 		 227 aa  48.5  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4203  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 216 aa  48.1  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0570722  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5086  transcriptional regulator, TetR family  26.29 
 
 		 210 aa  48.1  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423561  normal  0.0707297 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3024  TetR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 197 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3905  transcriptional regulator, TetR family  52.83 
 
 		 194 aa  47.8  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0228  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 201 aa  46.2  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.527328  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  23.68 
 
 		 212 aa  45.8  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 223 aa  45.8  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5157  putative transcriptional regulator, TetR family  31.76 
 
 		 233 aa  45.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23435  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  29.23 
 
 		 222 aa  45.8  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0085  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 219 aa  45.8  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5327  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 219 aa  45.4  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0059  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 197 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.227701 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  20.32 
 
 		 214 aa  44.7  0.0008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0679  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 197 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0686  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 197 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.863349  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5333  transcriptional regulator, TetR family  43.42 
 
 		 216 aa  44.3  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0699  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 197 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.682068  normal  0.380548 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30040  hypothetical protein  33.33 
 
 		 193 aa  44.7  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.000857921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3867  TetR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 225 aa  44.3  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.53155  normal  0.151589 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0239  transcriptional regulator, TetR family  34.15 
 
 		 201 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0220692  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4624  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 197 aa  44.7  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0250  transcriptional regulator, TetR family  34.15 
 
 		 201 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.804071  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08040  transcriptional regulator  32.61 
 
 		 203 aa  43.9  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3285  TetR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 228 aa  42.7  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.678887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5366  transcriptional regulator, TetR family  24.23 
 
 		 210 aa  43.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00158369  normal  0.823764 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6295  transcriptional regulator, TetR family  20.11 
 
 		 212 aa  43.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1914  TetR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 212 aa  43.1  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.183306 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3234  TetR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 228 aa  42.7  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3223  TetR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 228 aa  42.7  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0366  TetR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 232 aa  42.7  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.024079 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0429  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 213 aa  42.4  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0041  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 206 aa  42.4  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.218146 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0353  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 191 aa  42  0.006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000439096  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1317  regulatory protein TetR  32.43 
 
 		 232 aa  42  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 242 aa  42  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4191  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 236 aa  42  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.513173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4112  TetR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 183 aa  42  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0592835  normal  0.670519 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2010  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 184 aa  41.6  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2639  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 211 aa  41.6  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.273159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2056  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 184 aa  41.6  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0828  transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 		 275 aa  41.6  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3860  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 236 aa  41.6  0.008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.195527  normal  0.716599 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3656  TetR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 207 aa  41.6  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.311417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1991  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 184 aa  41.6  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.645683  normal  0.738548 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4373  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 229 aa  41.2  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.335963  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>