159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1851 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1851  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 162 aa  319  9.999999999999999e-87  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3630  transcriptional regulator, TetR family  50.88 
 
 		 203 aa  57.8  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0460373 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2569  TetR family transcriptional regulator  47.5 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.498768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3298  TetR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 206 aa  57  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9138  putative transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 217 aa  53.9  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2723  regulatory protein TetR  45.76 
 
 		 198 aa  53.1  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.769324  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3179  regulatory protein, TetR  43.08 
 
 		 215 aa  52  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6827  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 200 aa  51.6  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0995041 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3296  transcriptional regulator, TetR family  45.28 
 
 		 200 aa  51.2  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2358  transcriptional regulator, TetR family  35.96 
 
 		 216 aa  50.8  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2959  TetR family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 204 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.878802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3003  TetR family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 204 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.384269 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2974  TetR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 204 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.329725  normal  0.021189 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24490  transcriptional regulator  45.45 
 
 		 213 aa  49.3  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2589  transcriptional regulator BetI  29.57 
 
 		 196 aa  48.5  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1637  transcriptional regulator, TetR family  43.06 
 
 		 193 aa  48.5  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.890844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2506  transcriptional regulator, TetR family  45.76 
 
 		 219 aa  48.1  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.368527  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2395  transcriptional regulator, TetR family  42.37 
 
 		 205 aa  48.5  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.431985  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11701  hypothetical protein  40.28 
 
 		 207 aa  48.1  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.107847 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4463  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 198 aa  47.8  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3842  transcriptional regulator BetI  35.29 
 
 		 197 aa  47.8  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3408  TetR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 205 aa  47.4  0.00009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.954504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1834  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 196 aa  47.4  0.00009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.353647 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5183  putative transcriptional regulator, TetR family  40.38 
 
 		 212 aa  47  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0142854 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0914  transcriptional regulatory protein  37.37 
 
 		 210 aa  47  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.626019  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6679  transcriptional regulator, TetR family  30.19 
 
 		 209 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.874837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05640  transcriptional regulator  39.66 
 
 		 223 aa  47  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.950785  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0554  transcriptional regulator BetI  30.95 
 
 		 198 aa  46.2  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02851  putative transcriptional repressor for the cellular response to osmotic stress (TetR/AcrR family) protein  36 
 
 		 186 aa  45.8  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0555  transcriptional regulator BetI  29.21 
 
 		 201 aa  45.8  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2588  transcriptional regulator, TetR family  36.49 
 
 		 185 aa  46.2  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2249  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 227 aa  46.6  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.111246  normal  0.0445772 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0477  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 202 aa  45.8  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1058  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 187 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1074  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 187 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.220175  normal  0.111345 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1085  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 187 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.973817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0565  transcriptional regulator BetI  34.44 
 
 		 202 aa  45.1  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.359685 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1191  TetR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 219 aa  44.7  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00105223  normal  0.516093 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1516  transcriptional regulator BetI  43.4 
 
 		 197 aa  44.7  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.026336  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1513  transcriptional regulator BetI  32.69 
 
 		 198 aa  45.1  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0564912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1561  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 214 aa  45.1  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28140  transcriptional regulator  47.5 
 
 		 216 aa  44.3  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3221  TetR family transcriptional regulator  42 
 
 		 232 aa  44.7  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7752  putative transcriptional regulator, TetR family  40.35 
 
 		 202 aa  44.3  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3937  transcriptional regulatory protein  41.77 
 
 		 210 aa  44.7  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0293  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 230 aa  44.7  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1135  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 206 aa  44.7  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  47.83 
 
 		 223 aa  44.7  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19310  hypothetical protein  41.82 
 
 		 215 aa  44.3  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0818404  normal  0.200215 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5561  transcriptional regulator, TetR family  42.59 
 
 		 196 aa  44.3  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5303  TetR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 210 aa  44.3  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.444335 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70970  transcriptional regulator BetI  35.06 
 
 		 197 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.790986 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2922  transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 		 204 aa  44.3  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6159  transcriptional regulator BetI  35.06 
 
 		 197 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3257  transcriptional regulator, TetR family protein  38.46 
 
 		 195 aa  43.9  0.0009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.696599 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 208 aa  43.9  0.0009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3641  TetR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 200 aa  43.9  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.798229 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4071  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 235 aa  43.9  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.365856  normal  0.0686473 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2610  TetR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 207 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.965658  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4758  TetR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 210 aa  43.9  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.939945 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2654  TetR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 207 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.569555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2640  TetR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 207 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0483  transcriptional regulator BetI  34.62 
 
 		 196 aa  43.5  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0778  transcriptional regulator BetI  40 
 
 		 211 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.576335  normal  0.0961486 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2708  transcriptional regulator BetI  29.76 
 
 		 194 aa  43.5  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4852  TetR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 225 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.651579  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1436  TetR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 125 aa  43.1  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000772402  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0713  transcriptional regulator BetI  30.69 
 
 		 201 aa  42.7  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0124161  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0066  transcriptional regulator  29.35 
 
 		 193 aa  42.7  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0160  transcriptional regulator  37.29 
 
 		 195 aa  43.1  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6134  transcriptional regulator, TetR family  38.64 
 
 		 228 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0948812  normal  0.0489287 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1366  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 235 aa  42.7  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0482522  normal  0.0728361 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5173  TetR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 194 aa  42.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0339  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 213 aa  43.1  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.736532 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3293  transcriptional regulator, TetR family  29.76 
 
 		 200 aa  42.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000151669  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3513  TetR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 195 aa  43.1  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.809024  normal  0.394338 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05966  hypothetical protein  28.92 
 
 		 241 aa  42.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2094  transcriptional regulator, TetR family  34.04 
 
 		 186 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000324065 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3293  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 195 aa  42.4  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0750  transcriptional regulator, TetR family  26.98 
 
 		 236 aa  42.4  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0322855 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6485  regulatory protein, TetR  38.55 
 
 		 278 aa  42.4  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4006  transcriptional regulator, TetR family  31.67 
 
 		 202 aa  42  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  37.18 
 
 		 212 aa  42  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1026  TetR family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 216 aa  42.4  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0175712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5060  transcriptional regulator BetI  33.72 
 
 		 195 aa  42.4  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0255482 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24360  transcriptional regulator  34.85 
 
 		 211 aa  42.4  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27500  transcriptional regulator  35.29 
 
 		 214 aa  42  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1323  transcriptional regulator BetI  30.86 
 
 		 201 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0375  transcriptional regulator BetI  30.77 
 
 		 195 aa  42.4  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0868398 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4321  regulatory protein TetR  32.77 
 
 		 194 aa  42.4  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0684654  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1313  transcriptional regulator BetI  30.86 
 
 		 201 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0372  transcriptional regulator BetI  30.77 
 
 		 195 aa  42.4  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0328  transcriptional regulator BetI  30.77 
 
 		 195 aa  42.4  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0012  transcriptional regulator, TetR family  38.18 
 
 		 207 aa  42  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1965  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 206 aa  42  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0526053  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1349  transcriptional regulator BetI  30.86 
 
 		 201 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.287074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0225  TetR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 240 aa  42  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.512739 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3310  transcriptional regulator BetI  30.77 
 
 		 195 aa  42.4  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0344  transcriptional regulator BetI  30.77 
 
 		 195 aa  42.4  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00272  hypothetical protein  30.77 
 
 		 195 aa  42  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.418668  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>