More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_0300 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_0300  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 184 aa  372  1e-102  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000186865  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4896  TetR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 187 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3267  TetR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 187 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6911  TetR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 187 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4433  TetR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 187 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1938  hypothetical protein  28.98 
 
 		 186 aa  73.6  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3456  transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 		 196 aa  72.8  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.659534  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4967  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 185 aa  72.8  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110994  normal  0.179343 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1949  hypothetical protein  29.14 
 
 		 186 aa  71.6  0.000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1980  TetR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 187 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6861  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 187 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3422  TetR family transcriptional regulator  24.38 
 
 		 187 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0527  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 198 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.18684  normal  0.990571 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0811  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 193 aa  65.5  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2099  transcriptional regulator, TetR family  49.12 
 
 		 216 aa  63.9  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4685  transcriptional regulator, TetR family  27.47 
 
 		 189 aa  63.2  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.26494  hitchhiker  0.000674431 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4458  transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 		 195 aa  63.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4313  TetR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 600 aa  63.5  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0834  transcriptional regulator  32.77 
 
 		 189 aa  62  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0575081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0148  transcriptional regulator  36.19 
 
 		 179 aa  61.2  0.000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3845  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 197 aa  61.2  0.000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0839  transcriptional regulator, TetR family  27.86 
 
 		 196 aa  60.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2113  transcriptional regulator, TetR family  22.95 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.508898 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1777  regulatory protein TetR  22.95 
 
 		 195 aa  60.5  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.731609  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4262  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2163  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0855716  normal  0.614843 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1734  transcriptional regulator, TetR family  22.95 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.390922 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4267  transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 		 189 aa  57  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2740  TetR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 230 aa  57  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0291953  hitchhiker  0.000390237 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2426  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4291  TetR family transcriptional regulator  20.67 
 
 		 189 aa  56.2  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2372  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.74201  normal  0.115149 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4676  transcriptional regulator, TetR family  20 
 
 		 190 aa  55.1  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4040  TetR family transcriptional regulator  22.96 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0312  TetR family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 182 aa  55.1  0.0000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0884  transcriptional regulator, TetR family  47.06 
 
 		 193 aa  54.7  0.0000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0708225  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3482  TetR family transcriptional regulator  22.96 
 
 		 191 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.342598  normal  0.760921 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1133  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 193 aa  54.3  0.0000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4909  TetR/AcrR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 201 aa  54.3  0.0000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.194586  decreased coverage  0.000378041 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1966  TetR family transcriptional regulator  24.19 
 
 		 188 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.273818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10440  transcriptional regulator  30.67 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0189255  normal  0.0235057 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5004  transcriptional regulator, TetR family  23.16 
 
 		 194 aa  53.1  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0270987  normal  0.0251839 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7851  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 165 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4614  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 191 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0571  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 200 aa  53.1  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.530829  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0061  TetR family transcriptional regulator  21.01 
 
 		 187 aa  53.1  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1636  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 200 aa  52.4  0.000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0265  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 200 aa  52.8  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00630944 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0681  transcriptional regulator, TetR family  22.7 
 
 		 167 aa  52.4  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0989844  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1602  transcriptional regulator, TetR family  23.56 
 
 		 191 aa  52.8  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1689  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 195 aa  52.8  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1344  transcriptional regulator, TetR family  22.87 
 
 		 205 aa  51.6  0.000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.592645 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5390  TetR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 189 aa  51.2  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2563  TetR family transcriptional regulator  23.37 
 
 		 192 aa  51.2  0.000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.227827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3547  regulatory protein, TetR  22.73 
 
 		 187 aa  51.2  0.000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.473445  normal  0.21056 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  40.32 
 
 		 307 aa  50.8  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1426  transcriptional regulator, TetR family  21.69 
 
 		 190 aa  50.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.620095 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1025  transcriptional regulator, TetR family  23.17 
 
 		 192 aa  50.4  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2880  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 192 aa  50.1  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.226546 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5603  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 188 aa  49.7  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4094  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 204 aa  48.9  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0325183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6780  TetR family transcriptional regulator  21.64 
 
 		 196 aa  48.5  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.188016 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0424  TetR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 188 aa  48.5  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.652822  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2547  TetR family transcriptional regulator  23.31 
 
 		 196 aa  48.1  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.28213  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4293  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 188 aa  48.1  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0268101  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1720  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 200 aa  48.1  0.00007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3550  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 209 aa  48.1  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.123962  normal  0.200142 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1903  transcriptional regulator, TetR family  46.81 
 
 		 192 aa  48.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0461172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2433  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 211 aa  48.1  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28060  transcriptional regulator  39.13 
 
 		 204 aa  47.8  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.633688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3291  TetR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 195 aa  47.4  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3529  TetR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 224 aa  47.8  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07011  transcriptional regulator  24.81 
 
 		 189 aa  47.4  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0421  transcriptional regulator, TetR family  42 
 
 		 198 aa  47.4  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0587  TetR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 198 aa  47.4  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1620  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 196 aa  47.4  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.0021024  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1776  transcriptional regulator, TetR family  28.36 
 
 		 218 aa  47.4  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0293549  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2297  TetR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 195 aa  47.4  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.299638  hitchhiker  0.00738055 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2270  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 189 aa  46.6  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  45.1 
 
 		 310 aa  47  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4358  regulatory protein, TetR  26.67 
 
 		 220 aa  47  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6164  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 285 aa  47  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0030  TetR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 193 aa  46.6  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.19641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1535  transcriptional regulator, TetR family  38.33 
 
 		 204 aa  47  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3524  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 223 aa  47  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0849134 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  30.77 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 196 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2118  transcriptional regulator, TetR family  36.78 
 
 		 201 aa  46.6  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000195115  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 291 aa  47  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4172  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 205 aa  46.6  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.928216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0085  TetR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 195 aa  46.2  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.0016021  decreased coverage  0.0000722764 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5714  TetR family transcriptional regulator  21.77 
 
 		 188 aa  45.8  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.297365 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4188  TetR family transcriptional regulator  24.06 
 
 		 211 aa  46.2  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5956  TetR family transcriptional regulator  21.85 
 
 		 188 aa  45.8  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.341434  normal  0.49488 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3227  transcriptional regulator, TetR family  25.35 
 
 		 204 aa  46.2  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3932  TetR family transcriptional regulator  18.75 
 
 		 179 aa  46.2  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.324595  normal  0.0870807 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5288  TetR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 290 aa  45.4  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1362  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 211 aa  45.4  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2580  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 211 aa  45.8  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.257801 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3004  transcriptional regulator, TetR family  35.85 
 
 		 186 aa  45.4  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.519568  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>