210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2653 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2653  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 199 aa  387  1e-107  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0164897  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6247  regulatory protein, TetR  48.15 
 
 		 170 aa  137  7e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.133866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1382  transcriptional regulator, TetR family  35.6 
 
 		 204 aa  107  1e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.117773  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2965  regulatory protein, TetR  38.62 
 
 		 192 aa  99  4e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.400188  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2888  regulatory protein TetR  33.85 
 
 		 203 aa  82.4  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5224  TetR family transcriptional regulator  34.54 
 
 		 207 aa  72  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.123106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2247  regulatory protein TetR  33.81 
 
 		 184 aa  63.5  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1420  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0421  transcriptional regulator, TetR family  36.56 
 
 		 198 aa  55.8  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2970  putative transcriptional regulator  36.49 
 
 		 196 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0889426  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2845  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 197 aa  53.5  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.735257  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5717  transcriptional regulator, TetR family  38.24 
 
 		 197 aa  52.8  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2181  regulatory protein TetR  36.36 
 
 		 191 aa  52.8  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.852456  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2508  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 195 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0332011  normal  0.924216 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3578  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 198 aa  52  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00935563  normal  0.0256006 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 202 aa  51.6  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0053  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 188 aa  51.6  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.573004  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4475  transcriptional regulator, TetR family  32.09 
 
 		 205 aa  50.8  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0235  transcriptional regulator, TetR family  33.7 
 
 		 199 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0309861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1736  transcriptional regulator TetR family  37.68 
 
 		 197 aa  49.7  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6288  transcriptional regulator, TetR family  40.98 
 
 		 237 aa  49.7  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3117  transcriptional regulator, TetR family  41.79 
 
 		 204 aa  49.7  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 196 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3548  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 207 aa  49.7  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.842454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 204 aa  49.3  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4341  putative transcriptional regulator, TetR family  38.82 
 
 		 210 aa  48.9  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.13823  normal  0.831003 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2327  transcriptional regulator, TetR family  45.16 
 
 		 192 aa  48.9  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.48242 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3587  TetR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 208 aa  48.5  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.997688  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3444  TetR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 205 aa  48.5  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.349562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3008  transcriptional regulator, TetR family  43.14 
 
 		 280 aa  48.5  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6158  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 212 aa  48.1  0.00009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.488727  normal  0.104212 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8304  transcriptional regulator, TetR family  30.71 
 
 		 223 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.505381  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4654  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 199 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.416931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0511  transcriptional regulator, TetR family  41.54 
 
 		 225 aa  47  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0203  regulatory protein TetR  46.3 
 
 		 186 aa  46.6  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.041689  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3739  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 210 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.461772  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1291  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 190 aa  47  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.170651  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3812  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 210 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.246252 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3751  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 210 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2865  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 254 aa  47  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 195 aa  46.6  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0781  transcriptional regulator, TetR family  34.33 
 
 		 197 aa  46.6  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3783  TetR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 197 aa  47  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.539516 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6667  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 217 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.33995  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2629  transcriptional regulator, TetR family  31.52 
 
 		 212 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000229  transcriptional regulator  30.49 
 
 		 242 aa  46.2  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  39.19 
 
 		 220 aa  46.6  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2305  transcriptional regulator RutR  31.52 
 
 		 212 aa  46.2  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003358  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 251 aa  46.6  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.433364  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1250  transcriptional regulator RutR  31.52 
 
 		 212 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4165  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 198 aa  46.6  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.774051  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3960  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 201 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110455  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2460  transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 214 aa  45.8  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.953634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7226  putative transcriptional regulator, TetR family  47.27 
 
 		 209 aa  46.2  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.373834 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1866  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 201 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.115406 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1997  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 209 aa  45.8  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0474929  normal  0.0514197 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1632  transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 		 239 aa  45.8  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1307  transcriptional regulator, TetR family  41.94 
 
 		 212 aa  45.4  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0245614  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0257  transcriptional regulator, TetR family  34.4 
 
 		 183 aa  45.8  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.115958 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2116  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 192 aa  45.4  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2293  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 204 aa  45.4  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1131  transcriptional regulator RutR  31.52 
 
 		 212 aa  45.4  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.33999  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0097  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 215 aa  45.1  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.56928  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5412  TetR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 212 aa  45.1  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00435132  normal  0.234222 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5823  TetR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 217 aa  45.1  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6188  TetR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 217 aa  45.1  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.301672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2112  transcriptional regulator RutR  32.1 
 
 		 212 aa  45.1  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4583  putative transcriptional regulator, TetR family  41.27 
 
 		 200 aa  45.1  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal  0.302497 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7183  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 219 aa  44.7  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00902217 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0304  transcriptional regulator, TetR family  42.59 
 
 		 210 aa  44.7  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2482  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 196 aa  45.1  0.0008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2165  putative transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 215 aa  44.7  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367605  normal  0.919137 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01016  predicted DNA-binding transcriptional regulator  30.43 
 
 		 212 aa  44.7  0.0009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1019  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 200 aa  44.7  0.0009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2582  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 212 aa  44.7  0.0009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.120721 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1128  transcriptional regulator RutR  30.43 
 
 		 212 aa  44.7  0.0009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1255  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 200 aa  44.3  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7734  TetR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 217 aa  44.3  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5551  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 203 aa  44.3  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.1306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0439  transcriptional regulator, TetR family  37.14 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0795  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 199 aa  44.3  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00985009  normal  0.205797 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2085  transcriptional regulator, TetR family  37.74 
 
 		 210 aa  44.3  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0851  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 241 aa  44.3  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0708  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 244 aa  43.9  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3054  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 126 aa  44.7  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0108952 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2980  TetR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 203 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1636  TetR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 226 aa  44.3  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3839  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 251 aa  44.7  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2556  transcriptional regulator, TetR family  29.35 
 
 		 208 aa  43.5  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000489141  normal  0.182844 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1191  TetR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 219 aa  43.5  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00105223  normal  0.516093 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2179  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 218 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1924  TetR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 189 aa  43.5  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.147097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0425  transcriptional regulator, TetR family  39.34 
 
 		 195 aa  43.9  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.752712  normal  0.122961 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3795  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 202 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796114  normal  0.124585 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3734  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 202 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0165853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0111  transcriptional regulator, TetR family  38.36 
 
 		 207 aa  43.9  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.482364  normal  0.0755622 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13324  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 221 aa  43.9  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.119785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 		 271 aa  43.1  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2089  transcriptional regulator, TetR family  29.95 
 
 		 220 aa  43.5  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0021127  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 205 aa  43.9  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>