71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2965 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2965  regulatory protein, TetR  100 
 
 		 192 aa  376  1e-103  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.400188  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1382  transcriptional regulator, TetR family  39.58 
 
 		 204 aa  107  8.000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.117773  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2653  transcriptional regulator, TetR family  38.62 
 
 		 199 aa  103  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0164897  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2888  regulatory protein TetR  33.86 
 
 		 203 aa  95.5  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5224  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 207 aa  91.3  9e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.123106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6247  regulatory protein, TetR  35.03 
 
 		 170 aa  70.9  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.133866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2247  regulatory protein TetR  35.62 
 
 		 184 aa  62.8  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2308  transcriptional regulator, TetR family  33.03 
 
 		 200 aa  52.8  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.594902 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6173  transcriptional regulator, TetR family  34 
 
 		 202 aa  50.8  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1028  regulatory protein TetR  29.48 
 
 		 262 aa  47.8  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.190494  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0602  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 205 aa  47.4  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5525  normal  0.406937 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0053  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 188 aa  47  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.573004  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0450  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 213 aa  47  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.258482 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0635  transcription regulator protein  31.03 
 
 		 216 aa  45.8  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4029  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 196 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0726  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 201 aa  45.8  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.892311  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6941  transcriptional regulator, TetR family  36.05 
 
 		 221 aa  45.1  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1646  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 233 aa  44.7  0.0009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0429  TetR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 213 aa  43.9  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4006  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 237 aa  44.3  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1942  TetR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 253 aa  43.9  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.338038  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0194  transcriptional regulator, TetR family  42.67 
 
 		 225 aa  44.3  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4287  transcriptional regulator, TetR family  36.19 
 
 		 205 aa  43.5  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0542  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 210 aa  43.5  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.669667 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  32.11 
 
 		 223 aa  43.9  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3200  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 237 aa  43.5  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3411  transcriptional regulator, TetR family  41.54 
 
 		 206 aa  43.5  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.945663  normal  0.0722688 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5885  TetR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 203 aa  43.1  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4404  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 213 aa  43.9  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0992  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 197 aa  43.5  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1819  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 203 aa  43.5  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.191224 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4889  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 198 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.215217 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0855  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 196 aa  43.5  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.179371  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4593  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 198 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.10871  normal  0.699268 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0186  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 203 aa  43.5  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.625871  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0160  transcriptional regulator  27.97 
 
 		 195 aa  43.1  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4506  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 198 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6158  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 212 aa  42.7  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.488727  normal  0.104212 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3711  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 420 aa  42.7  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0336995  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6229  transcriptional regulator TetR family  29.63 
 
 		 240 aa  42.7  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.93873  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13530  transcriptional regulator, TetR family  29.7 
 
 		 186 aa  42.7  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00114254  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4666  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 200 aa  43.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.243183 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1862  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 213 aa  43.1  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.349014  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8304  transcriptional regulator, TetR family  46 
 
 		 223 aa  42.7  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.505381  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1016  TetR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 199 aa  42.4  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.355321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0998  TetR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 199 aa  42.4  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04380  transcriptional regulator, TetR family  39.22 
 
 		 72 aa  42.4  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4094  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 204 aa  42.4  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0325183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1026  TetR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 199 aa  42.4  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3129  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 191 aa  42.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1885  transcriptional regulator, TetR family  42.55 
 
 		 204 aa  42.4  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.393011  normal  0.0927704 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4918  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 193 aa  42.4  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4836  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 193 aa  42.4  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0441  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 233 aa  42.4  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0265  TetR family transcriptional regulator  20.33 
 
 		 200 aa  42.4  0.005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00630944 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0297  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 203 aa  42  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0512572 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3290  transcriptional regulator, TetR family  41.51 
 
 		 225 aa  42  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.413178  normal  0.0802991 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2048  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 249 aa  42  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2973  transcriptional regulator, TetR family  42.62 
 
 		 198 aa  42  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1387  transcriptional regulator, TetR family  32.91 
 
 		 213 aa  42  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1098  TetR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 209 aa  42  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0976848 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3035  transcriptional regulator, TetR family  41.51 
 
 		 225 aa  42  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.489456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3230  transcriptional regulator, TetR family  30.95 
 
 		 191 aa  41.6  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0704446  hitchhiker  0.00000846551 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0395  regulatory protein TetR  30.95 
 
 		 211 aa  41.6  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.796791 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3662  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 191 aa  41.6  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6667  TetR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 217 aa  41.6  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.33995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0466  TetR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 189 aa  41.2  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1231  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 289 aa  41.2  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00074883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  36.76 
 
 		 191 aa  41.2  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0428  transcriptional regulator, TetR family  30.95 
 
 		 211 aa  41.2  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1310  TetR family transcriptional regulator  21.85 
 
 		 182 aa  41.2  0.01  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000104064  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>