83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2247 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_2247  regulatory protein TetR  100 
 
 		 184 aa  349  2e-95  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6247  regulatory protein, TetR  40 
 
 		 170 aa  95.9  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.133866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2653  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 199 aa  71.6  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0164897  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2888  regulatory protein TetR  34.42 
 
 		 203 aa  68.9  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2965  regulatory protein, TetR  37.24 
 
 		 192 aa  67  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.400188  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1382  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 204 aa  64.7  0.0000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.117773  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5224  TetR family transcriptional regulator  34.73 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.123106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0301  transcriptional regulator, TetR family  48.98 
 
 		 199 aa  50.8  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0864199  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 210 aa  49.7  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 207 aa  48.5  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 206 aa  48.1  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1297  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 206 aa  48.1  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00583227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1247  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 206 aa  48.1  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  34.31 
 
 		 219 aa  47.4  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3130  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 216 aa  46.6  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2634  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 209 aa  47  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.001775  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1391  transcriptional regulator, TetR family  45.28 
 
 		 208 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2972  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 216 aa  46.6  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419953  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1313  TetR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 203 aa  47  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2986  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 216 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.741715  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1149  transcriptional regulator, TetR family protein  39.62 
 
 		 226 aa  46.2  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1279  regulatory protein, TetR  39.62 
 
 		 206 aa  46.2  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.211303  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2395  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 423 aa  46.2  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.764783 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5568  transcriptional regulator, TetR family  39.62 
 
 		 414 aa  45.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1828  regulatory protein TetR  32.86 
 
 		 207 aa  45.4  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.790266  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5991  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 244 aa  45.4  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0553876 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3277  TetR family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 188 aa  45.1  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3954  transcriptional regulator, TetR family  42.37 
 
 		 183 aa  45.1  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00776564  normal  0.0886939 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1759  transcriptional regulator, TetR family  25.44 
 
 		 217 aa  45.1  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5866  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 236 aa  45.1  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2878  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 202 aa  45.1  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3983  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 200 aa  44.7  0.0009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1683  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 227 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3661  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 306 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9073  putative transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 193 aa  43.9  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2309  transcriptional regulator, TetR family  40.98 
 
 		 204 aa  43.9  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.601552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5637  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 220 aa  43.9  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.766944 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6105  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 201 aa  44.3  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.93473  normal  0.666323 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0257  TetR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 201 aa  43.1  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.837987 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1022  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 202 aa  43.1  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1959  transcriptional regulator, TetR family  41.25 
 
 		 213 aa  43.5  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0909176  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  45.65 
 
 		 211 aa  43.1  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3873  regulatory protein TetR  33.66 
 
 		 205 aa  43.1  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20280  transcriptional regulator, TetR family  42.65 
 
 		 213 aa  43.5  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.612683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2341  TetR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 206 aa  42.7  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.554096 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6061  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 191 aa  42.4  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.660328  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1742  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 235 aa  42.4  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.666045  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5008  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 201 aa  42.7  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6545  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 227 aa  42.7  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.129926 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5697  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 227 aa  42.7  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.949992  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01665  transcriptional regulator  28.47 
 
 		 202 aa  42.7  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.152407  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4135  TetR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 194 aa  43.1  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3341  transcriptional regulator, TetR family  26.36 
 
 		 226 aa  42.7  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11992  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 406 aa  42.7  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2116  transcriptional regulator, TetR family  42.59 
 
 		 192 aa  42.7  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4042  transcriptional regulator, TetR family  39.73 
 
 		 221 aa  42.4  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.229679  normal  0.106608 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7518  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 185 aa  42.4  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2450  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 213 aa  42.4  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5326  TetR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 218 aa  42.4  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.256565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0992  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 197 aa  42.4  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0136  transcriptional regulator, TetR family  45.28 
 
 		 243 aa  42.4  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.30147  normal  0.0856805 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1986  TetR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 218 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0191052  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4087  transcriptional regulator, TetR family  49.28 
 
 		 228 aa  42.4  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.98142 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 205 aa  42.4  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3058  transcriptional regulator, TetR family  34.55 
 
 		 204 aa  42  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000151008  decreased coverage  0.0000000705144 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3190  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 202 aa  42  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.0000000548437  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3994  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 391 aa  42  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.777734 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1636  TetR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 226 aa  42  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2353  TetR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 217 aa  42  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.384863  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3428  transcriptional regulator, TetR family  27.63 
 
 		 223 aa  42  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0832031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1904  transcriptional regulator, TetR family  40.68 
 
 		 225 aa  42  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.550528  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2659  transcriptional regulator, TetR family  25.4 
 
 		 203 aa  41.6  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.144734  normal  0.0431533 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3704  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 202 aa  41.6  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1833  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 202 aa  41.6  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.150168  normal  0.286062 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2556  putative transcriptional regulator, TetR family  39.06 
 
 		 205 aa  41.6  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.596771  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1216  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 224 aa  41.6  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.187428 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4112  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 183 aa  41.6  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0592835  normal  0.670519 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  35.38 
 
 		 203 aa  41.6  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0161  transcriptional regulator, TetR family  31.37 
 
 		 206 aa  41.2  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1669  TetR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 225 aa  41.2  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0413702  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  27.19 
 
 		 220 aa  40.8  0.01  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0360  transcriptional regulator, TetR family  44.12 
 
 		 215 aa  40.8  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3253  transcriptional regulator  20.83 
 
 		 194 aa  41.2  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0516477  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>