64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2395 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2395  putative transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 110 aa  216  7.999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7019  putative transcriptional regulator, XRE family  45.79 
 
 		 109 aa  87.8  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0999583 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2882  XRE family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 109 aa  86.3  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00173461  normal  0.866875 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8306  transcriptional regulator, XRE family  48.45 
 
 		 107 aa  78.2  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.6083 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1336  helix-turn-helix domain-containing protein  41.94 
 
 		 225 aa  72.4  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1661  helix-turn-helix domain-containing protein  41.94 
 
 		 225 aa  72.4  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.333034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8556  putative transcriptional regulator, XRE family  41.12 
 
 		 106 aa  72  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4345  transcriptional regulator, XRE family  39.13 
 
 		 135 aa  70.5  0.000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0197394  normal  0.880673 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1922  transcriptional regulator, XRE family  45.95 
 
 		 123 aa  68.6  0.00000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.189064  normal  0.0105553 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7015  putative transcriptional regulator, XRE family  40.19 
 
 		 112 aa  68.2  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00989255 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12056  transcriptional regulator  41.05 
 
 		 101 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0627  transcriptional regulator, XRE family  44.93 
 
 		 101 aa  62.8  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.845219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5820  XRE family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 104 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.790408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13205  transcriptional regulator  40.78 
 
 		 109 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000994764  normal  0.452707 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0390  XRE family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 104 aa  60.5  0.000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2429  helix-turn-helix domain-containing protein  46.67 
 
 		 103 aa  58.5  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6666  helix-turn-helix domain protein  32.41 
 
 		 102 aa  55.1  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.384306  normal  0.352226 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5523  helix-turn-helix domain-containing protein  38.2 
 
 		 118 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0720631  hitchhiker  0.0000000329462 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2805  XRE family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 123 aa  50.4  0.000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3835  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 100 aa  48.5  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0528  XRE family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 738 aa  47.4  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.932255  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0718  Cro/CI family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 264 aa  47  0.00008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0726  Cro/CI family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 264 aa  47  0.00008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3798  helix-turn-helix domain-containing protein  39.34 
 
 		 123 aa  46.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000456685  hitchhiker  0.000109219 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1496  XRE family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 110 aa  46.6  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1451  helix-turn-helix domain-containing protein  34.74 
 
 		 127 aa  46.2  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3625  helix-turn-helix domain protein  28.57 
 
 		 103 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0097  putative transcriptional regulator  32.86 
 
 		 114 aa  45.4  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5489  helix-turn-helix domain-containing protein  37.14 
 
 		 124 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.173303  normal  0.332694 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0569  helix-turn-helix domain-containing protein  33.82 
 
 		 263 aa  45.1  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0986  helix-turn-helix domain protein  44.44 
 
 		 124 aa  45.4  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.85534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0424  transcriptional regulator, XRE family  35.56 
 
 		 282 aa  44.7  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2214  hypothetical protein  38.33 
 
 		 103 aa  45.1  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.351958 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3687  helix-turn-helix domain protein  29 
 
 		 103 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1858  XRE family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 100 aa  43.9  0.0007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2518  XRE family transcriptional regulator  36 
 
 		 100 aa  43.9  0.0007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.99787 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12052  transcriptional regulator  39.68 
 
 		 346 aa  43.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.12403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0895  putative transcriptional regulator  28.12 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.652502  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6264  XRE family transcriptional regulator  58.82 
 
 		 188 aa  42.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.0000184029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009516  PsycPRwf_2396  XRE family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3673  helix-turn-helix domain-containing protein  26.61 
 
 		 103 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3648  transcriptional regulator, XRE family  51.11 
 
 		 283 aa  42.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0875  XRE family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 77 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000023095  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2787  transcriptional regulator, XRE family  35.11 
 
 		 99 aa  42.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36660  predicted transcriptional regulator with C-terminal CBS domains  44.44 
 
 		 293 aa  42  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0372485  normal  0.380414 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3316  transcriptional regulator, XRE family  38.89 
 
 		 60 aa  41.2  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000216063  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8282  putative transcriptional regulator, XRE family  29.9 
 
 		 92 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145655  normal  0.802866 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1386  XRE family transcriptional regulator  29 
 
 		 101 aa  41.6  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2818  transcriptional regulator, XRE family  36.07 
 
 		 173 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2293  XRE family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 184 aa  41.6  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.351634 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3281  transcriptional regulator, XRE family  36.07 
 
 		 173 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.871806 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3535  XRE family transcriptional regulator  30 
 
 		 103 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2125  transcriptional regulator, XRE family  36.47 
 
 		 91 aa  40.8  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0743  DNA-binding protein  52.94 
 
 		 80 aa  40.4  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01487  phage N15 gp48-like protein  35.48 
 
 		 94 aa  40.4  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.497667  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0719  DNA-binding protein  52.94 
 
 		 80 aa  40.4  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.196932  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01498  hypothetical protein  35.48 
 
 		 94 aa  40.4  0.007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.573871  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1707  DNA-binding protein  52.94 
 
 		 80 aa  40.4  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1559  DNA-binding protein  52.94 
 
 		 80 aa  40.4  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.810667  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1246  DNA-binding protein  52.94 
 
 		 80 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.578172  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1124  XRE family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 105 aa  40.4  0.008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.969354  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2441  DNA-binding protein  52.94 
 
 		 80 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0444  XRE family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 529 aa  40.4  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.33149 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3859  hypothetical protein  38.89 
 
 		 233 aa  40  0.01  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>