26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13205 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_13205  transcriptional regulator  100 
 
 		 109 aa  213  8e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000994764  normal  0.452707 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7019  putative transcriptional regulator, XRE family  43.12 
 
 		 109 aa  83.2  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0999583 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7015  putative transcriptional regulator, XRE family  46.3 
 
 		 112 aa  76.3  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00989255 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5820  XRE family transcriptional regulator  44.66 
 
 		 104 aa  67.8  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.790408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2882  XRE family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 109 aa  67.4  0.00000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00173461  normal  0.866875 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0390  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 104 aa  64.7  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12056  transcriptional regulator  42.99 
 
 		 101 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8556  putative transcriptional regulator, XRE family  41.07 
 
 		 106 aa  62  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2395  putative transcriptional regulator, XRE family  40.78 
 
 		 110 aa  62.4  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0627  transcriptional regulator, XRE family  42.53 
 
 		 101 aa  57.4  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.845219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6666  helix-turn-helix domain protein  45.92 
 
 		 102 aa  57  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.384306  normal  0.352226 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1922  transcriptional regulator, XRE family  37.37 
 
 		 123 aa  54.3  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.189064  normal  0.0105553 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4345  transcriptional regulator, XRE family  35.71 
 
 		 135 aa  53.5  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0197394  normal  0.880673 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8306  transcriptional regulator, XRE family  36 
 
 		 107 aa  49.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.6083 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0097  putative transcriptional regulator  44.44 
 
 		 114 aa  49.3  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1661  helix-turn-helix domain-containing protein  31.43 
 
 		 225 aa  48.1  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.333034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1336  helix-turn-helix domain-containing protein  31.43 
 
 		 225 aa  48.1  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1480  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  45.45 
 
 		 92 aa  44.3  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.695506 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01498  hypothetical protein  35.11 
 
 		 94 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.573871  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01487  phage N15 gp48-like protein  35.11 
 
 		 94 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.497667  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0569  helix-turn-helix domain-containing protein  43.28 
 
 		 263 aa  42.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5523  helix-turn-helix domain-containing protein  42.05 
 
 		 118 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0720631  hitchhiker  0.0000000329462 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0284  XRE family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.214235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2214  hypothetical protein  36.92 
 
 		 103 aa  41.2  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.351958 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0718  Cro/CI family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 264 aa  40  0.009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0726  Cro/CI family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 264 aa  40  0.009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>