66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0569 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_0569  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 263 aa  538  9.999999999999999e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102394  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0726  Cro/CI family transcriptional regulator  44.08 
 
 		 264 aa  202  4e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0718  Cro/CI family transcriptional regulator  44.08 
 
 		 264 aa  202  4e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0349  hypothetical protein  42.19 
 
 		 163 aa  97.8  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5496  hypothetical protein  39.02 
 
 		 142 aa  90.1  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0466193  normal  0.0701766 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1744  hypothetical protein  38.1 
 
 		 161 aa  87  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0334105  normal  0.364317 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3367  transcriptional regulator  38.13 
 
 		 152 aa  87  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2706  protein of unknown function DUF437  36.8 
 
 		 156 aa  85.9  7e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000206125  hitchhiker  0.00316318 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2299  hypothetical protein  33.33 
 
 		 140 aa  82  0.000000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1163  hypothetical protein  35.77 
 
 		 140 aa  81.3  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0977787  hitchhiker  0.00188932 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0947  protein of unknown function DUF437  39.84 
 
 		 124 aa  80.1  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6600  hypothetical protein  39.52 
 
 		 124 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000859417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3584  hypothetical protein  32.09 
 
 		 146 aa  72.4  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3659  hypothetical protein  29.84 
 
 		 124 aa  71.2  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.114327  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2001  hypothetical protein  31.71 
 
 		 140 aa  68.9  0.00000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000301137  normal  0.09388 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2297  hypothetical protein  28.23 
 
 		 137 aa  62.8  0.000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2429  helix-turn-helix domain-containing protein  42.62 
 
 		 103 aa  56.6  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0063  hypothetical protein  27.27 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.61348  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0097  putative transcriptional regulator  47.89 
 
 		 114 aa  55.8  0.0000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1847  hypothetical protein  29.6 
 
 		 142 aa  53.9  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0895  putative transcriptional regulator  37.5 
 
 		 110 aa  54.3  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.652502  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8074  transcriptional regulator  45.45 
 
 		 95 aa  53.5  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.725371  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2300  GCN5-related N-acetyltransferase  28.28 
 
 		 423 aa  53.5  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.711331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2805  XRE family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 123 aa  52.8  0.000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0231  50S ribosomal protein L22/unknown domain fusion protein  31.51 
 
 		 311 aa  52.4  0.000008  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.415119  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2214  hypothetical protein  42.11 
 
 		 103 aa  50.8  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.351958 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0791  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 91 aa  51.2  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0650  XRE family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 91 aa  50.4  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3798  helix-turn-helix domain-containing protein  40.35 
 
 		 123 aa  49.7  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000456685  hitchhiker  0.000109219 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1909  XRE family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 107 aa  49.3  0.00006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5523  helix-turn-helix domain-containing protein  35.63 
 
 		 118 aa  49.3  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0720631  hitchhiker  0.0000000329462 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0986  helix-turn-helix domain protein  42.11 
 
 		 124 aa  49.3  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.85534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2125  transcriptional regulator, XRE family  44.83 
 
 		 91 aa  48.9  0.00009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5283  hypothetical protein  42.11 
 
 		 131 aa  48.9  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.488524  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0636  transcriptional regulator  42.11 
 
 		 127 aa  48.9  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0039  DNA-binding protein  36.84 
 
 		 95 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.514774  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0099  DNA-binding protein  36.84 
 
 		 95 aa  47.8  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3687  helix-turn-helix domain protein  43.86 
 
 		 103 aa  46.6  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3807  hypothetical protein  36.23 
 
 		 100 aa  46.2  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3625  helix-turn-helix domain protein  44.64 
 
 		 103 aa  45.8  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5489  helix-turn-helix domain-containing protein  46.94 
 
 		 124 aa  45.4  0.0009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.173303  normal  0.332694 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0627  transcriptional regulator, XRE family  41.27 
 
 		 101 aa  45.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.845219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2395  putative transcriptional regulator, XRE family  33.82 
 
 		 110 aa  45.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0590  transcriptional regulator, XRE family  39.66 
 
 		 97 aa  44.3  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0381  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 91 aa  43.9  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1922  transcriptional regulator, XRE family  37.1 
 
 		 123 aa  44.7  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.189064  normal  0.0105553 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2882  XRE family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 109 aa  44.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00173461  normal  0.866875 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2787  transcriptional regulator, XRE family  46.15 
 
 		 99 aa  44.3  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1336  XRE family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 104 aa  44.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40166 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2564  XRE family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 104 aa  44.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229485 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2735  XRE family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 104 aa  44.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000363521 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0647  XRE family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 97 aa  43.9  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.459505 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3673  helix-turn-helix domain-containing protein  42.86 
 
 		 103 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1998  hypothetical protein  29.45 
 
 		 153 aa  43.9  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.951524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1336  helix-turn-helix domain-containing protein  35.48 
 
 		 225 aa  43.9  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3535  XRE family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 103 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1661  helix-turn-helix domain-containing protein  35.48 
 
 		 225 aa  43.9  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.333034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2042  putative cytochrome c  48.15 
 
 		 90 aa  43.5  0.004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0117  putative DNA-binding protein  49.09 
 
 		 105 aa  42.7  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.197061  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13205  transcriptional regulator  43.28 
 
 		 109 aa  42.7  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000994764  normal  0.452707 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0024  DNA-binding protein  41.38 
 
 		 99 aa  42.4  0.007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0874  putative transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 117 aa  42.4  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0010  DNA-binding protein  41.38 
 
 		 99 aa  42.4  0.007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.713803 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0238  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  38.1 
 
 		 199 aa  42.7  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0315  XRE family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 117 aa  42.4  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0773865 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2818  transcriptional regulator, XRE family  35.38 
 
 		 173 aa  42.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>