69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0647 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_0647  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 97 aa  200  6e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.459505 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0590  transcriptional regulator, XRE family  91.75 
 
 		 97 aa  184  2e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1932  transcriptional regulator, XRE family  63.33 
 
 		 91 aa  123  1e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0650  XRE family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 91 aa  105  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0791  transcriptional regulator, XRE family  53.33 
 
 		 91 aa  105  2e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2125  transcriptional regulator, XRE family  56.18 
 
 		 91 aa  102  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1909  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 107 aa  101  3e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0381  XRE family transcriptional regulator  52.22 
 
 		 91 aa  98.6  3e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1858  XRE family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 100 aa  66.2  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2425  transcriptional regulator  44.78 
 
 		 99 aa  58.2  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1386  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 101 aa  58.2  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2735  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 104 aa  56.2  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000363521 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2564  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 104 aa  56.2  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229485 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1336  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 104 aa  56.2  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40166 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11984  transcriptional regulator  34.83 
 
 		 149 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3103  transcriptional regulator, XRE family  40.35 
 
 		 503 aa  50.1  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.597911  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0084  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 109 aa  48.9  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0744  DNA-binding protein  34.29 
 
 		 95 aa  47.8  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0834  XRE family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 107 aa  47.8  0.00005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.259279 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15700  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  41.51 
 
 		 507 aa  47.4  0.00006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.645755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0928  DNA polymerase III delta prime subunit  40 
 
 		 90 aa  47  0.00009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3260  transcriptional regulator, XRE family  40.68 
 
 		 513 aa  46.2  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0795644  normal  0.23679 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0315  XRE family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 117 aa  46.6  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0773865 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0099  DNA-binding protein  30.67 
 
 		 95 aa  46.6  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0718  Cro/CI family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 264 aa  46.6  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0726  Cro/CI family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 264 aa  46.6  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3859  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 93 aa  45.4  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3837  helix-turn-helix domain-containing protein  42.86 
 
 		 81 aa  45.8  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2672  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  38.1 
 
 		 508 aa  45.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0039  DNA-binding protein  30.14 
 
 		 95 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.514774  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0275  cupin 2 domain-containing protein  41.54 
 
 		 188 aa  45.1  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353927  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0529  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 205 aa  44.7  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000109326  normal  0.171352 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17690  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  36.84 
 
 		 517 aa  44.7  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.356525  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1361  EPSP synthase (3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase)  37.74 
 
 		 516 aa  44.7  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.419571  normal  0.53858 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3182  transcriptional regulator, XRE family  37.74 
 
 		 513 aa  44.3  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0470208  hitchhiker  0.000000000985397 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0658  XRE family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 95 aa  43.9  0.0007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0569  helix-turn-helix domain-containing protein  41.07 
 
 		 263 aa  43.9  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5447  XRE family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 103 aa  43.9  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01487  phage N15 gp48-like protein  28.77 
 
 		 94 aa  43.5  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.497667  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01498  hypothetical protein  28.77 
 
 		 94 aa  43.5  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.573871  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3798  helix-turn-helix domain-containing protein  42.86 
 
 		 123 aa  43.5  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000456685  hitchhiker  0.000109219 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2787  transcriptional regulator, XRE family  36.62 
 
 		 99 aa  43.5  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3256  helix-turn-helix domain-containing protein  29.41 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.103023  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4384  transcriptional regulator, XRE family  31.03 
 
 		 108 aa  42.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13300  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  35.09 
 
 		 509 aa  42.4  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.801467  normal  0.209244 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3411  XRE family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 97 aa  42.7  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2042  putative cytochrome c  31.94 
 
 		 90 aa  42.7  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0010  DNA-binding protein  39.29 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.713803 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0024  DNA-binding protein  39.29 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0870  transcriptional regulator, XRE family  48.21 
 
 		 108 aa  42  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0039  transcriptional regulator, XRE family  40.32 
 
 		 377 aa  42  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 176 aa  41.6  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0751  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 179 aa  41.6  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000101746  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0074  hypothetical protein  36.76 
 
 		 94 aa  41.2  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1724  transcriptional regulator, XRE family  36.11 
 
 		 108 aa  41.6  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0282  transcriptional regulator, XRE family  26.67 
 
 		 94 aa  41.2  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3540  transcriptional regulator, XRE family  26.67 
 
 		 94 aa  41.2  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3276  hypothetical protein  40.74 
 
 		 105 aa  40.8  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0117  putative DNA-binding protein  34.18 
 
 		 105 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.197061  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04250  transcriptional regulator  42.86 
 
 		 186 aa  40.8  0.006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0827  XRE family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 116 aa  40.8  0.006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.551431  normal  0.496549 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5139  XRE family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 95 aa  40.8  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2243  transcriptional regulator, XRE family  31.82 
 
 		 112 aa  40.4  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009516  PsycPRwf_2396  XRE family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 100 aa  40.4  0.007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1896  transcriptional regulator, XRE family  35.85 
 
 		 512 aa  40.4  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1361  transcriptional regulator, XRE family  32.88 
 
 		 93 aa  40  0.009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2329  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 100 aa  40.4  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.632323  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2805  XRE family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 123 aa  40  0.01  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5489  helix-turn-helix domain-containing protein  41.07 
 
 		 124 aa  40  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.173303  normal  0.332694 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>