11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_1847 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_1847  hypothetical protein  100 
 
 		 142 aa  292  1e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0726  Cro/CI family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 264 aa  62.4  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0718  Cro/CI family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 264 aa  62.4  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0569  helix-turn-helix domain-containing protein  29.6 
 
 		 263 aa  53.9  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5496  hypothetical protein  29.79 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0466193  normal  0.0701766 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2299  hypothetical protein  28.46 
 
 		 140 aa  50.1  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1744  hypothetical protein  28.24 
 
 		 161 aa  48.1  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0334105  normal  0.364317 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2706  protein of unknown function DUF437  24.22 
 
 		 156 aa  43.5  0.0009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000206125  hitchhiker  0.00316318 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0400  hypothetical protein  28.89 
 
 		 172 aa  43.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.496255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3367  transcriptional regulator  24.83 
 
 		 152 aa  40.8  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0947  protein of unknown function DUF437  25 
 
 		 124 aa  40.4  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>