19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3659 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3659  hypothetical protein  100 
 
 
124 aa  246  1e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.114327  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0947  protein of unknown function DUF437  43.9 
 
 
124 aa  117  7e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1163  hypothetical protein  41.6 
 
 
140 aa  113  8.999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0977787  hitchhiker  0.00188932 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2001  hypothetical protein  35.2 
 
 
140 aa  99.4  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000301137  normal  0.09388 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6600  hypothetical protein  43.09 
 
 
124 aa  97.8  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000859417  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2297  hypothetical protein  41.46 
 
 
137 aa  96.3  1e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0718  Cro/CI family transcriptional regulator  32.8 
 
 
264 aa  81.6  0.000000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0726  Cro/CI family transcriptional regulator  32.8 
 
 
264 aa  81.6  0.000000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0349  hypothetical protein  30.65 
 
 
163 aa  72.8  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0569  helix-turn-helix domain-containing protein  29.84 
 
 
263 aa  71.2  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102394  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2299  hypothetical protein  31.97 
 
 
140 aa  68.2  0.00000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0063  hypothetical protein  30.37 
 
 
147 aa  62.8  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.61348  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5496  hypothetical protein  26.83 
 
 
142 aa  63.5  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0466193  normal  0.0701766 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2706  protein of unknown function DUF437  21.6 
 
 
156 aa  52.8  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000206125  hitchhiker  0.00316318 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3584  hypothetical protein  33.33 
 
 
146 aa  51.6  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0231  50S ribosomal protein L22/unknown domain fusion protein  30.68 
 
 
311 aa  52  0.000003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.415119  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0147  F0F1 ATP synthase subunit alpha  25.41 
 
 
797 aa  50.1  0.000009  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.85768  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1744  hypothetical protein  25.53 
 
 
161 aa  46.6  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0334105  normal  0.364317 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1083  hypothetical protein  25.6 
 
 
138 aa  41.2  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.299063 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>