26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3584 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_3584  hypothetical protein  100 
 
 
146 aa  290  6e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0349  hypothetical protein  40.88 
 
 
163 aa  115  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0947  protein of unknown function DUF437  39.2 
 
 
124 aa  90.9  6e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0726  Cro/CI family transcriptional regulator  35.16 
 
 
264 aa  84.3  4e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0718  Cro/CI family transcriptional regulator  35.16 
 
 
264 aa  84.3  4e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2706  protein of unknown function DUF437  29.37 
 
 
156 aa  82.4  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000206125  hitchhiker  0.00316318 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0569  helix-turn-helix domain-containing protein  32.09 
 
 
263 aa  78.6  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102394  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2297  hypothetical protein  35.16 
 
 
137 aa  78.6  0.00000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5496  hypothetical protein  30.66 
 
 
142 aa  76.3  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0466193  normal  0.0701766 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1163  hypothetical protein  32.8 
 
 
140 aa  74.7  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0977787  hitchhiker  0.00188932 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6600  hypothetical protein  37.4 
 
 
124 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000859417  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1744  hypothetical protein  30.08 
 
 
161 aa  68.9  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0334105  normal  0.364317 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2299  hypothetical protein  34.4 
 
 
140 aa  65.1  0.0000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3367  transcriptional regulator  28.35 
 
 
152 aa  64.3  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3659  hypothetical protein  33.33 
 
 
124 aa  63.2  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.114327  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0063  hypothetical protein  30.22 
 
 
147 aa  62  0.000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.61348  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1998  hypothetical protein  33.58 
 
 
153 aa  61.6  0.000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.951524  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2001  hypothetical protein  33.33 
 
 
140 aa  61.6  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000301137  normal  0.09388 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0231  50S ribosomal protein L22/unknown domain fusion protein  30.71 
 
 
311 aa  58.5  0.00000003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.415119  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0041  hypothetical protein  31.91 
 
 
141 aa  57.4  0.00000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.372109  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1083  hypothetical protein  28.17 
 
 
138 aa  45.4  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.299063 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0076  hypothetical protein  30.99 
 
 
155 aa  45.1  0.0004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1194  hypothetical protein  27.14 
 
 
140 aa  45.1  0.0004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1847  hypothetical protein  28.23 
 
 
142 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0147  F0F1 ATP synthase subunit alpha  25 
 
 
797 aa  43.1  0.001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.85768  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl470  Cro/CI family transcriptional regulator  27.66 
 
 
139 aa  43.1  0.001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00205388  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>