20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3367 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_3367  transcriptional regulator  100 
 
 		 152 aa  307  4e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1744  hypothetical protein  49.65 
 
 		 161 aa  149  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0334105  normal  0.364317 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0569  helix-turn-helix domain-containing protein  38.13 
 
 		 263 aa  87  9e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2706  protein of unknown function DUF437  38.66 
 
 		 156 aa  82.4  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000206125  hitchhiker  0.00316318 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0349  hypothetical protein  33.86 
 
 		 163 aa  80.1  0.000000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5496  hypothetical protein  37.19 
 
 		 142 aa  75.9  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0466193  normal  0.0701766 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2299  hypothetical protein  30.33 
 
 		 140 aa  73.9  0.0000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1163  hypothetical protein  36.29 
 
 		 140 aa  71.6  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0977787  hitchhiker  0.00188932 
 
 
-
 
NC_004310  BR0726  Cro/CI family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 264 aa  67.4  0.00000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0718  Cro/CI family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 264 aa  67.4  0.00000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2001  hypothetical protein  31.4 
 
 		 140 aa  63.9  0.0000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000301137  normal  0.09388 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0947  protein of unknown function DUF437  32 
 
 		 124 aa  62.8  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3584  hypothetical protein  28.35 
 
 		 146 aa  61.6  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6600  hypothetical protein  29.84 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000859417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2297  hypothetical protein  25.53 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0063  hypothetical protein  28.89 
 
 		 147 aa  48.9  0.00003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.61348  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0041  hypothetical protein  25.37 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.372109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1194  hypothetical protein  26.19 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1847  hypothetical protein  24.83 
 
 		 142 aa  40.8  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1998  hypothetical protein  24.16 
 
 		 153 aa  40.4  0.009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.951524  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>