23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2297 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_2297  hypothetical protein  100 
 
 		 137 aa  281  2.0000000000000002e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1163  hypothetical protein  44.63 
 
 		 140 aa  114  6e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0977787  hitchhiker  0.00188932 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2001  hypothetical protein  41.32 
 
 		 140 aa  104  5e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000301137  normal  0.09388 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0947  protein of unknown function DUF437  36.36 
 
 		 124 aa  98.6  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3659  hypothetical protein  41.46 
 
 		 124 aa  96.3  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.114327  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2299  hypothetical protein  39.85 
 
 		 140 aa  90.9  5e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6600  hypothetical protein  36.36 
 
 		 124 aa  85.9  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000859417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5496  hypothetical protein  33.59 
 
 		 142 aa  84.7  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0466193  normal  0.0701766 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0063  hypothetical protein  31.21 
 
 		 147 aa  80.5  0.000000000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.61348  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0349  hypothetical protein  30.65 
 
 		 163 aa  74.7  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1744  hypothetical protein  33.33 
 
 		 161 aa  72.4  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0334105  normal  0.364317 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0076  hypothetical protein  32.23 
 
 		 155 aa  71.2  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3584  hypothetical protein  35.16 
 
 		 146 aa  71.2  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0718  Cro/CI family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 264 aa  67.4  0.00000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0726  Cro/CI family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 264 aa  67.4  0.00000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0569  helix-turn-helix domain-containing protein  28.23 
 
 		 263 aa  62.8  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2706  protein of unknown function DUF437  25 
 
 		 156 aa  63.5  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000206125  hitchhiker  0.00316318 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3367  transcriptional regulator  25.53 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3973  hypothetical protein  31.06 
 
 		 231 aa  47  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0948088 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1998  hypothetical protein  29.92 
 
 		 153 aa  45.1  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.951524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1194  hypothetical protein  27.05 
 
 		 140 aa  41.6  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0231  50S ribosomal protein L22/unknown domain fusion protein  29.82 
 
 		 311 aa  40.8  0.006  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.415119  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2300  GCN5-related N-acetyltransferase  26.32 
 
 		 423 aa  40  0.009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.711331  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>