12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1194 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1194  hypothetical protein  100 
 
 		 140 aa  278  1e-74  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1083  hypothetical protein  65.65 
 
 		 138 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.299063 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0041  hypothetical protein  62.22 
 
 		 141 aa  168  3e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.372109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0956  hypothetical protein  60.9 
 
 		 136 aa  142  2e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00830325  decreased coverage  0.0000302233 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1998  hypothetical protein  42.74 
 
 		 153 aa  92.4  2e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.951524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0947  protein of unknown function DUF437  34.96 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2001  hypothetical protein  28.47 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000301137  normal  0.09388 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1163  hypothetical protein  30.71 
 
 		 140 aa  44.7  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0977787  hitchhiker  0.00188932 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3367  transcriptional regulator  26.19 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2297  hypothetical protein  27.05 
 
 		 137 aa  41.6  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0569  helix-turn-helix domain-containing protein  29.1 
 
 		 263 aa  41.2  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0349  hypothetical protein  42.86 
 
 		 163 aa  40.8  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>