18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1998 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1998  hypothetical protein  100 
 
 
153 aa  308  2e-83  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.951524  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1194  hypothetical protein  42.74 
 
 
140 aa  92.4  2e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0041  hypothetical protein  39.53 
 
 
141 aa  90.5  8e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.372109  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1083  hypothetical protein  45.13 
 
 
138 aa  86.7  1e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.299063 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0956  hypothetical protein  35.94 
 
 
136 aa  69.3  0.00000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00830325  decreased coverage  0.0000302233 
 
 
-
 
NC_004310  BR0726  Cro/CI family transcriptional regulator  34.35 
 
 
264 aa  61.2  0.000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0718  Cro/CI family transcriptional regulator  34.35 
 
 
264 aa  61.2  0.000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0349  hypothetical protein  32.82 
 
 
163 aa  58.5  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3584  hypothetical protein  32.84 
 
 
146 aa  57.4  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6600  hypothetical protein  30.89 
 
 
124 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000859417  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0947  protein of unknown function DUF437  31.71 
 
 
124 aa  48.5  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2297  hypothetical protein  29.92 
 
 
137 aa  45.1  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0569  helix-turn-helix domain-containing protein  29.45 
 
 
263 aa  43.9  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102394  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2706  protein of unknown function DUF437  27.42 
 
 
156 aa  43.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000206125  hitchhiker  0.00316318 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2299  hypothetical protein  25.4 
 
 
140 aa  42.7  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5496  hypothetical protein  29.92 
 
 
142 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0466193  normal  0.0701766 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0063  hypothetical protein  29.11 
 
 
147 aa  40.8  0.006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.61348  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3367  transcriptional regulator  24.16 
 
 
152 aa  40.4  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>