24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0349 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0349  hypothetical protein  100 
 
 		 163 aa  332  1e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3584  hypothetical protein  40.88 
 
 		 146 aa  112  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0569  helix-turn-helix domain-containing protein  42.19 
 
 		 263 aa  97.8  5e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5496  hypothetical protein  38.93 
 
 		 142 aa  97.1  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0466193  normal  0.0701766 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2706  protein of unknown function DUF437  33.08 
 
 		 156 aa  92.4  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000206125  hitchhiker  0.00316318 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0947  protein of unknown function DUF437  37.6 
 
 		 124 aa  89.7  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0726  Cro/CI family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 264 aa  85.1  3e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0718  Cro/CI family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 264 aa  85.1  3e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1163  hypothetical protein  37.5 
 
 		 140 aa  85.1  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0977787  hitchhiker  0.00188932 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6600  hypothetical protein  35.16 
 
 		 124 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000859417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2299  hypothetical protein  32.52 
 
 		 140 aa  83.2  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3367  transcriptional regulator  33.86 
 
 		 152 aa  80.1  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2001  hypothetical protein  30.71 
 
 		 140 aa  77.8  0.00000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000301137  normal  0.09388 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1744  hypothetical protein  30.4 
 
 		 161 aa  75.5  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0334105  normal  0.364317 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2297  hypothetical protein  30.65 
 
 		 137 aa  74.7  0.0000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0063  hypothetical protein  34.9 
 
 		 147 aa  74.7  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.61348  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3659  hypothetical protein  30.65 
 
 		 124 aa  72.8  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.114327  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1998  hypothetical protein  32.82 
 
 		 153 aa  58.5  0.00000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.951524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0147  F0F1 ATP synthase subunit alpha  24.41 
 
 		 797 aa  55.5  0.0000003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.85768  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1083  hypothetical protein  31.25 
 
 		 138 aa  53.5  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.299063 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0231  50S ribosomal protein L22/unknown domain fusion protein  25.23 
 
 		 311 aa  51.2  0.000006  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.415119  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0041  hypothetical protein  30.23 
 
 		 141 aa  48.9  0.00003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.372109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0956  hypothetical protein  38.71 
 
 		 136 aa  45.8  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00830325  decreased coverage  0.0000302233 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1194  hypothetical protein  42.86 
 
 		 140 aa  40.8  0.009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>