23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2001 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2001  hypothetical protein  100 
 
 		 140 aa  290  5e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000301137  normal  0.09388 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1163  hypothetical protein  49.23 
 
 		 140 aa  140  5e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0977787  hitchhiker  0.00188932 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0947  protein of unknown function DUF437  44.35 
 
 		 124 aa  121  3e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2297  hypothetical protein  41.32 
 
 		 137 aa  104  5e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3659  hypothetical protein  35.2 
 
 		 124 aa  99.4  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.114327  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6600  hypothetical protein  40.16 
 
 		 124 aa  99.4  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000859417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0349  hypothetical protein  30.71 
 
 		 163 aa  77.8  0.00000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2706  protein of unknown function DUF437  32.82 
 
 		 156 aa  75.9  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000206125  hitchhiker  0.00316318 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2299  hypothetical protein  36.07 
 
 		 140 aa  75.9  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5496  hypothetical protein  29.93 
 
 		 142 aa  74.7  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0466193  normal  0.0701766 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0569  helix-turn-helix domain-containing protein  31.71 
 
 		 263 aa  68.9  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1744  hypothetical protein  33.59 
 
 		 161 aa  68.2  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0334105  normal  0.364317 
 
 
-
 
NC_004310  BR0726  Cro/CI family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 264 aa  64.3  0.0000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0718  Cro/CI family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 264 aa  64.3  0.0000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3367  transcriptional regulator  31.4 
 
 		 152 aa  63.9  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0063  hypothetical protein  26.09 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.61348  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3584  hypothetical protein  33.33 
 
 		 146 aa  53.9  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0147  F0F1 ATP synthase subunit alpha  30.63 
 
 		 797 aa  51.2  0.000005  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.85768  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0076  hypothetical protein  27.27 
 
 		 155 aa  48.9  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0231  50S ribosomal protein L22/unknown domain fusion protein  30.14 
 
 		 311 aa  47.8  0.00005  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.415119  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0400  hypothetical protein  29.6 
 
 		 172 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.496255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1194  hypothetical protein  28.47 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1083  hypothetical protein  28.57 
 
 		 138 aa  43.5  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.299063 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>