14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1083 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_1083  hypothetical protein  100 
 
 
138 aa  274  2e-73  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.299063 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0041  hypothetical protein  67.65 
 
 
141 aa  191  2e-48  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.372109  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1194  hypothetical protein  65.65 
 
 
140 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0956  hypothetical protein  59.54 
 
 
136 aa  149  1e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00830325  decreased coverage  0.0000302233 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1998  hypothetical protein  45.13 
 
 
153 aa  86.7  1e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.951524  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0947  protein of unknown function DUF437  31.67 
 
 
124 aa  56.6  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0349  hypothetical protein  31.25 
 
 
163 aa  53.5  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1744  hypothetical protein  26.36 
 
 
161 aa  46.6  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0334105  normal  0.364317 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5496  hypothetical protein  29.46 
 
 
142 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0466193  normal  0.0701766 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0063  hypothetical protein  36.36 
 
 
147 aa  45.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.61348  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2706  protein of unknown function DUF437  30.68 
 
 
156 aa  43.5  0.0009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000206125  hitchhiker  0.00316318 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2001  hypothetical protein  28.57 
 
 
140 aa  43.5  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000301137  normal  0.09388 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3584  hypothetical protein  27.66 
 
 
146 aa  41.2  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3659  hypothetical protein  25.6 
 
 
124 aa  41.2  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.114327  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>