22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0063 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0063  hypothetical protein  100 
 
 		 147 aa  300  3.0000000000000004e-81  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.61348  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2299  hypothetical protein  40.15 
 
 		 140 aa  99  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2297  hypothetical protein  31.21 
 
 		 137 aa  80.5  0.000000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0349  hypothetical protein  34.9 
 
 		 163 aa  74.7  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5496  hypothetical protein  29.79 
 
 		 142 aa  67.4  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0466193  normal  0.0701766 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3659  hypothetical protein  30.37 
 
 		 124 aa  62.8  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.114327  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0947  protein of unknown function DUF437  32.09 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1163  hypothetical protein  28.26 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0977787  hitchhiker  0.00188932 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3584  hypothetical protein  30.22 
 
 		 146 aa  57.4  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0569  helix-turn-helix domain-containing protein  27.27 
 
 		 263 aa  56.6  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6600  hypothetical protein  25.19 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000859417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2706  protein of unknown function DUF437  24.64 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000206125  hitchhiker  0.00316318 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2001  hypothetical protein  26.09 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000301137  normal  0.09388 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1744  hypothetical protein  30.3 
 
 		 161 aa  52.8  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0334105  normal  0.364317 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0076  hypothetical protein  30.95 
 
 		 155 aa  50.4  0.000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3367  transcriptional regulator  28.89 
 
 		 152 aa  48.9  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0718  Cro/CI family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 264 aa  46.2  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1083  hypothetical protein  36.36 
 
 		 138 aa  45.8  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.299063 
 
 
-
 
NC_004310  BR0726  Cro/CI family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 264 aa  46.2  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0041  hypothetical protein  32.95 
 
 		 141 aa  45.4  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.372109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0956  hypothetical protein  30.59 
 
 		 136 aa  41.6  0.004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00830325  decreased coverage  0.0000302233 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1998  hypothetical protein  29.11 
 
 		 153 aa  40.8  0.006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.951524  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>